Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 98 Aligned Residues 351 % Identity 17% Template d1jaea2 SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.65

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.						.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	.	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	.	.	.	.	.	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D	D	F
Query Conservation																																.																							.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.																							.	.	.	.	.									.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template Sequence		R	N	S	I	V	H	L	F	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	W	N	D	I	A	D	E	C	E	R	F	L	Q	P	Q	G	F	G	G	V	Q	I	S	P	P	N	E	Y	L	V	A	D	G	R	P	W	W	E	R	Y	Q	P	V	S	.	Y	I	I	N	T	R	S	G	D	E	S	A	F
Template Known Secondary structure									T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	T	T	T	T										S		B	B			T	T			G	G	G	G	G	S	B			.	S		S			T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.												20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.		.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y	L	H	L
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	D	M	T	R	R	C	N	D	A	G	V	R	I	Y	V	D	A	V	I	N	H	M	T	G	M	N	G	V	G	T	S	G	S	S	A	D	H	D	G	M	N	Y	P	A	V	P	Y	G	S	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	H	S	P	C	E	V	N	N	Y	Q	D	A	D	N	V	R	N	C
Template Known Secondary structure											T	T										S	B			S	S				B	T	T	S				B	T	T	T	T	B	B	T	T	T	T	B		G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B					B				T	T								S
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.										130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V	F	T	P
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	V	G	L	R	D	L	N	Q	G	S	D	Y	V	R	G	V	L	I	D	Y	M	N	H	M	I	D	L	G	V	A	G	F	R	V	D	A	A	K	H	M	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	S	V	I	F	S	G	L	K	N	L
Template Known Secondary structure		B	B	T	T	B		B	B		T	T	S																	T	T							T	T	G	G	G	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		244										.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H	N	V
Query Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	D	Y	G	F	A	D	G	A	R	P	F	I	Y	Q	E	V	I	D	L	G	G	E	A	I	S	K	N	E	Y	T	G	F	.	.	.	G	C	V	L	E	F	Q	F	G	V	S	L	G	N	A	F	Q	G	G	N	Q	L	K	N	L	A	N	.	.	.	.	.	.	W	G	P	E	W	G	L	L	E	G
Template Known Secondary structure			G	G	G	T			T	T													S	S	S	S			G	G	G	T	T	T	S	.	.	.	S																T	T	T	S		G	G	G	G	G	G	.	.	.	.	.	.		S	G	G	G	T				G
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.				240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.							.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.		.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.
Query SS confidence																																											.
Query Sequence		A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	.	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N
Query Conservation																																											.
Alig confidence																			.																								.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	D	A	V	V	F	V	D	N	H	D	N	Q	R	T	G	G	.	S	Q	I	L	T	Y	K	N	P	K	P	Y	K	M	A	I	A	F	M	L	A	H	P	Y	G	T	T	R	I	M	S	S	F	D	F	T	D	N	D	Q	G	P	P	Q	D	G	S	G	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G					S			T	T					S		.	T	T				T	T	S														S		S	S								B			S	S	T	T					B		T	T	S		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.		.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	S	P	G	I	N	D	D	N	T	C	S	N	G	Y	V	C	E	H	R	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	V	Y	G	M	V	G	F	R	N	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S				T	T	B			G	G	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																											344	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.