Job Description P21151 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:50 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 302 % Identity 23% Template c3e60A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein ] synthase ii; PDBTitle: crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl carrier protein)2 synthase ii from bartonella henselae Resolution 1.95 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10		.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.																																																				.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	E	Q	V	V	I	V	D	A	I	.	R	T	P	M	G	R	S	K	G	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	R	N	V	R	A	E
Query Conservation												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	R	R	V	V	I	T	G	L	G	L	V	S	P	L	A	G	D	V	E	Y	S	W	K	R	L	L	E	G	K	S	G	V	R	R	I	T	E	F	D	V	S	D	L	S	C	Q	I	A	A	R	I	P	V	G	D	G	T	N	G	T	Y	N	A	D	L	H	M	E	S	K	E	Q	R	K	V	D	A	F	I
Template Known Secondary structure															S	S		S	S										T	T									S	S			T	T	S	S									B	S	S	S		T	T		B		G	G	G	T	S						T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.						.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	L	S	A	H	L	M	R	S	L	L	A	R	N	P	A	L	E	.	.	.	.	.	A	A	A	L	D	D	I	Y	W	G	C	V	Q	Q	T	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	F	N	I	A	R	N	A	A	L	L	A	E	V
Query Conservation																				.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.						.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.
Template Sequence		V	Y	A	I	A	A	A	D	Q	A	L	A	.	D	A	E	W	F	P	K	S	D	E	D	Q	I	C	T	G	V	L	I	G	S	G	I	G	G	I	E	G	I	V	E	A	G	Y	T	L	R	D	K	G	P	R	R	I	S	P	F	F	I	P	G	R	L	I	N	L	A	S	G	Y	V	S	I	K	Y	G	L
Template Known Secondary structure														.			T					S						T								S	S		S																G	G	G	S		T	T	T	T	T	T	T		T	T											T
Template Predicted Secondary structure														.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.		.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	H	S	V	P	A	V	T	V	N	R	L	C	G	S	S	M	Q	A	L	H	D	A	A	R	M	I	M	T	G	D	A	Q	A	C	L	V	G	G	V	E	H	M	G	H	V	P	M	S	H	G	V	D	F	H	P	G	L	S	R	N	V	A	K	A	A	G	M	M	G	L	T	A	E	M	L	A	R	M	H
Query Conservation
Alig confidence				.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	G	.	.	P	N	H	S	V	V	T	A	C	S	T	G	A	H	A	I	G	D	A	A	R	L	I	A	L	G	D	A	D	V	M	L	A	G	G	T	E	S	P	I	N	R	I	S	L	A	G	F	S	A	C	R	A	L	S	T	C	R	N	D	D	P	E	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	.	.								G	G	G															T	T	S		S												S										T	T		B			S		T	T	S	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		160	.			.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	I	S	R	E	M	Q	D	A	F	A	A	R	S	H	A	R	A	W	A	A	T	Q	S	A	A	F	K	N	E	I	I	P	T	G	G	H	D	A	D	G	V	L	K	Q	F	N	Y	D	E	V	I	R	P	E	T	T	V	E	A	L	A	T	L	R	P	A	F	D	P	V	N	G	M	V	T	A	G	T	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	R	P	Y	D	V	D	R	D	G	F	V	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			T	T	B	T	T			S	B		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.						.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		S	A	L	S	D	G	A	A	A	M	L	V	M	S	E	S	R	A	H	E	L	G	L	K	P	R	A	R	V	R	S	M	A	V	V	G	C	.	.	.	.	.	D	P	S	I	M	G	Y	G	P	V	P	A	S	K	L	A	L	K	K	A	G	L	S	A	S	D	I	G	V	F	E	M	N	E	A	F	A	A
Query Conservation																																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																																				.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	M	G	E	G	A	A	I	V	V	L	E	E	L	E	H	A	K	K	R	G	A	R	I	Y	A	E	I	I	G	Y	G	L	S	G	D	A	Y	H	I	T	A	P	S	E	S	G	E	G	A	Q	R	S	M	M	A	A	L	K	R	A	Q	V	N	V	S	E	L	D	Y	I	N	A	H	G	T	S	T	M
Template Known Secondary structure		.	.	B	B																	T	T																	S		S	S	S			T	T																T			G	G	G										S	S	T
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.		.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.																												.	.
Predicted Secondary structure											.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	I	L	P	C	I	K	D	L	.	G	L	I	E	Q	I	D	E	K	I	N	L	N	G	G	A	I	A	L	G	H	P	L	G	C	S	G	A	R	I	S	T	T	L	L	N	L	M	E	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V
Query Conservation											.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	V	I	E	L	A	A	V	E	R	V	L	G	Y	Y	A	P	Q	V	S	M	S	S	T	K	S	S	I	G	H	L	L	G	A	A	G	A	A	E	A	I	F	C	V	L	A	I	R	D	N	I	A	P	A	T	L	N	L	E	N	P	S	I	E	T	K	I	D	L	V	P	H	K	P	R	E	R	K	I
Template Known Secondary structure		T													G	G	G	G	G	G						T						B		G	G	G																T					B	T	T		S	S	B	S	S			S	S	B			B	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	G	L	A	T	M	C	I	G	L	G	Q	G	I	A	T	V	F	E	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	T	V	L	S	N	S	F	G	F	G	G	T	N	A	S	L	V	M	R	R
Template Known Secondary structure											T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.