Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 97 Aligned Residues 329 % Identity 19% Template d1ua7a2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 2.21

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		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.											.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Q	N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	S	G	T	I	L	H	A	.	.	.	.	W	N	.	.	.	.	.	.	.	W	S	F	N	T	L	K	H	N	M	K	D	I	H	D	A	G	Y	T	A	I	Q	T	S	P	I	N	Q	V	K	E	G	N	Q	G	D	K	S	M	S	N	W	Y	W	L	Y	Q	P	T	S	Y	Q	I	G	N	R	Y	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	S						.	.	.	.	T	T	.	.	.	.	.	.	.	B								T							T	T		S													T	G	G	G			B	G	G	G	G	G	G	G	G										T	T	T
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.					.	.								.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	L	D	D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	T	E	Q	E	F	K	E	M	C	A	A	A	E	E	Y	G	I	K	V	I	V	D	A	V	I	N	H	T	T	F	D	Y	A	A	I	S	N	E	V	K	S	.	.	.	I	P	N	W	T	H	G	N	T	Q	I	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	W	S	D	R
Template Known Secondary structure																T	T	T										S	B			S		T	T	T	S						T	.	.	.	S	T	T							B			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		75	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.				.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	130	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N
Query Conservation
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	D	V	T	Q	N	S	L	L	G	L	Y	D	W	N	T	Q	N	T	Q	V	Q	S	Y	L	K	R	F	L	E	R	A	L	N	D	G	A	D	G	F	R	F	D	A	A	K	H	I	E	L	P	D	D	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	S	Q	F	W
Template Known Secondary structure							S	B	B	T	T	B					T	T	S																	T	T							T	T	G	G	G	S			T	T	S	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G			S
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	190	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	D	V	F	T	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H	N	V	A	W	N
Query Conservation
Alig confidence																																.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	N	I	T	N	T	S	A	E	F	Q	Y	G	E	I	L	Q	D	S	A	S	R	D	A	A	Y	A	N	Y	M	.	D	V	T	A	S	N	Y	G	H	S	I	R	S	A	L	K	N	R	N	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	S	N	I	S	H	Y	A	S	D	V	S	A	D	K	L
Template Known Secondary structure					T		S	S		S									S	T	T								T	T	S	.																		T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S		S	S	S	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		195	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.		.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.													.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D
Query Conservation
Alig confidence																							.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	T	W	V	E	S	H	D	T	Y	A	N	D	D	E	E	S	T	W	M	S	.	D	D	D	I	R	L	G	W	A	V	I	A	S	R	S	G	S	T	P	L	F	F	S	R	P	E	G	G	G	N	G	V	R	F	P	G	K	S	Q	I	G	D	R	G	S	A	L	F	E	D	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S							S	T	T		S	S	T	T			.													T	S	S	S	S									T	T		B	T	T	B	S			S	S		B	T	B	S				G	G	G	G		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.		.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	I	T	A	V	N	R	F	H	N	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																													333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.