Job Description P23872 Confidence 99.54% Date Thu Jan 5 11:40:10 GMT 2012 Rank 122 Aligned Residues 247 % Identity 16% Template d1hlga_ SCOP info alpha/beta-Hydrolases alpha/beta-Hydrolases Gastric lipase Resolution 3.00

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		58	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70				.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.		.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.				.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130
Predicted Secondary structure															.	.	.												.																									.	.	.
Query SS confidence															.	.	.												.																									.	.	.
Query Sequence		M	A	T	R	A	Y	M	V	P	T	K	Y	G	.	.	.	Q	V	E	T	R	L	F	C	P	Q	P	.	D	S	P	A	T	L	F	Y	L	H	G	G	G	F	I	L	G	N	L	D	T	H	D	R	.	.	.	I	M	R	L	L	A	S	Y	S	Q	C	T	V	I	G	I	D	Y	T	L	S	P	E	A	R
Query Conservation															.	.	.												.																									.	.	.
Alig confidence															.	.	.												.																									.	.	.									.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		Y	P	N	E	E	Y	E	V	V	T	E	D	G	Y	I	L	E	V	N	R	I	P	Y	G	K	K	N	S	G	Q	R	P	V	V	F	L	Q	H	G	L	L	A	S	A	T	N	W	I	S	N	L	P	N	N	S	L	A	F	I	L	A	D	A	.	G	Y	D	V	W	L	G	N	S	R	G	N	T	W	A	R
Template Known Secondary structure												T	T	S	B									S		S	S	T	T												T	T			G	G	G	G	G	S	S		T	T	S									T	.	T									T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.		.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.
		131	.	.	.																		.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	P	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	E	I	V	A	A	C	C	Y	F	H	Q	Q	A	E	D	Y	Q	I	N	M	S	R	I	G	F	A	G	D	S	A	G	A	M	L	A	L	A	S	A	L	W	L	R	D	K	Q	I	D	C	G	K	V	A	G	V	L	L
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.																															.	.	.
Template Sequence		R	N	L	Y	Y	S	P	D	S	V	E	F	W	A	F	S	F	D	E	M	A	K	Y	D	L	P	A	T	I	D	F	I	V	K	K	.	.	.	.	.	T	G	Q	K	Q	L	H	Y	V	G	H	S	Q	G	T	T	I	G	F	I	A	F	S	T	N	P	S	L	A	K	.	.	.	R	I	K	T	F	Y	A
Template Known Secondary structure			B	S	S	S		T	T	S	T	G	G	G										T													.	.	.	.	.				S								T																		T	.	.	.	T
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.																															.	.	.
Template SS confidence
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.						.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.				.	.	.	.	.	.	.
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Y	G	L	Y	G	L	R	D	S	V	T	R	R	L	L	G	G	V	W	D	G	L	T	Q	Q	D	L	Q	M	Y	E	E	A	Y	L	S	N	D	A	D	R	E	S	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	A	P	V	A	T	V	K	Y	T	K	S	L	I	N	K	L	R	F	V	P	Q	S	L	F	K	F	I	F	G	D	K	I	F	Y	P	H	N	F	F	D	Q	F	L	A	T	E	V	C	S	R	E	M	L	N	L	L	C	S	N	A	L	F	I	I	C	G	F	D	S	K	N	F	N	T	S	R	L	D	V
Template Known Secondary structure			S			S			S	S			S	G	G	G	G	G	G	G												S	S	B				T	T	T	T	T	T	S										S						T												T	T	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.
																																												239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.			.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	C	L	F	N	N	D	L	T	R	E	V	P	P	C	F	I	A	G	A	E	F	D	P	L	L	D	.	.	D	S	R	L	L	Y	Q	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	L	S	H	N	P	A	G	T	S	V	Q	N	M	F	H	W	T	Q	A	V	K	S	G	K	F	Q	A	Y	D	W	G	S	P	V	Q	N	R	M	H	Y	D	Q	S	Q	P	P	Y	Y	N	V	T	A	M	N	V	P	I	A	V	W	N	G	G	K	D	L	L	A	D	P	Q	D	V	G	L	L	L	P	K
Template Known Secondary structure				T	T			S			B															S		B					S	S									S	S	S	S			B			G	G	G			S								T	T		S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	A	H	Q	Q	P	C	E	F	K	L	Y	P	G	T	L	H	A	F	L	H	Y	S	R	M	M	K	T	A	D	E	A	L	R	D	G	A	Q	F	F	T	A	Q
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.																										.	.
Template Conservation			.	.	.																										.	.
Template Sequence		L	.	.	.	P	N	L	I	Y	H	K	E	I	P	F	Y	N	H	L	D	F	I	W	A	M	D	A	P	Q	.	.	E	V	Y	N	D	I	V	S	M	I	S	E	D
Template Known Secondary structure			.	.	.	T	T								T	T			T	T						T	T				.	.		T									T	T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.																										.	.
Template SS confidence
		339				340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.			.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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