Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 439 % Identity 25% Template c1lwhA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:4-alpha-glucanotransferase; PDBTitle: crystal structure of t. maritima 4-alpha-glucanotransferase Resolution 2.60 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D	D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K
Query Conservation
Alig confidence																																																	.
Template Conservation																																																	.
Template Sequence		I	G	Y	Q	I	Y	V	R	S	F	R	D	G	N	L	D	G	V	G	D	F	R	G	L	K	N	A	V	S	Y	L	K	E	L	G	I	D	F	V	W	L	M	P	V	F	S	S	.	I	S	F	H	G	Y	D	V	V	D	F	Y	S	F	K	A	E	Y	G	S	E	R	E	F	K	E	M	I	E	A	F	H
Template Known Secondary structure								G	G	G	T			S	S	S	S	S	S									T							T	T		S											.	S	S	S	S			S		S							G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.
Template Sequence		D	S	G	I	K	V	V	L	D	L	P	I	H	H	T	G	F	L	H	T	W	F	Q	K	A	L	K	G	D	P	H	Y	R	D	Y	Y	V	W	A	N	K	E	T	D	L	D	E	.	.	.	R	R	E	W	D	G	E	K	I	W	H	P	L	E	D	G	R	F	Y	R	G	L	F	G	P	F	S	P	D	L
Template Known Secondary structure			T	T									T	T	B			T	T	S								T	T						T	T	B		B			T	T			T	T		.	.	.	B		S	S	S			B						T	T	S						T	T		T	T	S		B	B
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.				.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V	F	T	P	R	G	L	M	T	V	G	E
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Sequence		N	Y	D	N	P	Q	V	F	D	E	M	K	R	L	V	L	H	L	L	D	M	G	V	D	G	F	R	F	D	A	A	K	H	M	R	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	Q	N	V	R	F	W	K	Y	F	L	.	S	D	L	K	G	I	F	L	A	E
Template Known Secondary structure			T	T	S																		T							T	T	G	G	G	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.		.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	H	N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																.	.
Template Sequence		I	W	A	E	A	R	M	V	D	E	.	.	.	.	.	H	G	R	I	F	G	Y	M	L	N	F	D	T	S	H	C	I	K	E	A	V	.	.	.	.	.	W	K	E	N	T	R	V	L	I	E	S	I	E	R	A	.	.	V	I	A	K	D	Y	L	P	V	N	F	T	S	N	H	D	M	S	R	L	A	S
Template Known Secondary structure				S		S	S	S				.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.			T		T											.	.	T	S	S		S	S						S			T	T	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.																.	.
Template SS confidence
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.						.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.						.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.			.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	E	G	G	.	.	.	F	S	K	E	K	I	K	L	S	I	S	I	L	F	T	L	P	G	V	P	L	V	F	Y	G	D	E	L	G	M	K	G	V	Y	Q	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	T	E
Template Known Secondary structure		G	G	G		.	.	.														T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T							S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		285	.	.	.				.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.																																		.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	Q	D	L	L	P	N	S	P	V	L	W	C	Y	R
Query Conservation
Alig confidence																																																																											.
Template Conservation																																																																											.
Template Sequence		V	V	L	D	P	F	P	W	N	E	S	M	C	V	E	G	Q	T	F	W	K	W	P	A	Y	N	G	P	F	S	G	I	S	V	E	Y	Q	K	R	D	P	D	S	I	L	S	H	T	L	G	W	T	R	F	R	K	E	N	Q	W	I	D	R	A	K	L	E	F	L	C	K	E	D	.	K	F	L	V	Y	R
Template Known Secondary structure		G	G	S					S	S	T	T	S		S	T	T				S	S			S	S			S	S	S	S		S					T	T		T	T	S														T		G	G	G	G	G										S	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																											.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.		.	.	.	.	.	.
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.		.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		R	E	W	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N	L	S	R	E	I	Q	P	W	Q	.	A	G	Q	M	R	G	N	W	Q	L	V
Query Conservation																								.
Alig confidence																								.
Template Conservation
Template Sequence		L	Y	D	D	Q	H	S	L	K	V	F	H	N	L	S	G	E	E	V	V	F	E	G	V	K	M	K	P	Y	K	T	E	V	V
Template Known Secondary structure					T	T										S	S	S					T	T					T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.