Job Description P46923 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:04:40 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 598 % Identity 26% Template d1y5ia2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.90

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.												.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	G	K	I	L	T	A	G	R	W	G	A	M	N	V	E	V	K	D	G	K	I	V	S	S	T	G	A	L	A	K	T	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	L	Q	S	T	A	A	D	Q	V	H	T	T	A	R	I	Q	H	P	M	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	S	T	H	G	V	N	C	T	G	S	C	S	W	K	I	Y	V	K	N	G	L	V	T	W	E	T	Q	Q	T	D	Y	P	R	T	R	P	D	L	P	N	H	E	P	R	G	C	P	R	G	A	S	Y	S	W	Y	L	Y	S	A	N	R	L	K	Y	P	M	M	R	K	R	L	M	K	M	W	R	E	A	K
Template Known Secondary structure							S	S	S	S											T	T											S					T	T	S				T	T								T	G	G	G	G	G	T	S	T	T	B			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		46	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.
																									92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	Y	L	D	N	P	L	Q	P	A	K	G	R	G	E	D	T	Y	V	Q	V	S	W	E	Q	A	L	K	L	I	H	E	Q	H	D	R	I	R	K	A	N	G	P	S	A	I	F	A	G	S	Y	G	W	R	S	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	H	S	D	P	V	E	A	W	A	S	I	I	E	D	A	D	K	A	K	S	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	R	G	R	G	G	F	V	R	S	S	W	Q	E	V	N	E	L	I	A	A	S	N	V	Y	T	I	K	N	Y	G	P	D	R	V	A	G	F	S	P	I	P	A	M	S
Template Known Secondary structure		T	T		S	S										T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	S	S																									T		G	G	G								G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		126	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.											150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	L	H	K	A	Q	T	L	L	Q	R	Y	M	N	L	A	G	G	Y	S	G	H	S	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	M	P	H	V	V	G	S	V	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	P	L	I	L	E	N	S	Q	V	V	V	L	W	G	M	N	P	L	N	T	L	K	I	A	W	S	S	T
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.																	.															.	.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation									.	.	.																	.															.	.	.	.																																	.	.	.
Template Sequence		M	V	S	Y	A	S	G	.	.	.	A	R	Y	L	S	L	I	G	G	T	C	L	S	F	Y	D	.	W	Y	C	D	L	P	P	A	S	P	Q	T	W	G	.	.	.	.	E	Q	T	D	V	P	E	S	A	D	W	Y	N	S	S	Y	I	I	A	W	G	S	N	V	P	Q	T	R	T	P	D	A	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	.	.								T							T	T	.	T	T	T		S		T							S	.	.	.	.		S										T	T		S						S							S	G	G	G		.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.																	.															.	.	.	.																																	.	.	.
Template SS confidence
		196	.	.	.	200	.	.				.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.		.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.					.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.							.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	Q	G	L	E	Y	F	H	Q	L	K	K	S	G	K	P	V	I	A	I	D	P	I	R	S	E	T	I	E	F	F	D	D	N	A	T	W	I	A	P	N	M	G	T	D	V	A	L	M	L	G	I	A	H	T	L	M	T	Q	G	K	H	D	K	.	.	.	.	.	.	V	F	L	E	K	Y	T	T	G
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																													.	.	.																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																													.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	H	F	F	T	E	V	R	Y	K	G	T	K	T	V	A	V	T	P	D	Y	A	E	I	A	K	L	C	D	.	.	.	L	W	L	A	P	K	Q	G	T	D	A	A	M	A	L	A	M	G	H	V	M	L	R	E	F	H	L	D	N	P	S	Q	Y	F	T	D	Y	V	R	R	Y	T	D	M
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.							G	G	G	T								S	S							T	S	S	.	.	.							T	T																		T	T	T	S													B	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																													.	.	.
Template SS confidence
							265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.				.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	M	L	V	M	L	E	E	R	D	G	Y	Y	A	A	G	R	M	L	R	A	A	D	L	V	D	A	L	G	Q	E	N	N	P	E	W	K	T	V	A	F	N	T	N	G	E	M	V	A	P	N	G	S	I	G	F	R	W	G	E	K	G	K	W	N	L	E	Q	R	D	G	K	T	G	E	E	T	E	L	Q
Template Known Secondary structure		T	B								S	S	S								B	G	G	G	B	T	T	G	G	G			S	S	G	G	G		B				B	T	T	S					B	T	T	S	G	G	G	T	S	S	S		S			S		S	S	B	B	T	T	T			B			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
																																																											303	.	.	.	.	.													.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	Q	F	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	T	G	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	S	L	L	G	S	Q	D	E	I	A	E	V	G	F	P	Y	F	G	G	D	G	T	E	H	F	N	K	V	E	L	E	N	V	L	L	H	K	L	P	V	K	R	L	Q	L	A	D	G	S	T	A	L	V	T	T	V	Y	D	L	T	L	A	N	Y	G	L	E	R	G	L	N	D	V	N	C	A	T	S	Y
Template Known Secondary structure					T	T	S		S											T	T				T	T	S							S													B	T	T	S																T	T	B			S	S			T	T	S	B	S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.							.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	D	N	T	P	K	S	A	V	W	A	A	E	I	T	G	V	P	E	A	Q	I	V	K	L	A	E	L	M	A	.	.	.	.	.	.	A	N	R	T	M	L	M	A	G	W	G	I	Q	R	Q	Q	Y	G	E	Q	K	H	W	M	L	V	T	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	T	P	G	G	G	F	G	F
