Job Description P46923 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:04:40 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 705 % Identity 20% Template c2vpyE_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: E: PDB Molecule:thiosulfate reductase; PDBTitle: polysulfide reductase with bound quinone inhibitor,2 pentachlorophenol (pcp) Resolution 2.50 Å

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		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.					.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.	.	.
Query Sequence		P	A	W	A	E	E	K	G	G	K	I	L	T	A	G	R	W	G	A	M	N	V	E	V	K	D	G	K	I	V	S	S	T	G	A	L	A	K	T	I	P	.	.	.	.	N	S	L	Q	S	T	A	A	D	Q	V	H	T	T	A	R	I	Q	H	P	M	V	R	K	S	Y	L	D	N	P	L	Q	P	A	K
Query Conservation																																											.	.	.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	E	V	K	S	V	Y	Q	I	C	E	G	C	F	W	R	C	G	I	V	A	H	A	V	G	N	R	V	Y	K	V	E	G	Y	E	A	N	P	K	S	R	G	R	L	C	P	R	G	Q	G	A	P	Q	T	T	Y	D	P	D	R	L	K	R	P	L	I	R	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S
Template Known Secondary structure		S	S											S	S	T	T									S	S	S									T	T	S	T	T	T	T	T									G	G	G	G	G	G		T	T	S			S						T	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.									.	.
		104	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.			.	.	.	.	.	180	.
Predicted Secondary structure																																																																									.	.
Query SS confidence																																																																									.	.
Query Sequence		G	R	G	E	D	T	Y	V	Q	V	S	W	E	Q	A	L	K	L	I	H	E	Q	H	D	R	I	R	K	A	N	G	P	S	A	I	F	A	G	S	Y	G	W	R	S	S	G	V	L	H	K	A	Q	T	L	L	Q	R	Y	M	N	L	A	G	G	Y	S	G	H	S	G	D	.	.	Y	S	T	G	A	A	Q
Query Conservation																																																																									.	.
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	R	G	E	G	K	Y	R	V	A	T	W	E	E	A	L	D	H	I	A	K	K	M	L	E	I	R	E	K	Y	G	P	E	A	I	A	F	F	G	H	G	.	.	.	.	.	.	.	T	G	D	Y	W	F	V	D	F	L	P	A	A	W	G	S	P	N	A	A	K	P	S	V	S	L	C	T	A	P	R	E
Template Known Secondary structure			S	S	S																												G	G	G	S						S	.	.	.	.	.	.	.	T	T					T	T	T					T	T											T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.								.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	I	M	P	H	V	V	G	S	V	E	V	Y	E	Q	Q	T	S	W	P	L	I	L	E	N	S	Q	V	V	V	L	W	G	M	N	P	L	N	T	L	K	I	A	W	S	S	T	D	E	Q	G	L	E	Y	F	H	Q	L	K	K	S	G	K	P	V	I	A	I	D	P	I	R	S	E	T	I	E	F	F	D
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	A	S	Q	W	V	F	G	.	.	.	.	R	P	I	G	G	H	E	P	I	D	W	E	N	A	R	Y	I	V	L	I	G	H	H	I	G	E	D	T	H	N	T	Q	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	D	F	A	L	A	L	K	N	G	A	K	V	V	V	V	D	P	R	F	S	T	A	A	A	K	A	H
Template Known Secondary structure								S	S	.	.	.	.	S				S	S			B		G	G	G		S						S			B	T	T	B						.	.	.	.	.	.	.										T	T								S	B			T	T	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.					.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.								.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	N	A	T	W	I	A	P	N	M	G	T	D	V	A	L	M	L	G	I	A	H	T	L	M	T	Q	G	K	H	D	K	V	F	L	E	K	Y	T	T	G	Y	P	Q	F	E	E	Y	L	T	G	K	S	D	N	T	P	K	S	A	V	W	A	A	E	I	T	G	V	P	E	A	Q	I	V	K	L	A	E	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																																															.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	R	W	L	P	I	K	P	G	T	D	T	A	L	L	L	A	W	I	H	V	L	I	Y	E	D	L	Y	D	K	E	Y	V	A	K	Y	T	V	G	F	E	E	L	K	A	H	V	.	.	.	.	.	.	K	D	F	T	P	E	W	A	E	K	H	T	E	I	P	A	Q	V	I	R	E	V	A	R	E
Template Known Secondary structure		.	.	.							T	T																T	T		S												T	T	T					T	.	.	.	.	.	.	T	T												S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.							.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		342	.	.	.	.			.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.
Query SS confidence							.	.
Query Sequence		M	A	A	N	R	.	.	T	M	L	M	A	G	W	G	I	Q	R	Q	Q	Y	G	E	Q	K	H	W	M	L	V	T	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	T	P	G	G	G	F	G	F	S	Y	H	Y	S	N	G	G	N	P	T	R	V	G	G	V	L	P	E	M	S	A	A	I	A	G	H	A	S	E	A	A
Query Conservation							.	.
Alig confidence							.	.																																																																								.	.
Template Conservation																																																																																.	.
Template Sequence		M	A	A	H	K	P	R	A	V	L	P	P	T	R	H	N	V	W	Y	G	D	D	T	Y	R	V	M	A	L	L	Y	V	N	V	L	L	G	N	Y	G	R	P	G	G	F	Y	I	A	Q	S	P	Y	L	E	K	Y	P	L	P	P	L	P	L	E	P	A	A	G	G	C	S	G	P	S	G	G	D	H	.	.
