Job Description P0A698 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:02:38 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 454 % Identity 34% Template c3g5uB_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: B: PDB Molecule:multidrug resistance protein 1a; PDBTitle: structure of p-glycoprotein reveals a molecular basis for2 poly-specific drug binding Resolution 3.80 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.									.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	I	E	V	R	G	A	R	T	H	N	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	N	I	N	L	V	I	P	R	D	K	L	I	V	V	T	G	L	S	G	S	G	K	S	S	L	A	F	D	T	L	Y	A	E	G	Q	R	R	Y	V	E	S	L	S	A	Y	A	R	Q	F	L	S	L	M	E	K	P	D	V
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	L	E	F	K	N	I	H	F	S	Y	P	S	R	K	E	V	Q	I	L	K	G	L	N	L	K	V	K	S	G	Q	T	V	A	L	V	G	N	S	G	C	G	K	S	T	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	M	Q	R	L	Y	D	P	L	D
Template Known Secondary structure														S	S	T	T	S			S										T	T									S	S	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T	S	S			S
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		386	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
		74	.	.													.	.	.	80	.	.	.	.		.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Query Sequence		D	H	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	L	S	P	A	I	S	.	I	E	Q	K	S	T	S	H	N	P	R	S	T	V	G	T	I	T	E	I	H	D	Y	L	R	L	L	F	A	R	V	G	E	P	R	C	P	D	H	D	V	P	L	A	A	Q	T	V	S	Q	M	V	D	N	V	L
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.										.	.	.	.	.						.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.						.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	M	V	S	I	D	G	Q	D	I	R	T	I	N	V	R	Y	L	R	E	I	I	G	V	V	S	Q	E	P	V	L	F	A	.	.	.	.	.	T	T	I	A	E	.	.	.	.	.	N	I	R	Y	G	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T			G	G	G	S														S	S					S	.	.	.	.	.	S					.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.						.	.	.	.	.							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.						.	.	480	.	.						.	.	.	.	.	.
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Q	P	E	G	K	R	L	M	L	L	A	P	I	I	K	E	R	K	G	E	H	T	K	T	L	E	N	L	A	S	Q	G	Y	I	R	A	R	I	D	G	E	V	C	D	L	S	D	P	P	K	L	E	L	Q	K	K	H	T	I	E	V	V	V	D	R	F	K	V	R	D	D	L	T	Q	R	L	A	E	S
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	E	T	A	L	E	L	S	G	G	T	A	V	V	A	D	M	D	D	P	K	A	E	E	L	L	F	S	A	N	F	A	C	P	I	C	G	Y	S	M	R	E	L	E	P	R	L	F	S	F	N	N	P	A	G	A	C	P	T	C	D	G	L	G	V	Q	Q	Y	F	D	P	D	R	V	I	Q	N	P	E	L
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	A	G	G	A	I	R	G	W	D	R	R	N	F	Y	Y	F	Q	M	L	K	S	L	A	D	H	Y	K	F	D	V	E	A	P	W	G	S	L	S	A	N	V	H	K	V	V	L	Y	G	S	G	K	E	N	I	E	F	K	Y	M	N	D	R	G	D	T	S	I	R	R	H	P	F	E	G	V	L	H	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	V	T	M	D	E	I	E	K	A	V	K	E	A	N	A	Y	D	F	.	.	I	M	K	L	P	H	Q	F	D	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S													T	T		T	T		.	.				S	T	T	G	G	G			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.			.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	E	R	R	Y	K	E	T	E	S	S	A	V	R	E	E	L	A	K	F	I	S	N	R	P	C	A	S	C	E	G	T	R	L	R	R	E	A	R	H	V	Y	V	E	N	T	P	L	P	A	I	S	D	M	S	I	G	H	A	M	E	F	F	N	N	L	K	L	A	G	Q	R	A	K	I	A	E	K	I	L
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	E	I	G	D	R	L	K	F	L	V	N	V	G	L	N	Y	L	T	L	S	R	S	A	E	T	L	S	G	G	E	A	Q	R	I	R	L	A	S	Q	I	G	A	G	L	V	G	V	M	Y	V	L	D	E	P	S	I	G	L	H	Q	R	D	N	E	R	L	L	G	T	L	I	H	L	R	D	L	G	N	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.																												.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.																												.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	E	R	G	A	Q	L	S	G	G	Q	K	Q	R	I	A	I	A	R	A	L	V	R	N	P	K	.	.	I	L	L	L	D	E	A	T	S	A	L	D	T	E	S	E	A	V	V	Q	A	A	L	D	K	A	R	.	E	G	R	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	S	S	S		S	S																			S	.	.						B	T	T		S	S																T	.	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.																												.
Template SS confidence
																					520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.			.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.		.	.	.	.
