Job Description P42628 Confidence 99.15% Date Thu Jan 5 12:01:58 GMT 2012 Rank 4 Aligned Residues 380 % Identity 13% Template d2a65a1 SCOP info SNF-like SNF-like SNF-like Resolution 1.65

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		24	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.		.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.					.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.													.	.	.	.
Query SS confidence																															.													.	.	.	.
Query Sequence		E	S	E	W	R	E	A	I	K	F	D	S	T	D	T	G	W	V	I	M	S	I	G	M	A	I	G	A	G	.	I	V	F	L	P	V	Q	V	G	L	M	G	.	.	.	.	L	W	V	F	L	L	S	S	V	I	G	Y	P	A	M	Y	L	F	Q	R	L	F	I	N	T	L	A	E	S	P	E	C	K	D
Query Conservation																															.													.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.													.													.	.	.	.																									.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.																																																						.
Template Sequence		R	E	H	W	A	T	R	L	G	L	.	.	.	.	.	.	.	I	L	A	M	A	G	N	A	V	G	L	G	N	F	L	R	F	P	V	Q	A	A	E	N	G	G	G	A	F	M	I	P	Y	I	I	A	F	L	L	V	G	I	P	L	M	W	I	E	W	A	M	G	R	.	Y	G	G	A	Q	G	H	G	T
Template Known Secondary structure						S						.	.	.	.	.	.	.									S	S					T									T	T	T														T														.				T	T	T			S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.																																																						.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.								.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.		.	.	70	.	.	.	.	.	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	P	S	V	I	S	G	Y	L	G	K	N	W	G	I	L	L	G	A	L	Y	F	V	M	L	V	I	W	M	F	V	Y	S	T	A	I	T	N	D	S	A	S	Y	L	H	T	F	G	V	T	E	G	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	A	I	F	Y	L	L	W	R	N	R	F	A	K	I	L	G	V	F	G	L	W	I	P	L	V	V	A	I	Y	Y	V	Y	I	E	S	W	T	L	G	F	A	I	K	F	L	V	G	L	V	P	E	P	P	P	T	D	P	D	S	I	L	R	P	F	K	E	F	L	Y	S	Y	I	G	V	P	K	G	D
Template Known Secondary structure										S		S								T																														T																										T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
													153	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.							.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	S	P	F	Y	G	L	V	L	I	C	I	L	V	A	I	S	S	R	G	E	K	L	L	F	K	I	S	T	G	M	V	L	T	K	L	L	V	V	A	A	L	G	V	S	.	.	.	.	.	.	M	V	G	M	W	H	L	Y	N	V	G	S	L	P	P	L	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	P	I	L	K	P	S	L	F	A	Y	I	V	F	L	I	T	M	F	I	N	V	S	I	L	I	R	G	I	S	K	G	I	E	R	F	A	K	I	A	M	P	T	L	F	I	L	A	V	F	L	V	I	R	V	F	L	L	E	T	P	N	G	T	A	A	D	G	L	N	F	L	W	T	P	D	F	E	K	L
Template Known Secondary structure		S		B																							T	T		T	T	T	T																								T	T				T	T												S			T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	V	K	N	A	I	I	T	L	P	F	T	L	T	S	I	L	F	I	Q	T	L	S	P	M	V	I	S	Y	R	S	R	E	K	S	I	E	V	A	R	H	K	A	L	R	A	M	N	I	A	F	G	I	L	F	V	T	V	F	F	Y	A	V	S	F	T	L	A	M	G	H	D	E	A	V	K	A	Y	E
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	D	P	G	V	W	I	A	A	V	G	Q	I	F	F	T	L	S	L	G	F	G	A	I	I	T	Y	A	S	Y	V	R	K	D	Q	D	I	V	L	S	G	L	T	A	A	T	L	N	E	K	A	E	V	I	L	G	G	S	I	S	I	P	A	A	V	A	F	F	G	V	A	N	A	V	A	I	A	K	A	G
Template Known Secondary structure		T																	T	T	T	S	S							T	T	S		T	T	S																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	N	I	S	A	L	A	I	A	A	Q	F	I	S	G	D	G	A	A	W	V	K	V	V	S	V	I	L	N	I	F	A	V	M	T	A	F	F	G	V	Y	L	G	F	R	E	A	T	Q	G	I	V	M	N	I	L	R	R	K	M	P	A	E	K	I	N	E	N	L	V	Q	R	G	I	M	I	F	A	I	L
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	F	N	L	G	F	I	T	L	P	A	I	F	S	Q	T	A	.	.	.	G	G	T	F	L	G	F	L	W	F	F	L	L	F	F	A	G	L	T	S	S	I	A	I	M	Q	P	M	I	A	F	L	E	D	E	L	K	.	.	.	.	.	.	.	L	S	R	K	H	A	V	L	W	T	A	A	I	V	F	F
Template Known Secondary structure		S	S					T							T	T	S	T	.	.	.	T																																		T	S		.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.				.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.								.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
		376	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	W	S	A	I	V	L	N	A	P	V	L	S	F	T	S	I	C	S	P	I	F	G	M	V	G	C	L	I	P	A	W	L	V	Y	K	V	P	A	L	H	K	Y	K	G
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	A	H	L	V	M	F	L	N	K	S	L	D	E	M	D	F	W	A	G	T	I	G	V	V	F	F	G	L	T	E	L	I	I	F	F	W	I	F	G	A	D	K	A	W	E
Template Known Secondary structure									B	T	T									T	T	T																T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.