Job Description P10441 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:32:17 GMT 2012 Rank 15 Aligned Residues 354 % Identity 12% Template d1rzua_ SCOP info UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase Glycosyl transferases group 1 Resolution 2.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		7	.	.	10	.	.	.	.	.							.	.	.		.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.				.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.				.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	T	I	A	L	V	A	G	E	.	.	.	.	.	.	T	S	G	.	D	I	L	G	A	G	L	I	R	A	L	K	E	H	V	P	N	A	R	F	V	G	V	A	G	P	R	M	Q	A	E	G	C	E	A	W	Y	E	M	E	E	L	A	V	M	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation											.	.	.	.	.	.				.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.				.																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	N	V	L	S	V	S	S	E	I	Y	P	L	I	K	T	G	G	L	A	D	V	V	G	A	L	P	I	A	L	E	A	H	G	V	R	T	R	T	L	I	P	G	Y	P	A	V	K	A	A	V	T	D	P	V	K	C	F	E	F	T	D	L	L	G	E	K	A	D	L	L	E	V	Q	H	E	R	L	D	L
Template Known Secondary structure									S		B	T	T	T	B		S	S															T	T	T																			S								S		S	S	S											T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
																										65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.		.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	E	V	L	G	R	L	R	R	L	L	H	I	R	A	D	L	T	K	R	F	G	E	L	K	P	D	V	F	V	G	I	D	.	A	P	D	F	N	I	T	L	E	G	N	L	K	K	Q	G	I	K	T	I	H
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation
Template Sequence		L	I	L	D	A	P	A	Y	Y	E	R	S	G	G	P	Y	L	G	Q	T	G	K	D	Y	P	D	N	W	K	R	F	A	A	L	S	L	A	A	A	R	I	G	A	G	V	L	P	G	W	R	P	D	M	V	H	A	H	D	W	Q	A	A	M	T	P	V	Y	M	R	Y	A	E	T	P	E	I	P	S	L	L
Template Known Secondary structure												S	S	S		S	S	B		T	T	S	S	B		T	T																	T	T		S	S	S				S										T	T								S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
		120	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.														.	.	160
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	V	S	P	S	V	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	R	Q	K	R	V	F	K	I	G	R	A	T	D	L	V	L	A	F	L	P	F	E	K	A	F	Y	D	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	V	P
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	I	H	N	I	A	F	Q	G	Q	F	G	A	N	I	F	S	K	L	A	L	P	A	H	A	F	G	M	E	G	I	E	Y	Y	N	D	V	S	F	L	K	G	G	L	Q	T	A	T	A	L	S	T	V	S	P	S	Y	A	E	E	I	L	T	A	E	F	G	M	G	L	E	G	V	I	G	S	R	A	H	V
Template Known Secondary structure				S		T	T							G	G	G	G	G	G	S				G	G	G	S	S	T	T	T	T			T	T													S					S								T	T	S					T	T							T	T	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	R	F	I	G	H	T	M	A	D	A	M	P	L	D	P	D	K	N	A	A	R	D	V	L	G	I	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	D	A	H	C	L	A	L	L	P	G	S	R	G	A	E	V	E	M	L	S	A	D	F	L	K	T	A	Q	L	L	R	Q	T	Y
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	H	G	I	V	N	G	I	D	A	D	V	W	N	P	A	T	D	H	L	I	H	D	N	Y	S	A	A	N	L	K	N	R	A	L	N	K	K	A	V	A	E	H	F	R	I	D	D	D	G	S	P	L	F	C	V	I	S	R	L	T	W	Q	K	G	I	D	L	M	A	E	A	V	D	E	I	V	S	L	G
Template Known Secondary structure									B		T	T	T	S		T	T	T		T	T	S	S	S			B	T	T	B		T	T													T				S	S	S							S		B	S	T	T	T	T						T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280						.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.																														.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.																														.	.	.	.	.
Query Sequence		P	D	L	E	I	V	V	P	L	V	N	A	K	R	R	E	Q	F	E	R	I	K	A	E	V	A	P	D	.	L	S	V	H	L	L	D	G	M	G	R	E	A	M	V	A	S	D	A	A	L	L	A	S	G	T	A	A	L	.	.	.	.	.	E	C	M	L	A	K	C	P	M	V	V	G	Y	R	M	K	P
Query Conservation																														.																														.	.	.	.	.
Alig confidence																														.																														.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	R	L	V	V	L	G	A	G	D	V	A	L	E	G	A	L	L	A	A	A	S	R	H	H	G	R	V	G	V	A	I	G	Y	N	E	P	L	S	H	L	M	Q	A	G	C	D	A	I	I	I	P	S	R	F	E	P	C	G	L	T	Q	L	Y	A	L	R	Y	G	C	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										B															T	T	T	T						S														S							S			S	S		S									T			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320								.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.				.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Query Sequence		F	T	F	W	L	A	K	R	L	V	K	T	D	Y	V	S	L	P	N	L	L	A	G	.	.	.	.	.	.	.	R	E	L	V	K	E	L	L	Q	E	E	C	E	P	Q	K	L	A	A	A	L	L	P	L	L	A	.	.	.	N	G	K	T	S	H	A	M	H	D	T	F	R	E	L	H	Q	Q	I	R	C
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	V	A	R	T	G	G	L	A	D	T	V	I	D	A	N	H	A	A	L	A	S	K	A	A	T	G	V	Q	F	S	P	V	T	L	D	G	L	K	Q	A	I	R	R	T	V	R	Y	Y	H	D	P	K	L	W	T	Q	M	Q	K	L	G	M	K	.	.	.	.	.	S	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.					S	S									B								T	T				B				S	S		S																T														T	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																																																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
										392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.						.	.
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	D	E	Q	A	A	Q	A	V	L	E	L	A	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		V	S	W	E	K	S	A	G	L	Y	A	A	L	Y	S
Template Known Secondary structure			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		459	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.