Job Description P28904 Confidence 98.68% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 116 Aligned Residues 282 % Identity 15% Template d1eswa_ SCOP info TIM beta/alpha-barrel (Trans)glycosidases Amylase, catalytic domain Resolution 1.90

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																			.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	.	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																			.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	L	L	H	P	T	S	L	P	G	P	Y	G	V	G	V	L	G	R	E	A	R	D	F	L	R	F	L	K	E	A	G	G	R	Y	W	Q	V	L	P	L	G	P	T	G	Y	G	D	S	P	Y	Q	S	F	S	A	F	A	G	N	P	Y	L	I	D	L	R	P	L	A	E	R	G	Y	V	R	L	E	D	P
Template Known Secondary structure						G	G	G	S			S	S	S	S			S	S													T	T										S		B		T	T			T	T	S	B	S		S	S				G	G	G			S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	F	P	Q	G	R	V	D	Y	G	L	L	Y	A	W	K	W	P	A	L	K	E	A	F	R	G	F	K	E	K	A	S	P	E	E	R	E	A	F	A	A	F	R	E	R	E	A	W	W	L	E	D	Y	A	L	F	M	A	L	K	G	A	H	G	G	L	P	W	N	R	W	P	L	P	L	R	K	R	E	E
Template Known Secondary structure					S	S	B																																																									T	T	T			G	G	G	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
																												82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.												.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Template Conservation																																																		.												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	L	R	E	A	K	S	A	L	A	E	E	V	A	F	H	A	F	T	Q	W	L	F	F	R	Q	W	G	A	L	K	A	E	A	E	A	L	G	I	R	I	I	G	D	M	P	I	.	F	V	A	E	D	S	A	E	V	W	A	.	.	.	.	.	.	.	H	P	E	W	F	H	L	D	E	E	G	R	P
Template Known Secondary structure											T																												T	T									S	.	S			S	S	S						.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	B		B		T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure																																																		.												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.		.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.								.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
						132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Sequence		T	V	V	A	G	V	P	P	D	Y	F	S	E	T	G	Q	R	W	G	N	P	L	Y	R	W	D	V	L	E	R	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	S	F	W	I	R	R	L	E	K	A	L	E	L	.	F	H	L	V	R	I	D	H	F	R	G	F	E	A
Template Known Secondary structure		S									S	S		S	S									B								T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T														.		S						T	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.		.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V	F	T	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.																																																							.	.
Template Conservation																						.	.	.	.																																																							.	.
Template Sequence		Y	W	E	I	P	A	S	C	P	T	A	V	E	G	R	W	V	K	A	P	.	.	.	.	G	E	K	L	F	Q	K	I	Q	E	V	F	G	E	V	P	V	L	A	E	D	L	G	V	I	T	P	E	V	E	A	L	R	D	R	F	G	L	P	G	M	K	V	L	Q	F	A	F	D	D	G	M	E	N	.	.
Template Known Secondary structure							T	T		S	S	S	T	T								.	.	.	.													S	S								T	T													T	T							G	G	G	S	S	S	S		T	T		.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.																																																							.	.
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320					.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H	N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	F	L	P	H	N	Y	P	A	H	G	R	V	V	V	Y	T	G	T	H	D	N	D	T	T	L	G	W	Y	R	T	A	T	P	H	E	K	A	F	M	A	R	Y	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	G	G	G	S		T	T							S			T	T	S										S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.