Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 48 Aligned Residues 433 % Identity 19% Template c2gdvA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:sucrose phosphorylase; PDBTitle: sucrose phosphorylase from bifidobacterium adolescentis2 reacted with sucrose Resolution 2.00 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.		.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.
Query SS confidence																																																			.
Query Sequence		Q	N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	.	S	P	Q	V	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D	D	F	D	E	L	V
Query Conservation																																																			.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.																															.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	N	K	V	Q	L	I	T	Y	A	D	R	L	.	.	.	.	.	.	G	D	G	T	I	K	S	M	T	D	I	L	R	T	R	F	D	G	V	Y	D	G	V	H	I	L	P	F	F	T	P	F	D	G	A	D	A	G	F	D	P	I	D	H	T	K	V	D	E	R	L	G	S	W	D	D	V	A	E	L	S
Template Known Secondary structure			S	S							S	S	S	B	.	.	.	.	.	.	S	S	S	S												S	T	T	T		S											S	S	S	S	S	T	T	S	S		S							T	T	T										T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.							.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
		88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.			.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.			.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.						.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.																.	.																	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.																.	.																	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	.	.	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	.	.	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	.	.	.	.	.	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q
Query Conservation																																.	.																.	.																	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																										.	.																.	.																	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	K	T	H	N	I	M	V	D	A	I	V	N	H	M	S	W	E	S	K	Q	F	Q	D	V	L	A	K	G	E	E	S	E	Y	Y	P	M	F	L	T	M	S	S	V	F	P	N	G	A	T	E	E	D	L	A	G	I	Y	R	P	R	P	G	L	P	F	T	H	Y	K	F	A	G	K	T	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	T	T	S									S				T	T	S										G	G	G	S	T	T	G	G	G	B		B						T	T									T	S			S	S	S	S		S							T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.
Template SS confidence
							76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R
Query Conservation
Alig confidence																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	V	W	V	S	F	T	P	Q	Q	V	D	I	D	T	D	S	D	K	G	W	E	Y	L	M	S	I	F	D	Q	M	A	A	S	H	V	S	Y	I	R	L	D	A	V	G	Y	G	A	K	E	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	C	F	M	T	P	K	T	F	K	L	I	S	R	L	R	E
Template Known Secondary structure						S	S	S	T	T				B		T	T	S																	T	T								T	G	G	G	S				T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.											.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	V	F	T	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																							.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.																							.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	.	V	K	R	G	L	E	I	L	I	E	V	H	S	Y	Y	K	K	Q	V	E	I	A	.	.	.	.	.	S	K	V	D	R	V	Y	D	F	A	L	P	P	L	L	L	H	A	L	S	T	G	H	V	E	P	V	A	H	W	T	D	I	R	P	N	N	A	V	T	V	L	D	T	H	D	G	I	G	V
Template Known Secondary structure				.		T	T	T									S									G	.	.	.	.	.	G	G	S	S						S																								S		S	S					S			S	S		B		S
Template Predicted Secondary structure				.																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		221	.		.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.						.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
																		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H	N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	D	I	G	S	D	Q	L	D	R	S	L	K	G	L	V	P	D	E	D	V	D	N	L	V	N	T	I	H	A	N	T	H	G	E	S	Q	A	A	T	G	A	A	A	S	N	L	D	L	Y	Q	V	N	S	T	Y	Y	S	A	L	G	C	N	D	Q	H	Y	I	A	A	R	A	V	Q	F	F	L	P	G	V
Template Known Secondary structure		T	T	T	S			S	S		T	T	S			S	S																T	T	T						S	G	G	G	S	B		S		S	S	S	B		S						T	T	T															S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	Q	V	Y	Y	V	G	A	L	A	G	K	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	M	E	L	L	R	K	T	N	N	G	R	D	I	N	R	H	Y	Y	S	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										B	G	G	G	G	G				B				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		438	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																											.
Query SS confidence																																																																											.
Query Sequence		D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	Q	D	L	L	P	N	S	P	V	L	W	C	Y	R	R	E	W	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N	L	S	R	E	I	Q	.	P	W	Q	A	G	Q
Query Conservation																																																																											.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																													.											.																										.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																													.											.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	D	E	N	L	K	R	P	V	V	K	A	L	N	A	L	A	K	F	R	N	E	L	D	A	F	D	.	G	T	F	S	Y	T	T	D	D	D	.	T	S	I	S	F	T	W	R	G	E	T	S	Q	A	T	L	T	F	E	P	K	R	G	L	G	V	D	N	T	T	P	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S																	G	G	G	G	.	S								T	T	.	T									S	S									G	G	G	G		S	T	T			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																													.											.
Template SS confidence
										410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.		.	.	440	.	.	.	.	.	.	.		.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		517	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	R	G	N	W	Q	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	M	L	E	W	E	D
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		480	.	.	.	.	.	.