Job Description P46923 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:04:40 GMT 2012 Rank 19 Aligned Residues 609 % Identity 25% Template d1vlfm2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 2.00

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.																			.	.	.	.	.	.					.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Query Sequence		G	K	I	L	T	A	G	R	W	G	A	M	N	V	E	V	K	D	G	K	I	V	S	S	T	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	K	T	I	P	.	.	.	.	N	S	L	Q	S	T	A	A	D	Q	V	H	T	T	A	R	I	Q	H	P	M	V	R	K	S
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		V	R	L	T	N	S	S	T	G	G	P	V	F	V	Y	V	K	D	G	K	I	I	R	M	T	P	M	D	F	D	D	A	V	D	A	P	S	W	K	I	E	A	R	G	K	T	F	T	P	P	R	K	T	S	I	A	P	Y	T	A	G	F	K	S	M	I	Y	S	D	L	R	I	P	Y	P	M	K	R	.	.
Template Known Secondary structure									T	T									T	T									B			T	T	T	S									T	T							S	B									T	T					T		T	T	B			S					.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	L	D	N	P	L	Q	P	A	K	G	R	G	E	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	V	Q	V	S	W	E	Q	A	L	K	L	I	H	E	Q	H	D	R	I	R	K	A	N	G	P	S	A	I	F	A	G	S	Y	G	W	R	S	S	G	V	L	H	K	A	Q
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	K	S	F	D	P	N	G	E	R	N	P	Q	L	R	G	A	G	L	S	K	Q	D	P	W	S	D	Y	E	R	I	S	W	D	E	A	T	D	I	V	V	A	E	I	N	R	I	K	H	A	Y	G	P	S	A	I	L	S	T	P	S	S	H	H	M	W	G	N	V	G	Y	R	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			T	T	S				G	G	G	T	T					T	T		G	G	G	G																								T		G	G	G							S				S		T	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200				.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.
Query Sequence		T	L	L	Q	R	Y	M	N	L	A	G	G	Y	S	G	H	S	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	M	P	H	V	V	G	S	V	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	.	.	.	P	L	I	L	E	N	S	Q	V	V	V	L	W	G	M	N	P	L	N	T	L	K	I	A	W	S	S	T	D	E	Q	G
Query Conservation																																															.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.																															.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		S	T	Y	F	R	F	M	N	M	M	G	F	T	Y	A	D	H	N	P	D	S	W	E	G	W	H	W	G	G	M	H	M	W	G	F	S	W	R	L	G	N	P	E	Q	Y	D	L	L	E	D	G	L	K	H	A	E	M	I	V	F	W	S	S	D	P	E	T	N	S	G	I	Y	A	G	F	E	S	N	.	.
Template Known Secondary structure		T																			T	T	T						T								G	G	G	T	T					T	T										S						S								S	S	S		T	T	T	T		.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.		260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		L	E	Y	F	H	Q	L	K	K	S	G	K	P	V	I	A	I	D	P	I	R	S	E	T	I	E	F	.	F	D	D	N	A	T	W	I	A	P	N	M	G	T	D	V	A	L	M	L	G	I	A	H	T	L	M	T	Q	G	K	H	D	K	V	F	L	E	K	Y	T	T	G	Y	P	Q	F	E	E	Y	L	T
Query Conservation																													.
Alig confidence		.																											.			.	.	.
Template Conservation		.																														.	.	.
Template Sequence		.	I	R	R	Q	W	L	K	D	L	G	V	D	F	V	F	I	D	P	H	M	N	H	T	A	R	L	V	A	D	.	.	.	K	W	F	S	P	K	I	G	T	D	H	A	L	S	F	A	I	A	Y	T	W	L	K	E	D	S	Y	D	K	E	Y	V	A	A	N	A	H	G	F	E	E	W	A	D	Y	V	L
Template Known Secondary structure		.									T	T								S	S										S	.	.	.							T	T																	T		S											S									T
Template Predicted Secondary structure		.																														.	.	.
Template SS confidence
			233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.				.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.						.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.
Query Sequence		G	K	S	D	N	T	P	K	S	A	V	W	A	A	E	I	T	G	V	P	E	A	Q	I	V	K	L	A	E	L	M	A	A	N	R	T	M	L	M	A	G	W	.	.	.	.	.	G	I	Q	R	Q	Q	Y	G	E	Q	K	H	W	M	L	V	T	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	T	P	G	G	G	F	G
Query Conservation																																												.	.	.	.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.																								.
Template Conservation																																																																								.
Template Sequence		G	K	T	D	G	T	P	K	T	C	E	W	A	E	E	E	S	G	V	P	A	C	E	I	R	A	L	A	R	Q	W	A	K	K	N	T	Y	L	A	A	G	G	L	G	G	W	G	G	A	C	R	A	S	H	G	I	E	W	A	R	G	M	I	A	L	A	T	M	Q	G	.	M	G	K	P	G	S	N	M	W
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	S																													S							T	T	T	T	S			G	G	G	S	S	T	T															T	T	.	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																								.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.		.	380	.	.	.	.	.	.	.
