Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 101 Aligned Residues 371 % Identity 17% Template d3dhpa2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.50

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.								.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																																.																							.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.																							.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	.	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	.	.	.	.	.	.	.	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D
Query Conservation																																.																							.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																							.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template Sequence		R	T	S	I	V	H	L	F	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	W	V	D	I	A	L	E	C	E	R	Y	L	A	P	K	G	F	G	G	V	Q	V	S	P	P	N	E	N	V	A	I	H	N	P	F	R	P	W	W	E	R	Y	Q	P	V	S	.	Y	K	L	C	T	R	S	G	N	E	D
Template Known Secondary structure									T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	T	T	T	T										S		B	B			T	T	T	T	S		G	G	G	G	G	S	B	S		.	S		S		B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.												20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.		.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.		.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	.	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y
Query Conservation																																						.
Alig confidence																																						.
Template Conservation
Template Sequence		E	F	R	N	M	V	T	R	C	N	N	V	G	V	R	I	Y	V	D	A	V	I	N	H	M	C	G	N	A	V	S	A	G	T	S	S	T	C	G	S	Y	F	N	P	G	S	R	D	F	P	A	V	P	Y	S	G	A	D	F	N	D	G	K	C	K	T	G	S	G	D	I	E	N	Y	N	D	A	T	Q	V
Template Known Secondary structure													T	T										S					T	T	S		S	B	S		B	T	T				B	B	G	G	G	T	B	B	T	T	T	T	B		G	G	G	B		T	T	T			S	S	S	S	B				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	D	C	R	L	S	G	L	L	D	L	A	L	G	K	D	Y	V	R	S	K	I	A	E	Y	M	N	H	L	I	D	I	G	V	A	G	F	R	I	D	A	S	K	H	M	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	I	K	A	I	L	D	K	L
Template Known Secondary structure				S	B	G	G	G				B		T	T	S																		T							T	T	G	G	G	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		241	.	.	.									.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	T	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.																														.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.																														.	.	.	.
Template Sequence		H	N	L	N	S	N	W	F	P	E	G	S	K	P	F	I	Y	Q	E	V	I	D	L	G	G	E	P	I	K	S	S	D	Y	F	G	.	.	.	N	G	R	V	T	E	F	K	Y	G	A	K	L	G	T	V	I	R	K	W	N	G	E	K	M	S	A	L	K	.	.	.	.	N	W	G	E	G	A	G	F	M
Template Known Secondary structure						T	T	T	S		T	T													S	S	S	S			G	G	G	G	T	T	.	.	.	T	S																	T		T	T			G	G	G	G	G	.	.	.	.	G		S	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.																														.	.	.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.				250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.					.	280	.	.	.	.	.	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.			340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.																	.
Query SS confidence																													.	.																	.
Query Sequence		N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	.	.	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	.	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A
Query Conservation																													.	.																	.
Alig confidence																													.	.																	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	D	R	A	L	V	F	V	D	N	H	D	N	Q	R	G	H	G	A	G	G	A	S	I	L	T	F	A	D	A	R	L	Y	K	M	A	V	G	F	M	L	A	H	P	Y	G	F	T	R	V	M	S	S	Y	R	W	P	R	Y	F	E	N	G	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T	T					S			T	T	G	G	G	T		T	T			T	T				G	G	G														S		S	S								B								T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.
		390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	D	W	V	G	P	P	N	D	N	G	V	T	K	E	V	T	I	N	P	D	T	T	C	G	N	D	W	V	C	E	H	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	I	R	N	M	V	N	F	R	N	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T			S	S			T	T							B		T	T	S		B		T	T	B			G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																					354	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.														.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400