Job Description P28904 Confidence 95.55% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 200 Aligned Residues 331 % Identity 17% Template c3a24A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of bt1871 retaining glycosidase Resolution 2.30 Å

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		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.		.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.
Query SS confidence																																																												.
Query Sequence		H	W	W	Q	N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	D	N	.	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D	D	F	D
Query Conservation																																																												.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.					.																.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Template Sequence		D	W	W	N	D	W	N	L	D	G	V	D	F	V	T	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	P	T	Y	K	A	Y	I	D	F	A	S	A	N	G	I	E	Y	V	I	L	.	.	.	.	.	.	.	D	E	G	W	A	V	N	L	Q	A	D	L	M	Q	V	V	K	E	I	D	.	.	.	.	L	K
Template Known Secondary structure		S	T	T	T	T	T				S		S	S			S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	S														T	T							.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	B		T	T	S			T	T		B		T	T			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.									.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.								350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.					370	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y	L	H	L	F
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	V	D	Y	A	A	S	K	N	V	G	I	I	L	W	A	G	Y	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		372	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V	F	T	P	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	E	R	D	M	E	N	V	C	R	H	Y	A	E	M	G	V	K	G	F	K	V	D	F	M	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	D	Q	E	M	T	A	F	N	Y	R	A	A	E	M	C	A	K	Y	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	S												T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S																	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H	N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H
Query Conservation
Alig confidence															.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	L	D	L	H	G	T	H	K	P	A	G	.	L	N	R	T	Y	P	N	V	L	N	F	E	G	V	N	G	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	M	K	W	S	S	P	S	V	D	Q	V	K	Y	D	V	M	I	P	F	I	R	Q	V	S	G	P	M	D	Y	T	Q	G	A	M	R	N	A
Template Known Secondary structure								S					T	T	.						T	T							S			G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	T			T	T	S							T	T	G	G	G	T					S									S	S
Template Predicted Secondary structure															.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.		.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470											.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	K	G	N	Y	Y	P	C	Y	S	E	P	M	S	Q	G	T	R	C	R	Q	L	A	L	Y	V	V	F	E	S	P	.	.	.	F	N	M	L	C	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			T	T						S	S	S					S												S			S	.	.	.						S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.				540	.	.	.	.	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.			.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.
Query SS confidence																																																												.	.
Query Sequence		L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	.	.	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	Q	D	L	L	P
Query Conservation																																																												.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.											.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	N	Y	M	R	E	P	E	S	T	A	F	I	A	E	I	P	T	V	.	W	D	E	S	I	V	L	D	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T											S		S	S	.		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template SS confidence
																																																				547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.		.	.	.	570	.	.	.	.	.
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.		.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.		.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.													.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.													.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	S	P	V	L	W	C	Y	R	R	E	W	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N	L	.	S	R	E	I	Q	P	W	Q	A	G	Q	M	.	R	G	N	W	Q	L	V	M	H	N	Y	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	S	P	Q	P	C	A	M	N	L	R	P	F	E
Query Conservation																									.													.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.													.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	M	G	E	Y	I	V	T	A	R	R	K	G	D	V	W	Y	V	G	G	I	T	D	W	S	A	R	D	I	E	V	D	C	S	F	L	G	D	K	S	Y	H	A	T	L	F	K	D	G	V	N	A	H	R	A	G	R	D	Y	K	C	E	S	F	P	I	K	K	D	G	K	L	K	V	H	L	A	P	G	G
Template Known Secondary structure			T	T	T									T	T										S	S									T	T	S		S	S											T	T	T	T	T		T	T											T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
		545	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	W	W	L	Q	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	F	A	L	K	I	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		656	.	.	.	660	.	.