Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 468 % Identity 25% Template c3czkA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:sucrose hydrolase; PDBTitle: crystal structure analysis of sucrose hydrolase(suh) e322q-2 sucrose complex Resolution 2.20 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10			.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.			.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.																																																				.	.
Query SS confidence										.	.																																																				.	.
Query Sequence		H	L	P	H	W	W	Q	N	.	.	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	.	.	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G
Query Conservation										.	.																																																				.	.
Alig confidence										.	.													.	.	.	.	.	.	.																																	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	H	A	G	W	F	G	Q	P	H	M	L	G	Y	S	A	Y	A	D	R	F	A	.	.	.	.	.	.	.	G	T	L	Q	G	V	A	E	R	V	P	Y	L	Q	E	L	G	V	R	Y	L	H	L	L	P	F	L	R	A	R	A	G	D	N	D	G	G	F	A	V	S	D	Y	G	Q	V	E	P	S	L	G
Template Known Secondary structure		S		T	T	G	G	G	S	T	T													.	.	.	.	.	.	.	S	S							T								T		S												S	S			T	T	T	T	S									T	T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.								.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.						.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.
Query Sequence		T	L	D	D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	.	.	.	.	.	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.
Alig confidence																																																										.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	N	D	D	L	V	A	L	T	S	R	L	R	E	A	G	I	S	L	C	A	D	F	V	L	N	H	T	A	D	D	H	A	W	A	Q	A	A	R	A	G	D	A	R	Y	L	D	Y	Y	H	H	F	A	D	R	T	V	P	D	R	Y	E	A	T	L	G	Q	V	F	P	H	T	A	P	G	N	F	T	W	V
Template Known Secondary structure																T	T										S				T	T	S								T	T						T	T	B				S	S	S													S	B	T	T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	S	E	Q	Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L
Query Conservation
Alig confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	D	T	A	Q	W	M	W	T	T	F	Y	P	Y	Q	W	D	L	N	W	S	N	P	A	V	F	G	D	M	A	L	A	M	L	R	L	A	N	L	G	V	E	A	F	R	L	D	S	T	A	Y	L	W	K	R	I	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	C	M	N	Q	S	E	A	H	T	L	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T						S	S	S	T	T				B		T	T	S																	T	T							T	T	T	T	S	S				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290											.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
		234	.	.	.	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.			.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
Predicted Secondary structure											.																									.	.
Query SS confidence											.																									.	.
Query Sequence		H	E	M	N	R	D	V	F	T	.	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	.	.	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G
Query Conservation											.																									.	.
Alig confidence											.																									.	.																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	L	R	A	V	T	D	I	V	A	P	A	V	V	M	K	A	Q	A	I	V	P	M	T	Q	L	P	P	Y	F	G	S	G	V	D	E	G	H	E	C	H	L	A	Y	H	S	T	L	M	A	A	G	W	S	A	L	.	.	.	.	.	.	A	L	Q	R	G	D	I	L	H	N	V	I	A	H	S	P	P
Template Known Secondary structure													T	T											G	G	G	S	G	G	G	G			G	G	G	T	T	S	S		S																.	.	.	.	.	.			T		T									T	S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360							.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	H	N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	P	R	H	C	A	W	L	S	Y	V	R	C	H	D	D	I	G	W	N	V	L	Q	H	E	A	C	G	N	A	A	Q	P	P	F	S	L	R	D	V	A	R	F	Y	A	N	A	V	P	G	S	Y	A	R	G	E	S	F	Q	G	V	H	G	T	N	G	M	A	A	A	L	A	G	I	Q	A	A	Q	E	A
Template Known Secondary structure				T	T							S			S	S				G	G	G	G					T			S	S	S														T		S	T	T																						T	T							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
					335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	A	A	A	L	A	V	A	V	D	R	L	V	L	L	Y	A	I	A	L	A	M	P	G	V	P	L	I	Y	M	G	D	E	L	A	M	V	N	D	P	G	Y	R	D	D	P	H	R	Q	H	E	G	R	W	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T																						S	S							T	T	G	G	G	T					G	G	G	G	G		T	T	T	T	T		G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.		.	.	.	.	.	.	.	490
Predicted Secondary structure																																																																									.
Query SS confidence																																																																									.
Query Sequence		N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	Q	D	L	L	P	.	N	S	P	V	L	W	C	Y
Query Conservation																																																																									.
Alig confidence		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template Conservation		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	H	R	P	A	M	D	W	Q	L	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	R	H	D	A	K	S	L	S	G	T	V	Y	R	R	L	R	G	L	I	R	Q	R	A	A	L	G	A	L	A	A	D	Q	A	L	A	S	I	A	L	N	D	P	R	V	F	A	L
Template Known Secondary structure		.	G											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		T	T	S																		T		G	G	G	S	T	T	S								S		T	T
Template Predicted Secondary structure		.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			518	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
		491	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	R	E	W	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N	L	S	R	E	I	Q	P	W	Q	A	G	Q	M	R	G	N	W	Q	L	V	M	H	N	Y	E	E	A	S	P	Q	P	C	A	M	N	L	R	P	F	E	A	V	W	W
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	R	.	.	.	G	D	S	F	I	A	L	H	N	F	S	D	Q	L	L	D	V	E	L	A	A	I	G	V	D	G	W	.	.	.	.	.	.	.	T	L	L	R	G	D	G	S	I	V	L	P	P	Y	G	V	R	W	L
Template Known Secondary structure				.	.	.	T	T	T								S	S	S						G	G	G	T	T					.	.	.	.	.	.	.							S						T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		577	.				.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.								.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.