Job Description P21151 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:50 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 294 % Identity 29% Template c1oxhD_ PDB info PDB header:transferase Chain: D: PDB Molecule:beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase; PDBTitle: the crystal structure of beta-ketoacyl-[acyl carrier2 protein] synthase ii from streptococcus pneumoniae,3 triclinic form Resolution 2.09 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10		.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	E	Q	V	V	I	V	D	A	I	.	R	T	P	M	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	S	K	G	G	A	F	R	N	V	R	A	E	D	L	S	A	H	L	M
Query Conservation												.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	N	R	V	V	V	T	G	Y	G	V	T	S	P	I	G	N	T	P	E	E	F	W	N	S	L	A	T	G	K	I	G	I	G	G	I	T	K	F	D	H	S	D	F	D	V	H	N	A	A	E	I	Q	D	F	P	F	D	K	Y	F	V	K	K	D	T	N	R	F	D	N	Y	S	L	Y	A	L	Y	A	A
Template Known Secondary structure														B	T	T	B	S	S											T									S	S			T	T	S	S									S									G	G	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		36	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.					.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	S	L	L	A	R	N	P	A	L	E	A	A	A	L	D	.	.	.	.	D	I	Y	W	G	C	V	Q	Q	T	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	G	F	N	I	A	R	N	A	A	L	L	A	E	V	P	H	S	V	P	A	V	T
Query Conservation																		.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.											.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation							.																																																																					.	.
Template Sequence		Q	E	A	V	N	.	H	A	N	L	D	V	E	A	L	N	R	D	R	F	G	V	I	V	A	S	G	I	G	G	I	K	E	I	E	D	Q	V	L	R	L	H	E	K	G	P	K	R	V	K	P	M	T	L	P	K	A	L	P	N	M	A	S	G	N	V	A	M	R	F	G	A	N	G	.	.	V	C	K	S
Template Known Secondary structure							.		T	T			G	G	G	S		G	G	G								S	S		S																G	G	G	S		T	T						S	T	T											T			S	.	.
Template Predicted Secondary structure							.																																																																					.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.		.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.			.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	N	R	L	C	G	S	S	M	Q	A	L	H	D	A	A	R	M	I	M	T	G	D	A	Q	A	C	L	V	G	G	V	E	H	M	G	H	V	P	M	S	H	G	V	D	F	H	P	G	L	S	R	N	V	A	K	A	A	G	M	M	G	L	T	A	E	M	L	A	R	M	H	G	I	S	R	E	M	Q	D
Query Conservation
Alig confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	N	T	A	C	S	S	S	N	D	A	I	G	D	A	F	R	S	I	K	F	G	F	Q	D	V	M	L	V	G	G	T	E	A	S	I	T	P	F	A	I	A	G	F	Q	A	L	T	A	L	S	T	T	E	D	P	T	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					G	G	G															T	T	S		S												S											T		B				S		T	T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	A	A	R	S	H	A	R	A	W	A	A	T	Q	S	A	A	F	K	N	E	I	I	P	T	G	G	H	D	A	D	G	V	L	K	Q	F	N	Y	D	E	V	I	R	P	E	T	T	V	E	A	L	A	T	L	R	P	A	F	D	P	V	N	G	M	V	T	A	G	T	S	S	A	L	S	D	G	A	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	I	P	F	D	K	D	R	N	G	F	V	.	.	.	.	.	.	.	M	G	E	G	S	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	B	T	T				B		.	.	.	.	.	.	.	B	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																									219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230								.	.	.	.	.	.
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.						.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.						.	.	.	.
Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Query SS confidence																															.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Query Sequence		A	M	L	V	M	S	E	S	R	A	H	E	L	G	L	K	P	R	A	R	V	R	S	M	A	V	V	G	C	.	.	.	.	.	D	P	S	I	M	G	Y	G	P	V	P	A	S	K	L	A	L	K	K	A	G	L	S	A	S	D	I	G	V	F	E	M	N	E	A	F	A	.	.	.	.	.	A	Q	I	L
Query Conservation																															.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Alig confidence																															.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	L	V	L	E	S	L	E	H	A	E	K	R	G	A	T	I	L	A	E	V	V	G	Y	G	N	T	C	D	A	Y	H	M	T	S	P	H	P	E	G	Q	G	A	I	K	A	I	K	L	A	L	E	E	A	E	I	S	P	E	Q	V	A	Y	V	N	A	H	G	T	S	T	P	A	N	E	K	G	E	S	G
Template Known Secondary structure															T																	S		S	S	S			T	T																T			G	G	G										S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	C	I	K	D	L	G	L	I	E	Q	I	D	E	K	I	N	L	N	G	G	A	I	A	L	G	H	P	L	G	C	S	G	A	R	I	S	T	T	L	L	N	L	M	E	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	Q	F	G	L
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	I	V	A	V	L	G	.	.	.	.	.	.	K	E	V	P	V	S	S	T	K	S	F	T	G	H	L	L	G	A	A	G	A	V	E	A	I	V	T	I	E	A	M	R	H	N	F	V	P	M	T	A	G	T	S	E	V	S	D	Y	I	E	A	N	V	V	Y	G	Q	G	L	E	K	E	I	P	Y	A	I
Template Known Secondary structure									.	.	.	.	.	.	S		S					T						B		G	G	G															T	T					B	S	S			S	B		T	T			S				B	S	S							S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.							.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	M	C	I	G	L	G	Q	G	I	A	T	V	F	E	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	N	T	F	G	F	G	G	H	N	A	V	L	A	F	K	R
Template Known Secondary structure							T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.