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.									.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	S	Y	H	Y	S	N	G	G	N	P	T	R	V	G	G	V	L	P	E	M	S	A	A	I	A	G	H	A	S	E	A	A	D	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	G	M	T	A	I	P	V	A	R	I	V	D	A	L	E	N	P	G	G	K	Y	Q	H	N	G	K	E	Q	T	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	T	T	Q	G	V	P	L	D	Y	E	F	Y	F	P	G	Y	A	E	G	G	I	S	G	D	C	E	N	S	A	A	G	F	K	F	A	W	R	M	F	D	G	K	T	T	F	P	S	P	S	N	L	N	T	S	A	G	Q	H	I	P	R	L	K	I	P	E	C	I	M	G	G	K	F	Q	W	S	G	K	G
Template Known Secondary structure			S	S	S						T	T	S					G	G	G		T	T	S			T	T	T	S	G	G	G	T	T								S	S	S							S	S	S	S	T	T	S					G	G	G								S								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
																					452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.			480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	N	I	K	M	I	W	W	A	G	G	G	N	F	T	H	H	Q	D	T	N	R	L	I	K	A	W	.	.	Q	K	P	E	M	I	V	V	S	E	C	Y	W	T	A	A	A	K	H	A	D	I	V	L	P	I	T	T	S	F	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	A	G	G	D	I	S	H	Q	L	H	Q	Y	E	Y	P	A	P	G	Y	S	K	I	K	M	F	W	K	Y	G	G	P	H	L	G	T	M	T	A	T	N	R	Y	A	K	M	Y	T	H	D	S	L	E	F	V	V	S	Q	S	I	W	F	E	G	E	V	P	F	A	D	I	I	L	P	A	C	T	N	F	E
Template Known Secondary structure		S			S	S	T	T	G	G	G						S		T	T											S							S	S	S	T							T	T		T	T									S	B	S		T	T	G	G	G		S					B			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.
		511	.	.	.												.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	N	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	M	T	G	D	Y	S	N	Q	H	I	V	P	M	K	Q	A	V	A	P	Q	F	E	A	R	N	D	F	D	V	F	A	D	L	A	E	L	L	K	P	G	G	K	E	I	Y	T	E	G	K	D	E	M	A	W	L	K	F	F	Y	D	A	A	Q	K
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.
Template Conservation																																																										.	.
Template Sequence		R	W	D	I	S	E	F	A	N	C	S	G	Y	I	P	D	N	Y	Q	L	C	N	H	R	V	I	S	L	Q	A	K	C	I	E	P	V	G	E	S	M	S	D	Y	E	I	Y	R	L	F	A	K	K	L	N	I	E	.	.	E	M	F	S	E	G	K	D	E	L	A	W	C	E	Q	Y	F	N	A	T	D	M
Template Known Secondary structure		S						T	T			B	T	T	B	T	T	G	G	G	G	S	S	S										S			S	T	T		B													T	T			.	.					T	T													T	S	S	G
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.
Template SS confidence
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.			.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.															.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	R	A	Q	R	V	T	M	P	M	F	N	A	F	W	Q	Q	N	K	L	I	E	M	R	H	S	E	K	N	E	Q	Y	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	G	D	F	R	A	D	P	V	K	N	A	L	G	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	K	T	L	E	K	F	G
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	K	Y	.	.	.	.	.	.	M	T	W	D	E	F	F	K	K	G	Y	F	V	V	P	D	N	P	N	R	K	K	T	V	A	L	R	W	F	A	E	G	R	E	K	D	T	P	D	W	G	P	R	L	N	N	Q	V	C	R	K	G	L	Q	T	T	T	G	K	V	E	F	I	A	T	S	L	K	N	F	E
Template Known Secondary structure		G	G	T	.	.	.	.	.	.																		T	T	S					T	T					T	T	S				S	S		S		S		G	G	G	S	B	T	T	B	S		S	S	T	T	S	S			S	B
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		626	.	.							.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		646	.						.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	K	.	.	.	.	.	D	C	P	A	H	P	T	W	L	A	P	D	E	W	K	G	T	A	D	E	K	Q	L	Q	L
Query Conservation				.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																						.	.	.
Template Sequence		E	Q	G	Y	I	D	E	H	R	P	S	M	H	T	Y	V	P	A	W	E	.	.	.	S	Q	K	H	S	P	L	A	V
Template Known Secondary structure			T	T				T	T	S		S	B							T	T	.	.	.	S	T	T	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.
Template SS confidence
		700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.				720	.	.	.	.	.	.	.	.