Job Description P46923 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:04:40 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 496 % Identity 19% Template d1h0ha2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.8

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		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.			.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.					.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.																		.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.																		.	.	.	.
Query Sequence		T	S	A	A	P	L	P	A	W	A	E	E	K	G	G	K	I	L	T	A	G	R	W	G	A	M	N	V	E	V	.	.	K	D	G	K	I	V	S	S	T	G	A	L	A	K	T	I	P	.	.	.	.	N	S	L	Q	S	T	A	A	D	Q	V	H	T	T	A	R	I	Q	H	P	M	V	R	K	S	Y	L
Query Conservation																																.	.																		.	.	.	.
Alig confidence																																.	.																		.	.	.	.																										.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		A	T	M	A	L	K	T	V	D	A	K	Q	T	T	S	V	C	C	Y	C	S	V	G	C	G	L	I	V	H	T	D	K	K	T	N	R	A	I	N	V	E	G	D	P	D	H	P	I	N	E	G	S	L	C	A	K	G	A	S	T	W	Q	L	A	E	N	E	R	R	P	A	N	P	L	Y	R	A	P	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	S								S	S	B	T	T										T	T	T										T	T		T	T	T	T	T								T						S		T	T	S		S	S						T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140									.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	N	P	L	Q	P	A	K	G	R	G	E	D	T	Y	V	Q	V	S	W	E	Q	A	L	K	L	I	H	E	Q	H	D	R	I	R	K	A	N	G	P	S	A	I	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	Y	G	W	R	S	S	G	V	L	H	K	A	Q	T	L	L	Q	R	Y	M	N	L	A	G	G
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S	D	Q	W	E	E	K	S	W	D	W	M	L	D	T	I	A	E	R	V	A	K	T	R	E	A	T	F	V	T	K	N	A	K	G	Q	V	V	N	R	C	D	G	I	A	S	V	G	S	A	A	M	D	N	E	E	C	W	I	Y	Q	A	W	L	R	S	L	G	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		S	S																														T	T	S								S							T	T	S															T	T	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	S	G	H	S	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	M	P	H	V	V	G	S	V	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	P	L	I	L	E	N	S	Q	V	V	V	L	W	G	M	N	P	L	N	T	L	K	I	A	W	S	S	T	D	E	Q	G	L	E	Y	F	H	Q	L	K	K	S	G	K	P	V	I
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Y	I	E	H	Q	A	R	I	H	S	A	T	V	A	A	L	A	E	S	Y	G	.	.	.	.	R	G	A	M	T	N	H	W	I	D	L	K	N	S	D	V	I	L	M	M	G	S	N	P	A	E	N	H	P	I	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	K	W	V	M	R	A	K	D	K	G	A	T	L	I
Template Known Secondary structure							G	G	G														S	.	.	.	.			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.									T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170					.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.									.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	D	P	I	R	S	E	T	I	E	F	F	D	D	N	A	T	W	I	A	P	N	M	G	T	D	V	A	L	M	L	G	I	A	H	T	L	M	T	Q	G	K	H	D	K	V	F	L	E	K	Y	T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.
Template Sequence		H	V	D	P	R	Y	T	R	T	S	T	K	C	D	.	.	.	L	Y	A	P	L	R	S	G	S	D	I	A	F	L	N	G	M	T	K	Y	I	L	E	K	E	L	Y	F	K	D	Y	V	V	N	Y	T	N	A	S	F	I	V	G	E	G	F	A	F	E	E	G	L	F	A	G	Y	N	K	E	T	R	K	Y
Template Known Secondary structure					S	S			T	T	G	G	G		S	.	.	.							T	T																T	T		S									B	G	G	G	B	B	B		T	T					T	T			T	T			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																.	.	.
Template SS confidence
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.				.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
																													303	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.						.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	P	Q	F	E	E	Y	L	T	G	K	S	D	N	T	P	K	S	A	V	W	A	A	E	I	T	G	V	P	E	A	Q	I	V	K	L	A	E	L	M	A	A	.	.	.	.	.	N	R	T	M	L	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	K	S	K	W	G	F	E	R	D	E	N	G	N	P	K	R	D	E	T	L	K	H	P	R	C	V	F	Q	I	M	K	K	H	Y	.	.	.	.	.	.	E	R	Y	D	L	D	K	I	S	A	I	C	G	T	P	K	E	L	I	L	K	V	Y	D	A	Y	C	A	T	G	K	P	D	K	A	G	T	I	M
Template Known Secondary structure			G	G	G	G		B		B		T	T	S		B		B		T	T	S		S	T	T	B										.	.	.	.	.	.	T	T																										G	G	G	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.							330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
		351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	W	G	I	Q	R	Q	Q	Y	G	E	Q	K	H	W	M	L	V	T	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	T	P	G	G	G	F	G	F	S	Y	H	Y	S	N	G	G	N	P	T	R	V	G	G	V	L	P	E	M	S	A	A	I	A	G	H	A	S	E	A	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	M	G	W	T	Q	H	T	V	G	V	Q	N	I	R	A	M	S	I	N	Q	L	L	L	G	N	I	G	V	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	E	A	N	V	Q	G	S	T	D	H	G	L	L	M	H	I	Y	P	G	Y	L	G	T	A	R	A	S	I	P	T	Y	E	E	Y	T	K	K	F	T	P
Template Known Secondary structure							S	S																		T	T		S	S	S	T	T		S						S	B	T	T							T	T		B	T	T			T	T	T					B	T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
																												421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	G	M	T	A	I	P	V	A	R	I	V	D	A	L	E	N	P	G	G	K	Y	Q	H	N	G	K	E	Q	T	Y	P	N	I	K	M	I	W	W	A	G	G	G	N	F	T	H	H	Q	D	T	N	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	S	K	D	P	Q	S	A	N	W	W	S	N	F	P	K	Y	S	A	S	Y	I	K	S	M	W	P	D	A	D	L	N	E	A	Y	G	Y	L	P	K	G	E	D	G	K	D	Y	S	W	L	T	L	F	D	D	M	F	Q	G	K	I	K	G	F	F	A	W	G	Q	N	P	A	C	S	G	A	N	S	N	K
Template Known Secondary structure						T	T				G	G	G	G														T	T	S									S			B		T	T				S										T	T									S							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.														.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	K	A	W	Q	K	P	E	M	I	V	V	S	E	C	Y	W	T	A	A	A	K	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	I	V	L	P	I	T	T	S	F	E	R	N	D	L	T	M	T	G	D	Y	S	N	Q	H	I	V	P	M	K	Q	A	V	A	P	Q	F	E	A	R	N	D
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.
Template Sequence		T	R	E	A	L	T	K	L	D	W	M	V	N	V	N	I	F	D	N	E	T	G	S	F	W	R	G	P	D	M	D	P	K	K	I	K	T	E	V	F	F	L	P	C	A	V	A	I	E	K	E	G	S	I	S	N	S	G	R	W	.	.	.	M	Q	W	R	Y	V	G	P	E	P	R	K	N	A	I	P	D
Template Known Secondary structure							T	T		S							S	S			T	T	T	T	G	G	G	S	T	T			G	G	G										B			G	G	G								T	T			.	.	.							S	S				T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.
Template SS confidence
		529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.				.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	D	V	F	A	D	L	A	E	L	L	K
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	D	L	I	V	E	L	A	K	R	V	Q
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.