Job Description P04693 Confidence 99.74% Date Thu Jan 5 10:58:18 GMT 2012 Rank 227 Aligned Residues 354 % Identity 14% Template d1pmma_ SCOP info PLP-dependent transferase-like PLP-dependent transferases Pyridoxal-dependent decarboxylase Resolution 2.00

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	D	P	I	L	T	L	M	E	R	F	K	E	D	P	R	S	D	K	V	N	L	S	I	G	L	Y	Y	N	E	D	G	I	I	P	Q	L	Q	A	V	A	E	A	E	A	R	L	N	A	Q	P	H	G	A	S	L	Y	L	P	M	E	G	L	N	C	Y	R	H	A	I	A	P	L	L	F	G	A	D	H
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.															.	.
Template Sequence		R	D	D	V	A	F	Q	I	I	N	D	E	L	Y	L	D	G	N	A	R	Q	N	L	A	T	F	C	.	.	.	.	.	.	Q	T	W	D	D	E	N	V	H	K	L	M	D	L	.	.	S	I	N	K	N	W	I	D	K	E	E	Y	P	Q	S	A	A	I	D	L	R	C	V	N	M	V	A	D	L	W	H
Template Known Secondary structure														G	G	G	S			G	G	G	B		S			S	.	.	.	.	.	.															.	.	T	T	T		B	T	T		T	T	T	S																		T	T
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.															.	.
Template SS confidence
		38	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.							.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.			.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.		.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.											.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	V	L	K	Q	.	Q	R	V	A	T	I	Q	T	L	G	G	S	G	A	L	K	V	G	A	D	F	L	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	F	P	E	S	G	V	W	V	S	D	P	T	W	E	N	H	V	A	I	F	A	G	A	G	F	E	V	S	T	Y	P	W	Y	D	E	A	T	N	G
Query Conservation							.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation																																																																												.
Template Sequence		A	P	A	P	K	N	G	Q	A	V	G	T	N	T	I	G	S	S	E	A	C	M	L	G	G	M	A	M	K	W	R	W	R	K	R	M	E	A	A	G	K	P	T	D	K	P	N	L	V	C	G	P	V	Q	I	C	W	H	K	F	A	R	Y	W	D	V	E	L	R	E	I	P	M	R	.	P	G	Q	L	F
Template Known Secondary structure						T	T	S			S					S	S																								T				S							S	S												T	T									B	.	T	T	B		S
Template Predicted Secondary structure																																																																												.
Template SS confidence
		110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.		.	.	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.							.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	R	F	N	D	L	L	A	T	L	K	T	L	P	A	R	S	I	V	L	L	H	P	C	C	H	N	P	T	G	A	D	L	T	N	D	Q	W	D	A	V	I	E	I	L	K	A	R	E	.	.	.	.	.	.	L	I	P	F	L	D	I	A	Y	Q	G	F	G	A	G	M	E	E	D	A	Y	A	I	R	A
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.																				.	.	.													.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.																				.	.	.
Template Sequence		M	D	P	K	R	M	I	E	A	C	D	E	.	.	.	N	T	I	G	V	V	P	T	F	G	V	T	Y	T	G	N	Y	E	F	.	.	.	P	Q	P	L	H	D	A	L	D	K	F	Q	A	D	T	G	I	D	I	D	M	H	I	D	A	A	S	G	G	F	L	A	P	F	V	A	P	D	I	V	W	D	F
Template Known Secondary structure													T	.	.	.	T							B	B	S		T	T	T		B	B			.	.	.																										T	T	G	G	G	T						T	T				S	T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.																				.	.	.
Template SS confidence
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200				.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.				220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.														.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	S	A	G	L	P	A	L	V	S	N	S	F	S	K	I	F	S	L	Y	G	E	R	V	G	G	L	S	V	M	C	E	D	A	E	A	A	G	R	V	L	G	Q	L	K	A	T	V	R	R	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	P	P	N	F	G	A	Q	V	V	A	A	V
Query Conservation																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																		.															.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.																		.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	R	L	P	R	V	K	S	I	S	A	S	G	H	K	F	G	L	.	A	P	L	G	C	G	W	V	I	W	R	D	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	P	Q	E	L	V	F	N	V	D	Y	L	G	G	Q	I	G	T	F	A	I	N	F	S	R	P	A	G	Q	V	I	A	Q	Y	Y	E
Template Known Secondary structure		.	.	T	S	T	T								T	T	T	T	T		.			S	S							S	S	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S		G	G	G							T	T								S			S		B	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																		.															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
				263	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.										.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330
		299	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.						.	.	.	350	.								.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	N	D	E	A	L	K	A	S	W	L	A	E	V	E	E	M	R	T	R	I	L	A	M	R	Q	E	L	V	K	V	L	S	T	E	M	P	E	R	N	F	D	Y	L	L	N	Q	R	.	.	.	.	.	G	M	F	S	Y	.	.	.	.	.	.	.	T	G	L	S	A	A	Q	V	D	R	L	R	E	E	F
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.																											.	.	.										.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.																											.	.	.
Template Sequence		F	L	R	L	G	.	.	.	.	.	R	E	G	Y	T	K	V	Q	N	A	S	Y	Q	V	A	A	Y	L	A	D	E	I	A	K	L	G	.	.	.	P	Y	E	F	I	C	T	G	R	P	D	E	G	I	P	A	V	C	F	K	L	K	D	G	E	D	P	G	Y	T	L	Y	D	L	S	E	R	L	R	L	R
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.																								T	T	S	.	.	.										T	T	T	B	S	S								T	T				S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.																											.	.	.
Template SS confidence
		331	.	.	.	.						.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.				.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
		367	.	.	370	.	.	.												.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Query Sequence		G	V	Y	L	I	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	M	C	V	.	A	G	L	N	T	A	N	V	Q	R	V	A	K	A	F	A	A	V	M
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.
Template Conservation
Template Sequence		G	W	Q	V	P	A	F	T	L	G	G	E	A	T	D	I	V	V	M	R	I	M	C	R	R	G	F	E	M	D	F	A	E	L	L	L	E	D	Y	K	A	S	L
Template Known Secondary structure		T		B								T	T		T	T										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.