Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 430 % Identity 29% Template c2z1kA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:(neo)pullulanase; PDBTitle: crystal structure of ttha1563 from thermus thermophilus hb8 Resolution 2.30 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	W	Q	N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	D	N	G	Y
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation																																																																														.
Template Sequence		W	Y	E	G	A	F	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	F	R	A	G	P	P	G	R	P	A	P	A	G	P	F	E	P	W	E	A	P	P	T	L	R	G	F	K	G	G	T	L	W	G	V	A	E	K	L	P	Y	L	L	D	L	G	V	E	A	I	Y	L	N	P	V	F	A	S	T	A	N	.	H	R	Y
Template Known Secondary structure		T	T	S	S								G	G	G	S				S				S	S				S					T	T	S				S	S													T								T													S	S	T	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																														.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.		.	80	.
		66	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.			.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.
Query SS confidence																																																						.	.
Query Sequence		D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D	D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	.	.	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S
Query Conservation																																																						.	.
Alig confidence																																																						.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	T	V	D	Y	F	Q	V	D	P	I	L	G	G	N	E	A	L	R	H	L	L	E	V	A	H	A	H	G	V	R	V	I	L	D	G	V	F	N	H	T	G	R	G	F	F	A	F	Q	H	L	X	E	N	G	E	Q	S	P	Y	R	D	W	Y	H	V	K	G	F	P	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S									G	G	G	T															T	T										S	B			T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	B		B		S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	K	A	Y	T	A	H	P	N	Y	E	A	W	W	G	N	P	E	L	P	K	L	K	V	E	T	P	A	V	R	E	Y	L	L	A	V	A	E	H	W	I	R	F	G	V	D	G	W	R	L	D	V	P	N	E	I	P	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	S		S	B		B	G	G	G		T	T	S	B	B	B		T	T	S																		T							S	S	G	G	G				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270								.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.																													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V	F	T	.	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	.	.	.	.	.	.	.	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P
Query Conservation																					.																													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.														.																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	P	T	F	W	R	E	F	R	Q	R	V	K	G	A	N	P	E	A	Y	I	V	G	E	I	W	E	E	A	D	F	W	L	Q	G	D	X	F	D	A	V	X	N	Y	P	L	A	R	A	V	L	G	F	V	G	G	E	A	L	D	R	D	L	A	A	Q	T	G	L	G	R	I	E	P	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.																T	T								S	S			S	G	G	G	S	S	S	S		S			B														G	G	G	S						T	T	S	T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.			.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.
Query SS confidence																					.	.
Query Sequence		D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H	N	V	.	.	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F
Query Conservation																					.	.
Alig confidence																					.	.																						.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	L	A	F	S	H	R	L	E	D	L	F	G	R	Y	R	P	E	V	V	R	A	Q	X	N	L	L	T	S	H	D	T	P	R	L	L	S	L	X	R	G	.	.	.	.	S	V	E	R	A	R	L	A	L	A	L	L	F	L	L	P	G	N	P	T	V	Y	Y	G	E	E	V	G	X	A	G	G	K	D
Template Known Secondary structure														T	T	S	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T	.	.	.	.													T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.					.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	R	G	G	X	V	W	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	R	W	Q	K
Template Known Secondary structure		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		360	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.																												370	.	.	.	.	.
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.						.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.
Query Sequence		S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	Q	D	L	L	P	N	S	P	V	L	W	C	Y	R	R	E	W	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N	L	S	R	E	I	Q	P	W	Q	A	G	Q	M	R	.	.	.	.	.	G	N	W	Q	L	V	M	H	N	Y
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.								.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.								.	.	.	.
Template Sequence		D	L	R	E	T	V	K	R	L	A	R	L	R	K	E	H	P	A	L	R	T	A	P	Y	L	R	I	Y	A	Q	D	.	G	H	L	A	F	A	R	.	.	.	.	G	P	Y	L	A	V	V	N	A	S	P	H	P	F	R	Q	D	F	P	L	H	G	V	F	P	R	G	G	R	A	V	D	L	L	S	G	E
Template Known Secondary structure																		T					S									T	.	T							.	.	.	.	T	T								S	S	S						S	B		T	T	S		T	T							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.								.	.	.	.
Template SS confidence
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.		.	.	.	410	.	.	.					.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
		529	530	.	.	.	.	.			.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		E	E	A	S	P	Q	P	.	.	C	A	M	N	L	R	P	F	E	A	V	W	W
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	C	T	P	Q	G	G	R	L	C	G	P	V	L	P	P	F	S	L	A	L	W
Template Known Secondary structure						B	T	T	B								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.