Job Description P31471 Confidence 99.24% Date Thu Jan 5 11:48:00 GMT 2012 Rank 132 Aligned Residues 188 % Identity 22% Template c2cjpA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:epoxide hydrolase; PDBTitle: structure of potato (solanum tuberosum) epoxide hydrolase i2 (steh1) Resolution 1.95 Å

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		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	V	L	Y	F	Y	H	G	F	G	D	T	G	R	S	A	I	D	Q	G	R	I	P	Q	I	M	D	N	L	L	A	E	G	K	I	K	P	M	L	V	V	I	P	D	T	E	T	D	A	K	G	I	I	P	E	D	F	V	P	Q	E	R	R	K	V	F	Y	P	L	N	A	K	A	A	D	R	E	L	M	N
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	T	I	L	F	I	H	G	F	P	E	L	W	Y	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	H	Q	M	V	Y	L	A	E	R	G	Y	R	A	V	A	P	D	L	R	G	Y	G	D	T	T	G	A	P	L	N	D	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	F	S	I	L	H	L	V	G
Template Known Secondary structure		S								T	T			G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	T									T	T	S	T	T		B				T	T		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40											.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.												.	.	.	.	.	80	.	.	.
		255	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	I	I	P	L	I	S	K	R	F	N	V	R	K	D	A	D	G	R	A	L	A	G	L	S	Q	G	G	Y	Q	A	L	V	S	G	M	N	H	L	E	S	F	G	W	L	A	T	F	S	G	V	T	T	T	T	V	P	D	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.
Template Sequence		D	V	V	A	L	L	E	A	I	A	P	.	.	.	N	E	E	K	V	F	V	V	A	H	D	W	G	A	L	I	A	W	H	L	C	L	F	R	P	D	K	V	K	A	L	V	N	L	S	V	H	F	S	K	R	N	P	K	M	N	V	V	E	G	L	K	A	I	Y	G	E	D	H	Y	I	S	R	F	Q	V
Template Known Secondary structure												T	.	.	.	T		S	S							T														G	G	G								S								S	S													T	T	B					T	S	S
Template Predicted Secondary structure													.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.				.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
																																																																																314	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	E	I	E	A	E	F	A	P	I	G	A	K	S	V	L	K	K	I	L	T	Y	R	D	P	A	P	F	Y	F	P	K	G	K	G	L	E	A	I	P	D	A	P	V	A	L	S	S	W	L	S	E	E	E	L	D	Y	Y	A	N	K	F	E	Q	T	G	F	T	G	A	V	N	Y	Y	R	A	L	P	I
Template Known Secondary structure		T	T																				T				S	S			B			T	T		T	T	T	T	S					G	G	G	G	T	T	S																	S									T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.		.	.	.	.	.	350	.	.	.	.				.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.						.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.											.	.	.																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.											.	.	.																		.	.	.	.	.
Query Sequence		A	A	R	L	N	D	P	A	A	I	N	Q	Q	L	R	N	F	T	V	V	V	G	D	K	D	V	V	T	G	.	K	D	I	A	G	L	K	T	E	L	.	.	.	E	Q	K	K	I	N	F	D	Y	Q	E	Y	P	G	L	N	H	.	.	.	.	.	E	M	D	V	W	R	P	A	Y	A	A	F	V	Q	K
Query Conservation																															.											.	.	.																		.	.	.	.	.
Alig confidence																															.											.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	W	E	L	T	A	P	W	T	G	A	Q	V	K	V	P	T	K	F	I	V	G	E	F	D	L	V	Y	H	I	P	G	A	K	E	Y	I	H	N	G	G	F	K	K	D	V	P	L	L	E	E	V	V	V	L	E	G	A	A	H	F	V	S	Q	E	R	P	H	E	I	S	K	H	I	Y	D	F	I	Q	K
Template Known Secondary structure						T	G	G	G	T	T					S								T	T		G	G	G	G	S	T	T								S						S	T	T	B							T	T			S						S													T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions