Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 51 Aligned Residues 443 % Identity 20% Template c2by0A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltooligosyltrehalose trehalohydrolase; PDBTitle: is radiation damage dependent on the dose-rate used during2 macromolecular crystallography data collection Resolution 1.55 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		3	.	.	.	.					.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.		.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.																																																							.
Query SS confidence							.	.	.	.																																																							.
Query Sequence		H	L	P	H	W	.	.	.	.	W	Q	N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	.	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y
Query Conservation							.	.	.	.																																																							.
Alig confidence							.	.	.	.																		.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.
Template Sequence		T	D	A	D	W	H	G	I	K	L	A	D	C	V	F	Y	E	V	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	.	.	.	G	T	Y	R	A	A	A	E	K	L	P	Y	L	K	E	L	G	V	T	A	I	Q	V	X	P	L	A	A	F	D	G	Q	R	G	W	G	Y	D	G	A	A	F	Y	A	P	Y	A	P	Y
Template Known Secondary structure				T	T						G	G	G												S	S	S	.	.	.	.	.		S						T	T								T													S	S	S				S	T	T									G	G	G
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140						.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	L	D	D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E
Query Conservation
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	P	E	D	L	X	A	L	V	D	A	A	H	R	L	G	L	G	V	F	L	D	V	V	Y	N	H	F	G	P	S	G	N	Y	L	S	S	Y	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Known Secondary structure																	T	T										S				S	S	S								G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230																																							.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		Q	Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	.	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M
Query Conservation																																			.
Alig confidence																																			.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	F	T	D	R	F	S	S	A	W	G	X	G	L	D	Y	A	E	P	H	X	R	R	Y	V	T	G	N	A	R	X	W	L	R	D	Y	H	F	D	G	L	R	L	D	A	T	P	Y	X	T	D	D	S	E	T	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	T	E	L
Template Known Secondary structure		G								S	S	S					T	T	S																					S					T	T	G	G	G					S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	290	.	.
		237	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.
Query SS confidence								.
Query Sequence		N	R	D	V	F	T	.	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H	N	V	A
Query Conservation								.
Alig confidence								.																					.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	E	I	H	E	L	G	G	T	H	L	L	L	A	E	D	H	R	N	L	P	D	L	V	T	V	.	.	.	.	N	H	L	D	G	I	W	T	D	D	F	H	H	E	T	R	V	T	L	T	G	E	Q	E	G	Y	Y	A	G	Y	R	G	G	A	E	A	L	A	Y	T	I	R	R	G	W	R	Y	E	G
Template Known Secondary structure							T	T		S										S			T					T	.	.	.	.	S			S					T															S	G	G	G	G	G				S											S	S	S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.					320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
																								316	.	.	.	320	.	.	.	.	.				.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	.	.	.	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	F	W	A	V	K	G	E	E	H	E	R	G	H	P	S	D	A	L	E	A	P	N	F	V	Y	C	I	Q	N	H	D	Q	I	G	N	R	P	L	G	E	R	L	H	Q	S	D	G	V	T	L	H	E	Y	R	G	A	A	A	L	L	L	T	L	P	X	T	P	L	L	F	Q	G	Q	E	W	A	A	S	T
Template Known Secondary structure							T	T										T	T			G	G	G					S								T	S	T	T				G	G	G	S	T	T																S	S	S						T	T	G	G	G	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
		371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	F	Q	F	F	S	D	H	A	G	E	L	G	Q	A	V	S	E	G	R	K	K	E	F	D	V	P	D	P	Q	A	E	Q	T	F	L	N	S	K	L	N	W	A	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	G
Template Known Secondary structure																														T	T	S							T	S			G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.																																	.	.	.
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.		.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.		.	.	.	.	.		.	.	520	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.																																			.						.
Query SS confidence																														.																																			.						.
Query Sequence		D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	Q	.	D	L	L	P	N	S	P	V	L	W	C	Y	R	R	E	W	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N	L	S	R	E	I	Q	P	W	.	Q	A	G	Q	M	.	R	G	N	W	Q	L	V	M	H	N
Query Conservation																														.																																			.						.
Alig confidence																														.																																			.						.
Template Conservation
Template Sequence		E	H	A	R	T	L	R	L	Y	R	D	L	L	R	L	R	R	E	D	P	V	L	H	N	R	Q	R	E	N	L	T	T	G	H	D	G	D	V	L	W	V	R	T	V	T	G	A	G	E	R	V	L	L	W	N	L	G	Q	D	T	R	A	V	A	E	V	K	L	P	F	T	V	P	R	R	L	L	L	H	T
Template Known Secondary structure																					T	T	T	T				G	G	G							T	T									T	T										S	S	S				G	G	G	S			S	S										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	E	E	A	S	P	Q	P	C	A	M	N	L	R	P	F	E	A	V	W	W
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.
Template Sequence		E	G	R	.	.	.	.	.	E	D	L	T	L	G	A	G	E	A	V	L	V
Template Known Secondary structure		T			.	.	.	.	.	S	S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		586	.	.						.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.