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	V	V	E	H	D	E	D	A	I	R	A	A	D	H	V	I	D	I	G	P	G	A	G	V	H	G	G	E	V	V	A	E	G	P	L	E	A	I	M	A	V	P	E	S	L	T	G	Q	Y	M	S	G	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	I	V	I	A	H	R	L	S	T	V	R	N	A	D	V	I	A	G	F	.	.	.	.	.	.	D	G	G	V	I	V	E	Q	G	N	H	D	E	L	M	R	E	K	G	I	Y	F	K	L	V	M	T	Q	T	L	D	E	D	V	P	P	A	S	F	W	R	I	L	K	L	N	S	T	E	W	P	Y	F	V
Template Known Secondary structure							S						T	T		S						.	.	.	.	.	.	S	S	S															T	S									T											T	T									T
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.							.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	G	I	F	C	A	I	I	N	G	G	L	Q	P	A	F	S	V	I	F	S	K	V	V	G	V	F	T	N	G	G	P	P	E	T	Q	R	Q	N	S	N	L	F	S	L	L	F	L	I	L	G	I	I	S	F	I	T	F	F	L	Q	G	F	T	F	G	K	A	G	E	I	L	T	K	R	L	R	Y	M	V
Template Known Secondary structure																														S	S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		709	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	K	S	M	L	R	Q	D	V	S	W	F	D	D	P	K	N	T	T	G	A	L	T	T	R	L	A	N	D	A	A	Q	V	K	G	A	T	G	S	R	L	A	V	I	F	Q	N	I	A	N	L	G	T	G	I	I	I	S	L	I	Y	G	W	Q	L	T	L	L	L	L	A	I	V	P	I	I	A	I	A	G
Template Known Secondary structure															S		S																																												S	S		S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		789	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	V	E	M	K	M	L	S	G	Q	A	L	K	D	K	K	E	L	E	G	S	G	K	I	A	T	E	A	I	E	N	F	R	T	V	V	S	L	T	R	E	Q	K	F	E	T	M	Y	A	Q	S	L	Q	I	P	Y	R	N	A	M	K	K	A	H	V	F	G	I	T	F	S	F	T	Q	A	M	M	Y	F	S
Template Known Secondary structure																															T	T		T	T	T	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		869	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.
																																																																				597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	E	V	P	K	K	R	V	P	A	N	P	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	A	A	A	F	R	F	G	A	Y	L	V	T	Q	Q	L	M	T	F	E	N	V	L	L	V	F	S	A	I	V	F	G	A	M	A	V	G	Q	V	S	S	F	A	P	D	Y	A	K	A	T	V	S	A	S	H	I	I	R	I	I	E	K	T	P	E	I	D	S	Y	S	T	Q	G	L	K	P	N	M	L	E
Template Known Secondary structure													T	T	T	T		S		S	T	T																			T	S	S	S	S		S															S						S	S		S						T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		949	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.									.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	V	L	K	L	T	G	A	R	G	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	D	V	T	L	T	L	P	V	G	L	F	T	C	I	T	G	V	S	G	S	G	K	S	T	L	I	N	D	T	L	F	P	I	A	Q	R	Q	L	N	G	A	T	I	A	E	P	A	P	Y	R	D	I	Q	G	L	E	H	F
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.
Template Conservation																																																			.	.
Template Sequence		G	N	V	Q	F	S	G	V	V	F	N	Y	P	T	R	P	S	I	P	V	L	Q	G	L	S	L	E	V	K	K	G	Q	T	L	A	L	V	G	S	S	G	C	G	K	S	T	V	V	Q	.	.	L	L	E	R	F	Y	D	P	M	A	G	S	V	F	L	D	G	K	E	I	K	Q	L	N	V	Q	W	L	R
Template Known Secondary structure														S		G	G	G			S			S							S	S	S							S	S	S	T	T							.	.			T	T	S	S			S						S	S	S	S		B	T	S	S						T
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.
Template SS confidence
		1029	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.			.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.
		683	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	K	V	I	D	I	D	Q	S	P	I	G	R	T	P	R	S	N	P	A	T	Y	T	G	V	F	T	P	V	R	E	L	F	A	G	V	P	E	S	R	A	R	G	Y	T	P	G	R	F	S	F	N	V	R	G	G	R	C	E	A	C	Q	G	D	G	V	I	K	V	E	M	H	F	L	P	D	I	Y	V	P
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	L	G	I	V	S	Q	E	P	I	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	S						S	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1107	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		763	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.			.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.											.	.	.	.	.	.	.	830
Predicted Secondary structure																																											.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																											.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	D	Q	C	K	G	K	R	Y	N	R	E	T	L	E	I	K	Y	K	G	K	T	I	H	E	V	L	D	M	T	I	E	E	A	R	E	F	F	D	A	V	.	.	P	A	L	A	R	K	L	Q	T	L	M	D	V	G	L	T	Y	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	Q	S	A	T	T	L
Query Conservation																																											.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	C	S	I	A	E	N	I	A	Y	G	D	N	S	R	V	V	S	Y	E	E	I	V	R	A	A	K	E	A	N	I	H	Q	F	I	D	S	L	P	D	K	Y	N	T	R	V	G	D	K	G	T	Q	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	B						T				S	S																T						S	S	T	T	T	G	G	G		B		S	T	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																													1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.
		831	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	G	E	A	Q	R	V	K	L	A	R	E	L	S	K	R	G	T	G	Q	T	L	Y	I	L	D	E	P	T	T	G	L	H	F	A	D	I	Q	Q	L	L	D	V	L	H	K	L	R	D	Q	G	N	T	I	V	V	I	E	H	N	L	D	V	I	K	T	A	D	W	I	V	D	L	G	P	E	G	G	S
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.																												.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.																												.																									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	G	Q	K	Q	R	I	A	I	A	R	A	L	V	R	Q	P	H	.	.	.	I	L	L	L	D	E	A	T	S	A	L	D	T	E	S	E	K	V	V	Q	E	A	L	D	K	A	R	.	E	G	R	T	C	I	V	I	A	H	R	L	S	T	I	Q	N	A	D	L	I	V	V	I	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																				S	.	.	.	S					S		S	S	S																	S	.	S	S	S							S		T	T	G	G	G	S		S						.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.																												.																									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1173	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.				.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.		.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.
		911	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	G	E	I	L	V	S	G	T	P	E	T	V	A	E	C	E	A	S	H	T	A	R	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	N	G	K	V	K	E	H	G	T	H	Q	Q	L	L	A	Q	K	G	I	Y	F	S	M	V
Template Known Secondary structure			T	B														S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1243	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.