Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 41 Aligned Residues 434 % Identity 20% Template c2wanA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:pullulanase; PDBTitle: pullulanase from bacillus acidopullulyticus Resolution 1.65 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.															30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	L	P	H	W	W	Q	N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	T	P	A	N	P	V	D	E	V	I	Y	E	A	H	V	R	D	F	S	I	D	A	N	S	G	M	K	N	K	G	K	Y	L	A	F	T	E	H	G	T	K	G	P	D	H	V	K	T	G	I	D	S	L	K	E	L	G	I	T	T	V	Q	L	Q	P	V	E	E	F	N	S	I	D	E	T	Q	P	D	T
Template Known Secondary structure					S	S	G	G	G														S	T	T	S			S	S	T	T	S	G	G	G	G	G			S		B		G	G	G		B										T							S						S	S	S		T	T	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		425	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
			62	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.								80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																			.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																			.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	.	.	.	.	.	.	.	L	D	D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E
Query Conservation		.																			.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																			.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	N	W	G	Y	D	P	R	N	Y	N	V	P	E	G	A	Y	A	T	T	P	E	G	T	A	R	I	T	E	L	K	Q	L	I	Q	S	L	H	Q	Q	R	I	G	V	N	M	D	V	V	Y	N	H	T	F	D	V	M	V	S	D	F	D	.	.	.	.	.	K	I	V	P	Q	Y	Y	Y	R	T	D	S	N
Template Known Secondary structure							S									G	G	G	S	S		S	S	T	T																T	T									T	T			S		S	S	S	S				.	.	.	.	.			S	T	T	T	T	B		B		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.						.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.
Query SS confidence																																																											.
Query Sequence		P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	.	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P
Query Conservation																																																											.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.																		.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Y	T	N	G	S	G	G	N	E	F	A	T	E	H	P	M	A	Q	K	F	V	L	D	S	V	N	Y	W	V	N	E	Y	H	V	D	G	F	R	F	D	L	M	A	L	L	G	K	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B			T	T					B		T	T	S																										T	T	G	G	G	G			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		580																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.
		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
Predicted Secondary structure																																.																																																	.
Query SS confidence																																.																																																	.
Query Sequence		E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V	F	T	.	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	.
Query Conservation																																.																																																	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.																																																	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	M	A	K	I	S	N	E	L	H	A	I	N	P	G	I	V	L	Y	G	E	P	W	T	G	G	T	S	G	L	S	S	D	Q	L	V	T	K	G	Q	Q	K	G	L	G	I	G	V	F	N	D	N	I	R	N	G	L	D	G	N	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T							S	S		S	S			S	S		T	T	T	S			T	T	T	T	T	T	T	T																T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																				630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.
											291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.		.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.						.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	.	H	N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	.	.	.	.	.	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	K	T	A	Q	G	F	A	T	G	D	P	N	Q	V	D	V	I	K	N	G	V	I	G	S	I	Q	D	F	T	S	A	P	S	E	T	I	N	Y	V	T	S	H	D	N	M	T	L	W	D	K	I	L	A	S	N	P	S	D	T	E	A	D	R	I	K	M	D	E	L	A	H	A	V	V	F	T	S	Q
Template Known Secondary structure		T		T	T				T	T	T	T		S	S										B	T	T	T	T	T	T		S	S	G	G	G					S			S	S	S												T	T	S																			S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		692	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.
		356	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	V	P	F	M	Q	G	G	E	E	M	L	R	T	K	G	G	N	D	N	S	Y	N	A	G	D	S	V	N	Q	F	D	W	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T							S			T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		772	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.
		436	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.							.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.						.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Query Sequence		L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	.	.	.	.	.	.	Q	D	L	L	P	N	S	P	V	L	W	C	Y	R	R	E	W	.	.	.	.	.	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	A	Q	F	K	D	V	F	D	Y	F	S	S	M	I	H	L	R	N	Q	H	P	A	F	R	M	T	T	A	D	Q	I	K	Q	N	L	T	F	L	E	S	P	T	N	T	V	A	F	E	L	K	N	Y	A	N	H	D	T	W	K	N	I	I	V	M	Y	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T																		G	G	G	G			S															T	T								S	S	G	G	G		S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														806	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.					.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.
Query Sequence		L	S	R	E	I	Q	P	W	Q	A	G	Q	M	R	G	N	W	Q	L	V	M	H	N	.	.	.	.	Y	E	E	A	S	P	Q	P	C	A	M	N	L	R	P	F	E	A	V	W	W	L	Q
Query Conservation																									.	.	.	.
Alig confidence													.	.											.	.	.	.
Template Conservation													.	.
Template Sequence		P	N	K	T	S	Q	T	L	N	L	P	.	.	S	G	D	W	T	I	V	G	L	G	D	Q	I	G	E	K	S	L	G	H	V	M	G	N	V	Q	V	P	A	I	S	T	L	I	L	K	Q
Template Known Secondary structure			S	S	S								.	.	S	S								T	T			S	S	S		S					S						S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.
Template SS confidence
		874	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.			.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.