Job Description P77432 Confidence 99.43% Date Thu Jan 5 12:29:13 GMT 2012 Rank 24 Aligned Residues 252 % Identity 22% Template c3h1qB_ PDB info PDB header:structural protein Chain: B: PDB Molecule:ethanolamine utilization protein eutj; PDBTitle: crystal structure of ethanolamine utilization protein eutj from2 carboxydothermus hydrogenoformans Resolution 2.80 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	L	F	T	L	S	E	S	K	Y	Y	L	M	A	L	D	A	G	T	G	S	I	R	A	V	I	F	D	L	E	G	N	Q	I	A	V	G	Q	A	E	W	R	H	L	A	V	P	D	V	P	G	S	M	E	F	D	L	N	K	N	W	Q	L	A	C	E	C	M	R	Q	A	L	H	N	A	G	I	A	P
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.
Template Sequence		V	R	E	I	V	N	P	L	P	P	P	Y	K	V	G	V	D	L	G	T	A	D	I	V	L	V	V	T	D	Q	E	G	I	P	V	A	G	A	L	K	W	A	S	V	V	K	.	.	.	.	.	D	G	L	V	V	D	Y	I	G	A	I	Q	I	V	R	E	L	K	A	K	V	E	R	L	L	G	S	E	L
Template Known Secondary structure				T							S										S	S									T	T																.	.	.	.	.	T	T			T	T																			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60						.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Y	I	A	A	V	S	A	C	S	M	R	E	G	I	V	L	Y	N	N	E	G	A	P	I	W	A	C	A	N	V	D	A	R	A	A	R	E	V	S	E	L	K	E	L	H	N	N	T	F	E	N	E	V	Y	R	A	T	G	Q	T	L	A	L	S	A	I	P	R	L	L	W	L	A	H	H	R	S	D	I
Query Conservation
Alig confidence					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Q	A	.	A	T	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.		.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	R	Q	A	S	T	I	T	M	I	S	D	W	L	A	Y	M	L	S	G	E	L	A	V	D	P	S	N	A	G	T	T	G	L	L	D	L	T	T	R	D	W	K	P	A	L	L	D	M	A	G	L	R	A	D	I	L	S	P	V	K	E	T	G	T	L	L	G	V	V	S	S	Q	A	A	E	L	C	G	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	G	T	V	G	R	N	A	E	A	C	G	H	V	V	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T			G	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																	97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	G	T	P	V	V	V	G	G	G	D	V	Q	L	G	C	L	G	L	G	V	V	R	P	A	Q	T	A	V	L	G	G	T	F	W	Q	Q	V	V	N	L	A	A	P	V	T	D	P	E	M	N	V	R	V	N	P	H	V	I	P	G	M	V	Q	A	E	S	I	S	F	F	T	G	L	T	M	R	W	F
Query Conservation
Alig confidence																							.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	G	L	E	L	V	T	L	V	D	E	P	V	A	A	A	R	A	L	G	.	I	N	D	G	I	V	V	D	I	G	G	G	T	T	G	I	A	V	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	K	G	K	I	T	A	T	F	D	E	P	T	G	G	T	H	L	S	L	V
Template Known Secondary structure			T	T																		T	.		S	S								S	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T									S			T
Template Predicted Secondary structure																							.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		114	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.		.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.
		322	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	D	A	F	C	A	E	E	K	L	I	A	E	R	L	G	I	D	T	Y	T	L	L	E	E	M	A	S	R	V	P	P	G	S	W	G	V	M	P	I	F	S	D	R	M	R	F	K	T	W	Y	H	A	A	P	S	F	I	N	L	S	I	D	P	D	K	C	N	K	A	T	L	F	R	A	L	E	E	N	A
Query Conservation
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	A	G	S	Y	K	I	P	F	E	E	A	E	T	I	K	K	D	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	H	R	E	I	X	R	V	V	R	P	V
Template Known Secondary structure						T												T		G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		175	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.																																																	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.		.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.
Query SS confidence																																																							.
Query Sequence		A	I	V	S	A	C	N	L	Q	Q	I	A	D	F	S	N	I	H	P	S	S	L	V	F	A	G	G	G	S	K	G	K	L	W	S	Q	I	L	A	D	V	S	G	L	P	V	N	I	P	V	V	K	E	.	A	T	A	L	G	C	A	I
Query Conservation																																																							.
Alig confidence																		.																																					.
Template Conservation																		.
Template Sequence		I	E	K	X	A	L	I	V	K	E	V	I	K	N	Y	D	.	Q	T	L	P	V	Y	V	V	G	G	T	A	Y	L	T	G	F	S	E	E	F	S	R	F	L	G	K	E	V	Q	V	P	I	H	P	L	L	V	T	P	L	G	I	A	L
Template Known Secondary structure															T	S		.	T	T							S	G	G	G	G	S	T	T										S	S			B			S	S	G	G	G								T
Template Predicted Secondary structure																		.
Template SS confidence
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.		.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.