Job Description P31471 Confidence 98.73% Date Thu Jan 5 11:48:00 GMT 2012 Rank 207 Aligned Residues 224 % Identity 20% Template c2rauA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:putative esterase; PDBTitle: crystal structure of a putative lipase (np_343859.1) from sulfolobus2 solfataricus at 1.85 a resolution Resolution 1.85 Å

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		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.											.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	L	I	A	I	T	Y	H	S	N	A	L	Q	S	E	R	Q	M	Y	V	W	T	P	P	G	Y	T	G	M	G	E	P	L	P	V	L	Y	F	Y	H	G	F	G	D	T	G	R	S	A	I	D	Q	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	P	Q	I	M	D	N	L	L	A	E	G	K	I	K
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																												.	.	.																																																	.	.	.
Template Sequence		Q	L	I	E	N	I	W	K	X	K	R	E	D	S	P	Y	D	I	I	S	L	H	K	V	N	L	.	.	.	I	G	G	G	N	D	A	V	L	I	L	P	G	T	W	S	S	G	E	Q	L	V	T	I	S	W	N	G	V	H	Y	T	I	P	D	Y	R	K	S	I	V	L	Y	L	A	R	N	G	.	.	.
Template Known Secondary structure													S	S	S	T	T											.	.	.	T	T												T	T									S			T	T				S				G	G	G									T	T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.																																																	.	.	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.				.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																																	.
Query SS confidence																																																																																	.
Query Sequence		P	M	L	V	V	I	P	D	T	E	T	D	A	K	G	I	I	P	E	D	F	V	P	Q	E	R	R	K	V	F	Y	P	L	N	A	K	A	A	D	R	E	L	M	N	D	I	I	P	L	I	S	K	R	F	N	V	R	K	D	A	D	G	R	A	L	A	G	L	S	Q	G	G	Y	Q	A	L	V	S	G	.
Query Conservation																																																																																	.
Alig confidence		.																						.	.	.	.																.													.	.	.	.																						.
Template Conservation		.																						.	.	.	.																.													.	.	.	.
Template Sequence		.	F	N	V	Y	T	I	D	Y	R	T	H	Y	V	P	P	F	L	K	D	R	Q	.	.	.	.	L	S	F	T	A	N	W	G	W	S	T	W	I	S	D	.	I	K	E	V	V	S	F	I	K	R	D	S	.	.	.	.	G	Q	E	R	I	Y	L	A	G	E	S	F	G	G	I	A	A	L	N	Y	S	S
Template Known Secondary structure		.									G	G	G	G			T	T			G	G	G	.	.	.	.	G	G	G	G	T	T		S								.													.	.	.	.			S	S							T
Template Predicted Secondary structure		.																						.	.	.	.																.													.	.	.	.
Template SS confidence
			93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.					.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.		.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140					.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	N	H	L	E	S	F	G	W	L	A	T	F	S	G	V	T	T	T	T	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Y	W	K	N	D	I	K	G	L	I	L	L	D	G	G	P	T	K	H	G	I	R	F	Y	T	P	E	V	N	S	I	E	E	X	E	A	K	G	I	Y	V	I	P	S	R	G	G	P	N	N	P	I	W	S	Y	A	L	A	N	P	D	X	P	S	P	D	P	K	Y	K	S	I	S	D	F	L	X	D	S
Template Known Secondary structure															S		S		B		T	T							S		S	S								T							S	S	S	T	T		T								S	T	T	S			S	S	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
																																	312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	G	V	A	A	R	L	N	D	P	A	A	I	N	Q	Q	L	R	N	F	T	V	V	V	G	D	K	D	V	V	T	G	K	D	I	A	G	L	K	T	E	L	E	Q	K	K	I	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	V	T	G	S	A	N	P	Y	D	Y	P	Y	S	K	K	E	D	X	F	P	I	L	A	S	F	D	P	Y	W	P	Y	R	L	S	L	E	R	D	L	K	F	D	Y	E	G	I	L	V	P	T	I	A	F	V	S	E	R	F	G	I	Q	I	F	D	S	.	.	.	.	.	.	.	K	I	L	P	S	N
Template Known Secondary structure					T	T	S			T	T	S	T	T													T	S		S									T	T	T						T	T											T	T	T					B		G	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.								.	.	.	.	.	.
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.						.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.
Query Sequence		F	D	Y	Q	E	Y	P	G	L	N	H	.	.	.	.	.	E	M	D	V	W	R	P	A	Y	A	A	F	V	Q	K	L
Query Conservation													.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	E	I	I	L	L	K	G	Y	G	H	L	D	V	Y	T	G	E	N	S	E	K	D	V	N	S	V	V	L	K	W	L
Template Known Secondary structure								T	T			G	G	G	G	T	S	S	T	T					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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