Job Description P23872 Confidence 99.39% Date Thu Jan 5 11:40:10 GMT 2012 Rank 140 Aligned Residues 246 % Identity 10% Template c3i1iA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:homoserine o-acetyltransferase; PDBTitle: x-ray crystal structure of homoserine o-acetyltransferase from2 bacillus anthracis Resolution 2.44 Å

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		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.						.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	P	E	M	A	T	R	A	Y	M	V	P	T	K	Y	G	Q	V	E	T	R	L	F	C	.	.	.	.	.	P	Q	P	D	S	P	A	T	L	F	Y	L	H	G	G	G	F	I	L	G	N	L	D	T	H	D	R	I	M	R	L	L	A	S	Y	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.											.	.	.	.	.																	.	.	.																	.		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.																																.	.	.																	.
Template Sequence		K	K	E	K	F	I	L	K	E	Y	T	F	E	N	.	G	R	T	I	P	V	Q	X	G	Y	E	T	Y	G	T	L	N	R	E	R	S	N	V	I	L	I	C	H	Y	F	S	.	.	.	A	T	S	H	A	A	G	K	Y	T	A	H	D	E	E	S	.	G	W	W	D	G	L	I	G	P	G	K	A	I	D
Template Known Secondary structure														T	T	.	S													S				T	T											T	T	.	.	.			S			S	S		S	S	T	T		S	S		.		T	T	T	T	T			T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																.																																.	.	.																	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.		.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.				50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.		.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
					116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	C	T	V	I	G	I	D	Y	T	L	S	P	E	A	R	F	P	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	E	I	V	A	A	C	C	Y	F	H	Q	Q	A	E	D	Y	Q	I	N	M	S	R	I	G	F	A	G	D	S	A	G	A
Query Conservation		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.
Template Sequence		T	N	Q	Y	F	V	I	C	T	D	N	L	C	N	V	Q	V	K	N	P	H	V	I	T	T	G	P	K	S	I	N	P	K	T	G	D	E	Y	A	X	D	F	P	V	F	T	F	L	D	V	A	R	X	Q	C	E	L	I	K	D	.	.	.	.	.	X	G	I	A	R	L	H	A	V	X	G	P	S	A	G
Template Known Secondary structure		T	T	T									T	T		S		T	T	S	T	T					S	T	T	S	B		T	T	T	S	S	B		G	G	G	S																			.	.	.	.	.	T	T				B	S						T
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.						140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		169	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	L	A	L	A	S	A	L	W	L	R	D	K	Q	I	D	C	G	K	V	A	G	V	L	L	W	Y	G	L	Y	G	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.
Template Sequence		G	X	I	A	Q	Q	W	A	V	H	.	.	.	.	.	Y	P	H	X	V	E	R	X	I	G	V	I	T	N	P	Q	N	P	I	I	T	S	V	N	V	A	Q	N	A	I	E	A	I	R	L	D	P	S	W	K	G	G	K	Y	G	E	E	Q	P	X	K	G	L	Q	L	A	N	R	X	X	F	X	N	A	F
Template Known Secondary structure												.	.	.	.	.		T	T	T	B	S						S			S	B									T	T										S	G	G	G	G	G	G			T	T	S															T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.						.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																											202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	V	T	R	R	L	L	G	G	V	W	D	G	L	T	Q	Q	D	L	Q	M	Y	E	E	A	Y	L	S	N	D	A	D	R	E	S	P	Y	Y	C	L	F	N	N	D	L	T	R	E	V	P	P	C	F	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	H	F	Y	E	T	T	Y	P	R	N	S	I	E	V	E	P	Y	E	K	V	S	S	L	T	S	F	E	K	E	I	N	K	L	T	Y	R	S	I	E	L	V	D	A	N	S	W	X	Y	T	A	K	A	V	L	L	H	D	I	A	H	G	F	S	S	L	E	E	A	L	S	N	V	E	A	N	V	L	X
Template Known Secondary structure										S				S	S			G	G	G	T		T	T																T	T	T	T																	B	T	T	T	T	S	S								T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.			.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.																								.
Query SS confidence												.	.																								.
Query Sequence		A	G	A	E	F	D	P	L	L	D	.	.	D	S	R	L	L	Y	Q	T	L	A	A	H	Q	Q	P	C	E	F	K	L	Y	P	G	.	T	L	H	A	F	L	H	Y	S	R	M	M	K	T	A	D	E	A	L	R	D	G	A	Q	F	F	T	A	Q	L
Query Conservation												.	.																								.
Alig confidence												.	.																								.							.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	C	K	Q	D	L	L	Q	P	S	R	Y	N	Y	K	X	V	D	L	L	Q	K	Q	G	K	Y	A	E	V	Y	E	I	E	S	I	N	G	H	X	A	G	.	.	.	.	.	V	F	D	I	H	L	F	E	K	K	V	Y	E	F	L	N	R	K	V
Template Known Secondary structure				B	T	T		S	S	S		T													T	T								B			T	T	G	G	G			.	.	.	.	.				G	G	G	T										S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.						.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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