Template Known Secondary structure					T	T	T	S							S				S	T	T																T	T		B	T	S	T	T	S	B				B													S						S			S	S		S	T	T	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	D	G	G	M	T	A	I	P	V	A	R	I	V	D	A	L	E	N	P	G	G	K	Y	Q	H	N	G	K	E	Q	T	Y	P	N	I	K	M	I	W	W	A	G	G	G	N	F	T	H	H	Q	D	T	N	R	L	I	K	A	W	Q	K	P	E	M	I	V	V	S	E	C	Y	W	T	A	A	A	K	H	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	P	E	G	F	K	P	R	A	D	K	G	K	F	F	A	R	S	T	A	I	Q	E	L	I	E	P	M	I	T	G	E	P	Y	P	I	K	G	L	F	A	Y	G	I	N	L	F	H	S	I	P	N	V	P	R	T	K	E	A	L	K	N	L	D	L	Y	V	A	I	D	V	L	P	Q	E	H	V	M	W	A
Template Known Secondary structure		S	S	S	S	S	S			T	T	T	T	S	S	S	S	S	S			G	G	G	T	T	S							S	S									S							S	S													S							S	S							T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	V	L	P	I	T	T	S	F	E	R	N	D	L	T	M	T	G	D	Y	S	N	Q	H	I	V	P	M	K	Q	A	V	A	P	Q	F	E	A	R	N	D	F	D	V	F	A	D	L	A	E	L	L	K	P	G	G	K	E	I	Y	T	E	G	K	D	E	M	A	W	L	K	F	F	Y	D	A	A	Q	K
Query Conservation
Alig confidence																																																														.	.	.																.	.
Template Conservation																																																														.	.	.																.	.
Template Sequence		D	V	I	L	P	E	A	T	Y	L	E	R	Y	D	D	F	V	L	V	A	H	K	T	P	F	I	Q	L	R	T	P	A	H	E	P	L	F	D	T	K	P	G	W	W	I	A	R	E	L	G	L	R	L	G	L	E	Q	Y	F	P	.	.	.	W	K	T	I	E	E	Y	L	E	T	R	L	Q	S	L	.	.
Template Known Secondary structure		S					B			G	G	G										B	S	S									S	S				S	S		B												T	T	T		T	T	T			.	.	.		S											T	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.																.	.
Template SS confidence
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.				.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	R	A	Q	R	V	T	M	P	M	F	N	A	F	W	Q	Q	N	K	L	I	E	M	R	H	S	E	K	N	E	Q	Y	V	R	Y	G	D	F	R	A	D	P	V	K	N	A	L	G	T	P	S	G	K	I	E	I	Y	S	K	T	L	E	K	F	G	Y	K	D	C	P	A	H	P	T	W	L	A	P	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	D	L	E	T	M	K	G	M	G	T	L	V	Q	R	G	K	P	W	L	E	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	E	G	R	L	P	F	G	T	A	S	G	K	I	E	L	Y	C	Q	R	F	K	E	A	G	H	Q	P	L	P	V	F	T	P	P	E	E	P	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	T										S									S					.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T				S	S	S	S	S			S	S							S	S	S	S			S											.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.																																								.
Template SS confidence
										552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.									.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
		660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.			.	.	730	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.
Query SS confidence																																																																						.	.
Query Sequence		E	W	K	G	T	A	D	E	K	Q	L	Q	L	L	T	A	H	P	A	H	R	L	H	S	Q	L	N	Y	A	E	L	R	K	K	Y	A	I	A	D	R	E	P	I	T	I	H	T	E	D	A	A	R	F	G	I	A	N	G	D	L	V	R	V	W	N	K	R	G	.	.	Q	I	L	T	G	A	V	V	T	D
Query Conservation																																																																						.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																													.	.																																	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	P	E	G	F	Y	R	L	L	Y	G	R	S	P	V	H	T	F	A	R	T	Q	N	N	W	V	L	M	E	.	.	M	D	P	E	N	E	V	W	I	H	K	E	E	A	K	R	L	G	L	K	E	G	D	Y	V	M	L	V	N	Q	D	G	V	K	E	G	P	V	R	V	K	P	T	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.		T	T							B			T	T			G	G	G	G	T	T							.	.				S													T	T			T	T								T	T	S												S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																													.	.
Template SS confidence
								615	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.			.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.
		738	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.				.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.
Query Sequence		G	I	K	K	G	V	V	C	V	H	E	G	A	W	P	D	L	E	.	.	.	N	G	L	C	K	N	G	S	A	N	V	L	T	A	D	I	P	S	S	Q	L	A	N	A	C	A	G	N	S	A	L	V	Y	I	E	K	Y	T	G	N	A	P	K	L	T	A
Query Conservation																				.	.	.
Alig confidence																				.	.	.																																								.	.
Template Conservation																																																														.	.
Template Sequence		R	I	R	K	D	C	V	Y	I	V	H	G	F	G	H	K	A	P	L	M	R	L	A	H	G	R	G	A	S	D	N	Y	L	Q	T	R	Y	K	L	D	P	I	S	G	G	A	G	L	R	V	N	F	V	R	L	E	K	A	E	R	.	.	P	R	L	P	S
Template Known Secondary structure		S	B		T	T	B		B		B	T	T						T	T	S	T	T	T	T	T		S														S	S	S						T	T											.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.
Template SS confidence
		687	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.			.	.	.	750	.