Job Description P35340 Confidence 99.78% Date Wed Jan 25 15:20:51 GMT 2012 Rank 120 Aligned Residues 285 % Identity 21% Template c2bs3A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:quinol-fumarate reductase flavoprotein subunit a; PDBTitle: glu c180 -> gln variant quinol:fumarate reductase from2 wolinella succinogenes Resolution 2.19 Å

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		213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.				.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
Predicted Secondary structure																																			.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	V	L	I	V	G	S	G	P	A	G	A	A	A	A	I	Y	S	A	R	K	G	I	R	T	G	L	M	G	E	R	F	.	.	.	G	G	Q	I	L	D	T	V	D	I	E	N	Y	I	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																			.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	D	S	L	V	I	G	G	G	L	A	G	L	R	A	A	V	A	T	Q	Q	K	G	L	S	T	I	V	L	S	L	I	P	V	K	R	S	H	S	A	A	A	Q	G	G	M	Q	A	S	L	G	N	S	K	M	S	D	G	D	N	E	D	L	H	F	M	D	T	V	K	G	S	D	W	G	C	D	Q	K	V
Template Known Secondary structure			S							S												T	T	T								S	S		G	G	G	S	G	G	G	G			S									S	G	G	G	T	T														T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
																																																																				261	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	K	T	E	G	Q	K	L	A	G	A	L	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	R	M	F	V	N	T	A	P	K	A	I	R	E	L	A	A	W	G	V	P	W	T	R	I	H	K	G	D	R	M	A	I	I	N	A	Q	K	T	T	I	T	E	E	D	F	R	H	G	L	I	H	S	R	D	F	G	G	T	K	K	W	R	T	C	Y	T	A	D	A	T	G	H	T	M	L	F	A	V	A
Template Known Secondary structure																			T	T					B			S								S	S									G	G	G	T	T	S	B			B			T	T		S	S						S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310				.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350
Predicted Secondary structure																																						.	.	.																																									.
Query SS confidence																																						.	.	.																																									.
Query Sequence		V	H	V	D	E	Y	D	V	D	V	I	D	S	Q	S	A	S	K	L	I	P	A	A	V	E	G	G	L	H	Q	I	E	T	A	S	G	.	.	.	A	V	L	K	A	R	S	I	I	V	A	T	G	A	K	W	R	N	M	N	V	P	G	E	D	Q	Y	R	T	K	G	V	T	Y	C	P	H	C	D	G	.
Query Conservation																																						.	.	.																																									.
Alig confidence																																						.	.	.																																									.
Template Conservation
Template Sequence		N	E	C	L	K	L	G	V	S	I	Q	D	R	K	E	A	I	A	L	I	H	Q	D	G	K	C	Y	G	A	V	V	R	D	L	V	T	G	D	I	I	A	Y	V	A	K	G	T	L	I	A	T	G	G	Y	G	R	I	Y	K	N	T	T	N	A	V	V	C	E	G	T	G	T	A	I	A	L	E	T	G	I
Template Known Secondary structure								T						S										T	T										T	T	T									S										G	G	G	S	S	S	B	S	S		T	T		S									T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
			351	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	P	L	F	K	G	K	R	V	A	V	I	G	G	G	N	S	G	V	E	A	A	I	D	L	A	G	I	V	E	H	V	T	L	L	E	F	A	P	E	M	K	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	L	Q	D	K	L	R	S	L	K	N	V	D	I	I	L	N	A	Q
Query Conservation		.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	L	G	N	M	E	A	V	Q	F	H	P	T	P	L	F	P	S	G	I	L	L	T	E	G	C	R	G	D	G	G	I	L	R	D	V	D	G	H	R	F	M	P	D	Y	E	P	E	K	K	E	L	A	S	R	D	V	V	S	R	R	M	I	E	H	I	R	K	G	K	G	V	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S					T	T						S		B	B	T	T	T			B			T						T						T	T	S		B							T	T	T	G	G	G	S															T	T	T	S	B	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query Sequence		T	T	E	V	K	G	D	G	S	K	V	V	G	L	E	Y	R	D	R	V	S	G	D	I	H	N	I	E	L	A	G	I	F	V	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	L	L	P	N	T	N	W	L	E	.	G	A	V	E	R	N	R	M	G	E	I	I	I	D	A	K	C
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	S	P	Y	G	Q	H	L	W	L	D	I	S	I	L	G	R	K	H	I	E	T	N	L	R	D	V	Q	E	I	C	E	Y	F	A	G	I	D	P	A	E	K	W	A	P	V	L	P	M	Q	H	Y	S	M	G	G	I	R	T	D	Y	R	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T			B						G	G	G																			T	S		S		T	T	T	S																			T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		477	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.									.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	T	N	V	K	G	V	F	A	A	G	D	C	T	T	V	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	K	Q	I	I	I	A	T	G	E	G	A	K	A	S	L	S	A	F	D	Y	L	I	R	T	K	T	A
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	A	K	L	K	G	L	F	S	A	G	E	A	A	C	W	D	M	H	G	F	N	R	L	G	G	N	S	V	S	E	A	V	V	A	G	M	I	V	G	E	Y	F	A	E	H	C	A	N	T	Q	V	D
Template Known Secondary structure		B		S	S	B	T					G	G	G					S	S	T	T	S			T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.