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	D	V	K	A	Y	T	P	A	W	A	E	Q	I	T	G	V	S	R	S	Q	I	I	R	I	A	R	E	F	A	D	N	A	D	K	T	H	G	R	S	M	I	I	V	G	A	G	L	N	H	W	Y	H	L	D	M	N	Y	R	G	L	I	N	M	L	I	F	C	G	C	V	G	Q	S	G	G	G	W	A	H
Template Known Secondary structure		T	S			T	T																															T	S												T	S	T	T															T	T		T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		497	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.																																																															.	400	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Y	H	Y	S	N	G	G	N	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	G	G	V	L	P
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	V	G	Q	E	K	L	R	P	Q	T	G	W	Q	P	L	A	F	A	L	D	W	Q	R	P	A	R	H	M	N	S	T	S	Y	F	Y	N	H	S	S	Q	W	R	Y	E	T	V	T	A	E	E	L	L	S	P	M	A	D	K	S	R	Y	T	G	H	L	I	D	F	N	V	R	A	E	R	M	G	W	L	P
Template Known Secondary structure			S	S					S	S										T	T	T	T		S															T	T	G	G	G	G					S	G	G	G	S		T	T	S		G	G	G	S		S												T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	M	S	A	A	I	A	G	H	A	S	E	A	A	D	D	G	G	M	T	A	I	P	V	A	R	I	V	D	A	L	E	N	P	G	G	K	Y	Q	H	N	G	K	E	Q	T	Y	P	N	I	K	M	I	W	W	A	G	G	G	N	F	T	H	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	A	P	Q	L	G	T	N	P	L	T	I	A	G	E	A	E	K	A	G	M	N	P	V	D	Y	T	V	K	S	L	K	E	G	S	I	R	F	A	A	E	Q	P	E	N	G	K	N	H	P	R	N	L	F	I	W	R	S	N	L	L	G	S	S	G	K	G	H	E	F	M	L	K	Y	L	L	G	T	E	H
Template Known Secondary structure			S	S		B	S	S		T	T	S								T	T	S													T	S	S		B	G	G	G		T	T	S	S	S	S	S								S			T	T	T	T	T		S	S								T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		657	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.
																		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	T	N	R	L	I	K	A	W	Q	K	P	E	M	I	V	V	S	E	C	Y	W	T	A	A	A	K	H	A	D	I	V	L	P	I	T	T	S	F	E	R	N	D	L	T	M	T	G	D	Y	S	N	Q	H	I	V	P	M	K	Q	A	V	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																		.	.
Template Conservation																																																																			.	.
Template Sequence		G	I	Q	G	K	D	L	G	Q	Q	G	G	V	K	P	E	E	V	D	W	Q	D	N	G	L	E	G	K	L	D	L	V	V	T	L	D	F	R	L	S	S	T	C	L	Y	S	D	I	I	L	P	T	A	T	W	Y	E	K	D	D	M	N	T	S	D	.	.	M	H	P	F	I	H	P	L	S	A	A	V	D
Template Known Secondary structure					S			T	T	T	T	T					S	S	S				S	S							S							S	B							T		S					B			T	T	S	S							S	.	.	S	S	S								S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Template SS confidence
		737	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.			.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	Q	F	E	A	R	N	D	F	D	V	F	A	D	L	A	E	L	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	A	W	E	A	K	S	D	W	E	I	Y	K	A	I	A	K	K	F	S	E	V	C	V	G	H	L	G	K	E	T	D	I	V	T	L	P	I	Q	H	D	S	A	A	E	L	A	Q	P	L	D	V	K	D	W	K	K	G	E	C	D	L	I	P	G	K	T	A	P	H	I	M	V	V	E	R	D	Y	P	A
Template Known Secondary structure			S	T	T		B																	T	T	T	T														T	T	S	G	G	G				S	S	S				G	G	G	T	S	S				B	T	T	T	B										G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		815	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.
																																											554	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	G	G	K	E	I	Y	T	E	G	K	D	E	M	A	W	L	K	F	F	Y	D	A	A	Q	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	Y	E	R	F	T	S	I	G	P	L	M	E	K	I	G	N	G	G	K	G	I	A	W	N	T	Q	S	E	M	D	L	L	R	K	L	N	Y	T	K	A	E	G	P	A	K	G	Q	P	M	L	N	T	A	I	D	A	A	E	M	I	L	T	L	A	P	E	T	N	G	Q	V	A	V	K	A	W	A	A	L
Template Known Secondary structure							T	B			T					T					T	T																		B			S	S	T	T	T	T	S	B	B			S													T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		895	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.
																581	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.			.	.	640	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	R	A	Q	R	V	T	M	P	M	F	N	A	F	W	Q	Q	N	K	L	I	E	M	R	H	S	E	K	N	E	Q	Y	V	R	Y	G	D	F	R	A	D	P	V	K	N	A	L	G	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	.	.	S	K	T	L	E	K	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	E	F	T	G	R	D	H	T	H	L	A	L	N	K	E	D	E	K	I	R	F	R	D	I	Q	A	Q	P	R	K	I	I	S	S	P	T	W	S	G	L	E	D	E	H	V	S	Y	N	A	G	Y	T	N	V	H	E	L	I	P	W	R	T	L	S	G	R	Q	Q	L	Y	Q	D	H	Q	W	M	R	D	F
Template Known Secondary structure						S	S			G	G	G	T	G	G	G	T	T		B									S								T	T	S	S	S				S	S	S				T	T											S	S	T	T	S	S	B						S						T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		975	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.
		645	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	Y	K	D	C	P	A	H	P	T	W	L	A	P	D	E	W	K	G	T	A	D
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.
Template Sequence		G	E	.	.	.	.	S	L	L	V	Y	R	P	P	I	D	T	R	S	V	K	E
Template Known Secondary structure		T		.	.	.	.	S	S												S	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.
Template SS confidence
		1055	.					.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.