Job Description P46923 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:04:40 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 573 % Identity 18% Template d1g8ka2 SCOP info Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 Resolution 1.64

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		27	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	60	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	P	A	W	A	E	E	K	G	G	K	I	L	T	A	G	R	W	G	A	M	N	V	E	V	K	D	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	S	S	T	G	A	L
Query Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	P	A	N	A	Q	R	T	N	M	T	C	H	F	C	I	V	G	C	G	Y	H	V	Y	K	W	P	E	L	E	E	G	G	R	A	P	E	Q	N	A	L	G	L	D	F	R	K	Q	L	P	P	L	A	V	T	L	T	P	A	M	T	N	V	V	T	E	H	D	G	A	R	Y	D	I	M	V	V	P	D	K
Template Known Secondary structure			B	T	T									S	S	B	T	T											T	T					S	S	G	G	G	B	T	T				T	T	S				T	T	S					G	G	G							T	T	S											T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		64	.	.	.	.					.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.						.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.															.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.															.	.	.	.	.
Query Sequence		A	K	T	I	P	.	.	.	.	N	S	L	Q	S	T	A	A	D	Q	V	H	T	T	.	.	.	.	.	A	R	I	Q	H	P	M	V	R	K	S	Y	L	D	N	P	L	Q	P	A	K	G	R	G	E	D	T	Y	V	Q	V	S	W	E	Q	A	L	K	L	I	H	E	Q	H	D	R	I	R	K	A	N	G
Query Conservation							.	.	.	.															.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.															.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	C	V	V	N	S	G	L	S	S	T	R	G	G	K	M	A	S	Y	M	Y	T	P	T	G	D	G	K	E	R	L	S	A	P	R	L	Y	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	W	V	D	T	T	W	D	H	A	M	A	L	Y	A	G	L	I	K	K	T	L	D	K	D	G
Template Known Secondary structure		T		T	T	T	T	T				T	T	G	G	G	G	G	G	G	S			S	S	S	T	T	T	T				S						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																								T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.															.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		135	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.		.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.
Query SS confidence																															.
Query Sequence		P	S	A	I	F	A	G	S	Y	G	W	R	S	S	G	V	L	H	K	A	Q	T	L	L	Q	R	Y	M	N	.	L	A	G	G	Y	S	G	H	S	G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	V	I	M	P	H	V	V	G	S	V	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	P	L	I	L	E	N	S	Q	V	V	V	L	W
Query Conservation																															.
Alig confidence																															.																											.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.
Template Sequence		P	Q	G	V	F	F	S	C	F	D	H	G	G	A	G	G	G	F	E	N	T	W	G	T	G	K	L	M	F	S	A	I	Q	T	P	M	V	R	I	H	N	R	P	A	Y	N	S	E	C	H	A	T	R	E	M	G	.	.	.	.	I	G	E	L	N	N	A	Y	E	D	A	Q	L	A	D	V	I	W	S	I
Template Known Secondary structure		G	G	G									S	S	T	T		S													T	T	T								T	T	B	S	S	S			T	T						T	T	.	.	.	.			S			S									S
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.					.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
		214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.										.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.									.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	M	N	P	L	N	T	L	K	I	A	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	D	E	Q	G	L	E	Y	F	H	Q	L	K	K	S	G	K	P	V	I	A	I	D	P	I	R	S	E	T	I	E	F	F	D	D	N	A	T	W	.	.	.	.	.	.	.	.	I	A	P	N	M	G	T	D	V	A
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	.			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.
Template Sequence		G	N	N	P	Y	E	S	Q	T	N	Y	F	L	N	H	W	L	P	N	L	Q	G	A	T	T	S	K	K	K	E	R	F	P	N	E	N	F	P	Q	A	R	I	I	F	V	D	P	R	E	T	P	S	V	A	I	A	R	.	.	.	H	V	A	G	N	D	R	V	L	H	L	A	I	E	P	G	T	D	T	A
Template Known Secondary structure		S							S							T							T	T	T									T	T													S	S										.	.	.					G	G	G								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.
