Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 429 % Identity 32% Template c1jibA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:neopullulanase; PDBTitle: complex of alpha-amylase ii (tva ii) from thermoactinomyces2 vulgaris r-47 with maltotetraose based on a crystal soaked3 with maltohexaose. Resolution 3.30 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	L	P	H	W	W	Q	N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	D
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template Conservation																																																																																.
Template Sequence		T	T	P	E	W	A	K	E	A	V	I	Y	Q	I	F	P	E	R	F	A	N	G	D	P	S	N	D	P	P	G	T	E	Q	W	A	K	D	A	R	P	R	H	D	S	F	Y	G	G	D	L	K	G	V	I	D	R	L	P	Y	L	E	E	L	G	V	T	A	L	Y	F	T	P	I	F	A	S	P	S	.	H
Template Known Secondary structure									T								G	G	G	T					T	T	T			T	T						T	T					T	T													T								T		S											S	S	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																																.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200		.
		63	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.			.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure																																																									.	.
Query SS confidence																																																									.	.
Query Sequence		N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D	D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	.	.	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N
Query Conservation																																																									.	.
Alig confidence																																																									.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	K	Y	D	T	A	D	Y	L	A	I	D	P	Q	F	G	D	L	P	T	F	R	R	L	V	D	E	A	H	R	R	G	I	K	I	I	L	D	A	V	F	N	H	A	G	D	Q	F	F	A	F	R	D	V	L	Q	K	G	E	Q	S	R	Y	K	D	W	F	F	I	E	D	F	P	V	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S			S		S							T	T	T															T	T	T										S	B			T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	S		B		S	S	S		.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y	L	H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	T	S	R	T	N	Y	E	T	F	A	V	Q	V	P	A	M	P	K	L	R	T	E	N	P	E	V	K	E	Y	L	F	D	V	A	R	F	W	M	E	Q	G	I	D	G	W	R	L	N	V	A	N	E	V	D	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S		S	B		B	S	S	S	S		T	T		B	B			T	T	S																T	T	T							T	T	G	G	G	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												276	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.		.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V	F	T	.	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A
Query Conservation																								.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.																				.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	W	R	E	F	R	R	L	V	K	S	L	N	P	D	A	L	I	V	G	E	I	W	H	D	A	S	G	W	L	M	.	.	.	.	.	.	G	D	Q	F	D	S	V	M	N	Y	L	F	R	E	S	V	I	R	F	F	A	T	.	.	.	G	E	I	H	A	E	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															T	T								S	S			T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	T	T	S		S			B													T	S	.	.	.			S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.																							.	.	.
Template SS confidence
												333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.							.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.				.	.	.	390	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.			.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.
Query SS confidence														.	.
Query Sequence		L	K	T	L	F	R	H	W	Q	Q	G	M	.	.	H	N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T
Query Conservation														.	.
Alig confidence														.	.																									.	.	.	.																																					.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.																																					.	.
Template Sequence		F	D	A	E	L	T	R	A	R	M	L	Y	P	E	Q	A	A	Q	G	L	W	N	L	L	D	S	H	D	T	E	R	F	L	T	S	C	G	G	.	.	.	.	N	E	A	K	F	R	L	A	V	L	F	Q	M	T	Y	L	G	T	P	L	I	Y	Y	G	D	E	I	G	M	A	G	A	T	D	P	D	.	.
Template Known Secondary structure											T	T	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T	.	.	.	.													T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.																																					.	.
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.					.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	R	R	P	M	I	W	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	E	Q	N	R	G	L	F	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																					468	.	470	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	480	.	.	.	.	.
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.		.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.				.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.		530	.	.
Predicted Secondary structure																											.																																		.	.	.															.
Query SS confidence																											.																																		.	.	.															.
Query Sequence		T	Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	Q	D	L	L	P	.	N	S	P	V	L	W	C	Y	R	R	E	W	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N	L	S	R	E	I	Q	P	W	Q	A	G	.	.	.	Q	M	R	G	N	W	Q	L	V	M	H	N	Y	E	.	E	A	S
Query Conservation																											.																																		.	.	.															.
Alig confidence																											.																																		.	.	.															.
Template Conservation
Template Sequence		F	Y	K	E	L	I	R	L	R	H	R	L	A	S	L	T	R	G	N	V	R	S	W	H	A	D	K	Q	A	N	L	Y	A	F	V	R	T	V	Q	D	Q	H	V	G	V	V	L	N	N	R	G	E	K	Q	T	V	L	L	Q	V	P	E	S	G	G	K	T	W	L	D	C	L	T	G	E	E	V	H	G	K
Template Known Secondary structure														T														T	T	T	T									T	T										S	S	S										T	T	S		S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		486	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
		533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	Q	P	C	A	M	N	L	R	P	F	E	A	V	W	W
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	Q	L	K	L	T	L	R	P	Y	Q	G	M	I	L
Template Known Secondary structure		T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		566	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.