Job Description P28904 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:45:17 GMT 2012 Rank 49 Aligned Residues 439 % Identity 20% Template c1ehaA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycosyltrehalose trehalohydrolase; PDBTitle: crystal structure of glycosyltrehalose trehalohydrolase2 from sulfolobus solfataricus Resolution 3.00 Å

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		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.		.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																																																													.
Query SS confidence																																																													.
Query Sequence		H	L	P	H	W	W	Q	N	G	V	I	Y	Q	I	Y	P	K	S	F	Q	D	T	T	G	S	G	T	G	D	L	R	G	V	I	Q	H	L	D	Y	L	H	K	L	G	V	D	A	I	W	L	T	P	F	Y	V	S	P	Q	V	.	D	N	G	Y	D	V	A	N	Y	T	A	I	D	P	T	Y	G	T	L	D
Query Conservation																																																													.
Alig confidence																								.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.
Template Sequence		E	T	F	L	K	K	E	D	L	I	I	Y	E	I	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	.	.	.	G	T	F	E	G	V	I	R	K	L	D	Y	L	K	D	L	G	I	T	A	I	E	I	M	P	I	A	Q	F	P	G	K	R	D	W	G	Y	D	G	V	Y	L	Y	A	V	Q	N	S	Y	G	G	P	E
Template Known Secondary structure				S			S	S	S								T	T	T	S	S	S	S	.	.	.	.	.		S							T								T										B			S	S	S				S	T	T				T	T	S	B		S	T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.
Template SS confidence
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.						.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	D	E	L	V	T	Q	A	K	S	R	G	I	R	I	I	L	D	M	V	F	N	H	T	S	T	Q	H	A	W	F	R	E	A	L	N	K	E	S	P	Y	R	Q	F	Y	I	W	R	D	G	E	P	E	T	P	P	N	N	W	R	S	K	F	G	G	S	A	W	R	W	H	A	E	S	E	Q	Y	Y	L
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	F	R	K	L	V	D	E	A	H	K	K	G	L	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	V	G	P	E	G	N	Y	M	V	K	.	.	.	.	.	.	.	L	G	P	Y	F	S	Q	K	Y	K	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														T										S				S	S	S			S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	T	S			S		S	S				S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.								.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		H	L	F	A	P	E	Q	A	D	L	N	W	E	N	P	A	V	R	A	E	L	K	K	V	C	E	F	W	A	.	D	R	G	V	D	G	L	R	L	D	V	V	N	L	I	S	K	D	P	R	F	P	E	D	L	D	G	D	G	R	R	F	Y	T	D	G	P	R	A	H	E	F	L	H	E	M	N	R	D	V
Query Conservation																															.
Alig confidence		.	.																												.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	W	G	L	T	F	N	F	D	D	A	E	S	D	E	V	R	K	F	I	L	E	N	V	E	Y	W	I	K	E	Y	N	V	D	G	F	R	L	D	A	V	H	A	I	I	D	T	S	P	K	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	L	E	E	I	A	D	V	V
Template Known Secondary structure		.	.	S	S					S	S	S	T	T	T	T	T																S								T	T	G	G	G					S	S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	270	.	.	.
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	T	P	R	G	L	M	T	V	G	E	M	S	S	T	S	L	E	H	C	Q	R	Y	A	A	L	T	G	S	E	L	S	M	T	F	N	F	H	H	L	K	V	D	Y	P	G	G	E	K	W	T	L	A	K	P	D	F	V	A	L	K	T	L	F	R	H	W	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.																											.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.																											.
Template Sequence		H	.	K	Y	N	R	I	V	I	A	E	S	D	L	N	D	P	R	V	V	N	P	K	E	K	V	G	Y	.	N	I	D	A	Q	W	V	D	D	F	H	H	S	I	H	A	Y	L	T	G	E	R	Q	G	Y	Y	T	D	F	G	N	L	D	D	I	V	K	S	Y	K	D	V	F	V	Y	D	G	K	Y	S	N
Template Known Secondary structure			.			T									S			T	T	T	T			T	T	T	T			.			S																S				S	G	G	G	G	G													S	S		S							T
Template Predicted Secondary structure			.																											.
Template SS confidence
		274		.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
											309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.		340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	M	H	N	V	A	W	N	A	L	F	W	C	N	H	D	Q	P	R	I	V	S	R	F	G	D	E	G	E	Y	.	R	V	P	A	A	K	M	L	A	M	V	L	H	G	M	Q	G	T	P	Y	I	Y	Q	G	E	E	I	G	M	T	N	P	H	F	T	R	I	T	D
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template Conservation
Template Sequence		F	R	R	K	T	H	G	E	P	V	G	E	L	D	G	C	N	F	V	V	Y	I	Q	N	H	D	Q	V	G	N	R	G	K	G	E	R	I	I	K	L	V	D	R	E	S	Y	K	I	A	A	A	L	Y	L	L	S	P	Y	I	P	M	I	F	M	G	E	E	Y	G	E	E	N	P	F	Y	F	F	S	D	F
Template Known Secondary structure		T	T	T									S			G	G	G					S								T	T	S	S				S	G	G	G	S														T	S	S	S						T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
		379	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	R	D	V	E	S	L	N	M	F	A	E	L	R	N	D	G	R	D	A	D	E	L	L	A	I	L	A	S	K	S	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	N	G	D	N	A	G	F	T	A	G	E	P	W	I	G	L	G	D	N	Y	Q	Q	I	N	V	E	A	A	L	A	D	D	S	S	V	F	Y	T
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	D	S	K	L	I	Q	G	V	R	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	K	K	E	N	G	Q	D	T	D	P	Q	D	E	S	T	F	N	A	S	K	L	S	W	K	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	I	F	S	F
Template Known Secondary structure			S	T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									S		T	T	S						T	T	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		432	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470														.	.	.	.	.	.
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Q	K	L	I	A	L	R	K	Q	E	A	I	L	T	W	G	N	Y	Q	D	L	L	P	N	S	P	V	L	W	C	Y	R	R	E	W	K	G	Q	T	L	L	V	I	A	N	L	S	R	E	I	Q	P	W	Q	A	G	Q	M	R	G	N	W	Q	L	V	M	H	N	Y	E	E	A	S	P	Q	P	C	A	M
Query Conservation
Alig confidence																												.	.							.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation																												.	.							.	.	.	.																				.	.	.
Template Sequence		Y	K	I	L	I	K	M	R	K	E	L	S	I	A	C	D	R	R	V	N	V	V	N	G	E	N	.	.	W	L	I	I	K	G	.	.	.	.	R	E	Y	F	S	L	Y	V	F	S	K	S	S	I	E	V	K	Y	S	.	.	.	G	T	L	L	L	S	S	N	N	S	F	P	Q	H	I	E	E	G	K	Y
Template Known Secondary structure													T		S	S										S	S	.	.							.	.	.	.	S	S							S	S	S									.	.	.		B					S	S	S				S	B			S	S
Template Predicted Secondary structure																												.	.							.	.	.	.																				.	.	.
Template SS confidence
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.			.	.	.	.	.	.					.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.				.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
		539	540	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	R	P	F	E	A	V	W	W
Query Conservation
Alig confidence				.
Template Conservation				.
Template Sequence		E	F	.	D	K	G	F	A	L	Y
Template Known Secondary structure				.		S
Template Predicted Secondary structure				.
Template SS confidence
		548	.		550	.	.	.	.	.	.