Template SS confidence
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.				.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.								.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	M	L	G	I	A	H	T	L	M	T	Q	G	K	H	D	K	V	F	L	E	K	Y	T	T	G	Y	P	Q	F	E	E	Y	L	T	G	K	S	D	N	T	P	K	S	A	V	W	A	A	E	I	T	G	V	P	E	A	Q	I	V	K	L	A	E	L	M	A	A	N	R	.	.	.	.	.	.	.	T	M	L
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	F	N	G	L	F	T	Y	V	V	E	Q	G	W	I	D	K	P	F	I	E	A	H	T	K	G	F	D	D	A	V	K	T	N	.	.	.	.	.	.	.	R	L	S	L	D	E	C	S	N	I	T	G	V	P	V	D	M	L	K	R	A	A	E	W	S	Y	K	P	K	A	S	G	Q	A	P	R	T	M	H
Template Known Secondary structure														T		S																			T	.	.	.	.	.	.	.																											S			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.								.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	A	G	W	G	I	Q	R	Q	Q	Y	G	E	Q	K	H	W	M	L	V	T	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	T	P	G	G	G	F	G	F	S	Y	H	Y	S	N	G	G	N	P	T	R	V	G	G	V	L	P	E	M	S	A	A	I	A	G	H	A	S	E	A	A	D	D	G	G	M	T	A	I	P	V
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Y	E	K	G	I	I	W	G	N	D	N	Y	V	I	Q	S	A	L	L	D	L	V	I	A	T	H	N	V	G	R	R	G	T	G	C	V	R	M	G	G	H	Q	E	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	T	R	P	P	Y	P	G	D	K	K	I	Y	I	D	Q	E	L	I	K	G	K	G	R	I	M	T	W
Template Known Secondary structure									T	S	T	T															T	T		S	S	S	T	T								S	B		B			.	.	.	.	.	.	.						S		S	S										T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.								.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.		.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.
Query SS confidence																																																								.
Query Sequence		A	R	I	V	D	A	L	E	N	P	G	G	K	Y	Q	H	N	G	K	E	Q	T	Y	P	N	I	K	M	I	W	W	A	G	G	G	N	F	T	H	H	Q	D	T	N	R	L	I	K	A	W	Q	K	P	E	.	M	I	V	V	S	E	C	Y	W	T	A	A	A	K	H	A	D	I	V	L	P	I	T	T	S
Query Conservation																																																								.
Alig confidence																										.																														.
Template Conservation																										.
Template Sequence		W	G	C	N	N	F	Q	T	S	N	N	A	Q	A	L	R	E	A	I	L	Q	R	S	A	.	I	V	K	Q	A	M	Q	K	A	R	G	A	T	T	E	E	M	V	D	V	I	Y	E	A	T	Q	N	G	G	L	F	V	T	S	I	N	L	Y	P	T	K	L	A	E	A	A	H	L	M	L	P	A	A	H	P
Template Known Secondary structure			S							S	T	T														.								T		S	S															T	T	T									S	S			G	G	G	G	T		S					B			B
Template Predicted Secondary structure																										.
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.		.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.											.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	E	R	N	D	L	T	M	T	G	D	Y	S	N	Q	H	I	V	P	M	K	Q	A	V	A	P	Q	F	E	A	R	N	D	F	D	V	F	A	D	L	A	E	L	L	K	P	G	G	K	E	I	Y	T	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	D	E	M	A	W	L	K	F	F	Y	D	A	A	Q
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.
Template Sequence		G	E	M	N	L	T	S	M	N	G	E	R	R	.	.	.	I	R	L	S	E	K	F	M	D	P	P	G	T	A	M	A	D	C	L	I	A	A	R	I	A	N	A	L	R	D	M	Y	Q	K	D	G	K	A	E	M	A	A	Q	F	E	G	F	D	W	K	T	E	E	D	A	F	N	D	G	F	R	R	A	G
Template Known Secondary structure		T	T	B							T	T			.	.	.								S			S	T	T		B																				T	T								T		S				S	S								T	G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.
Template SS confidence
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.				.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
		579	580	.	.	.	.								.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	A	R	A	Q	.	.	.	.	.	.	.	R	V	T	M	P	M	F	N	A	F	W	Q	Q	N	K	L	I	E	M	R	H	S	E	K	N	E	Q	Y	V	R	Y	G	D	F	R	A	D	P	V	K	N	A	L	G	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	P	G	A	P	A	I	D	S	Q	G	G	S	T	G	H	L	V	T	Y	D	R	L	R	K	S	G	N	N	G	V	Q	L	P	V	V	S	W	D	E	S	K	G	L	V	G	T	E	M	L	Y	T	E	G	K	F	D	T	D	D	G	K	A	H	F	K	P
Template Known Secondary structure			T	T							T	T	G	G	G	G	G	G										G	G	G				S	S						T	T	T						S		S		T	T	S			S	S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.