Job Description P31471 Confidence 99.49% Date Thu Jan 5 11:48:00 GMT 2012 Rank 106 Aligned Residues 235 % Identity 15% Template c3i1iA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:homoserine o-acetyltransferase; PDBTitle: x-ray crystal structure of homoserine o-acetyltransferase from2 bacillus anthracis Resolution 2.44 Å

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		138	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.		.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.																																																					.	.	.
Query SS confidence																										.																																																					.	.	.
Query Sequence		V	A	H	G	D	L	I	A	I	T	Y	H	S	N	A	L	Q	S	E	R	Q	M	Y	V	.	W	T	P	P	G	Y	T	G	M	G	E	P	L	P	V	L	Y	F	Y	H	G	F	G	D	T	G	R	S	A	I	D	Q	G	R	I	P	Q	I	M	D	N	L	L	A	E	G	K	I	K	P	M	L	.	.	.
Query Conservation																										.																																																					.	.	.
Alig confidence																.										.						.																													.	.	.	.	.	.													.	.	.
Template Conservation																.																.																													.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	K	K	E	K	F	I	L	K	E	Y	T	F	E	.	N	G	R	T	I	P	V	Q	X	G	Y	E	T	Y	G	.	T	L	N	R	E	R	S	N	V	I	L	I	C	H	Y	F	S	A	T	S	H	A	A	G	K	Y	T	A	.	.	.	.	.	.	H	D	E	E	S	G	W	W	D	G	L	I	G	P	G
Template Known Secondary structure															T	.	T	S													S	.				T	T											T	T			S			S	S		S	S	T	.	.	.	.	.	.	T		S	S			T	T	T	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure																.																.																													.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.		.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.		.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60							.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.
											214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.							.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	V	I	P	D	T	E	T	D	A	K	G	I	I	P	E	D	F	V	P	Q	E	R	R	K	V	F	Y	P	L	N	A	K	A	A	.	.	.	.	.	.	D	R	E	L	M	N	D	I	I	P	L	I	S	K	R	F	N	V	R	K	D	A	D	G	R	A	L	A	.	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.																													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.									.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.
Template Sequence		K	A	I	D	T	N	Q	Y	F	V	I	C	T	D	N	L	C	N	V	Q	V	K	N	P	H	V	I	T	T	G	P	K	S	I	N	P	K	T	G	D	E	Y	A	X	D	F	P	V	F	T	F	L	D	V	A	R	X	Q	C	E	L	I	K	D	X	.	.	.	.	.	G	I	A	R	L	H	A	V	X	G
Template Known Secondary structure		S	S			T	T	T									T	T		S		T	T	S	T	T					S	T	T	S	B		T	T	T	S	S	B		G	G	G	S																			T	.	.	.	.	.	T				B	S
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		76	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140						.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	S	Q	G	G	Y	Q	A	L	V	S	G	M	N	H	L	E	S	F	G	W	L	A	T	F	S	G	V	T	T	T	T	V	P	D	E	G	V	A	A	R	L	N	D	P	A	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	S	A	G	G	X	I	A	Q	Q	W	A	V	H	Y	P	H	X	V	E	R	X	I	G	V	I	T	N	P	Q	N	P	I	I	T	S	V	N	V	A	Q	N	A	I	E	A	I	R	L	D	P	S	W	K	G	G	K	Y	G	E	E	Q	P	X	K	G	L	Q	L	A	N	R	X	X	F	X	N	A	F	D
Template Known Secondary structure			T														T	T	T	B	S						S			S	B									T	T										S	G	G	G	G	G	G			T	T	S															T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
																																																																								326	.	.	.	330	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	Q	Q	L	R	N	F	T	V	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	H	F	Y	E	T	T	Y	P	R	N	S	I	E	V	E	P	Y	E	K	V	S	S	L	T	S	F	E	K	E	I	N	K	L	T	Y	R	S	I	E	L	V	D	A	N	S	W	X	Y	T	A	K	A	V	L	L	H	D	I	A	H	G	F	S	S	L	E	E	A	L	S	N	V	E	A	N	V	L	X	I
Template Known Secondary structure									S				S	S			G	G	G	T		T	T																T	T	T	T																	B	T	T	T	T	S	S								T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310
		336	.	.	.	340	.	.	.	.		.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.		.	370	.	.	.	.	.						.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.																									.								.	.	.	.	.
Query SS confidence											.																									.								.	.	.	.	.
Query Sequence		V	G	D	K	D	V	V	T	G	.	K	D	I	A	G	L	K	T	E	L	E	Q	K	K	I	N	F	D	Y	Q	E	Y	P	G	.	L	N	H	E	M	D	V	.	.	.	.	.	W	R	P	A	Y	A	A	F	V	Q
Query Conservation											.																									.								.	.	.	.	.
Alig confidence											.																									.								.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	C	K	Q	D	L	L	Q	P	S	R	Y	N	Y	K	X	V	D	L	L	Q	K	Q	G	K	Y	A	E	V	Y	E	I	E	S	I	N	G	H	X	A	G	V	F	D	I	H	L	F	E	K	K	V	Y	E	F	L	N
Template Known Secondary structure			B	T	T		S	S	S		T													T	T								B			T	T	G	G	G						G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		311	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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