Job Description P10408 Confidence 99.86% Date Thu Jan 5 11:32:13 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 327 % Identity 28% Template c2v1xB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:atp-dependent dna helicase q1; PDBTitle: crystal structure of human recq-like dna helicase Resolution 2.00 Å

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		71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.		.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.			.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.															.	.
Query SS confidence																.															.	.
Query Sequence		V	R	E	A	S	K	R	V	F	G	M	R	H	F	.	D	V	Q	L	L	G	G	M	V	L	N	E	R	C	.	.	I	A	E	M	R	T	G	E	G	K	T	L	T	A	T	L	P	A	Y	L	N	A	L	T	G	K	G	V	H	V	V	T	V	N	D	Y	L	A	Q	R	D	A	E	N	N	R	P	L	F
Query Conservation																.															.	.
Alig confidence																.															.	.																				.	.	.																											.
Template Conservation																																																				.	.	.																											.
Template Sequence		V	K	D	I	L	Q	N	V	F	K	L	E	K	F	R	P	L	Q	L	E	T	I	N	V	T	M	A	G	K	E	V	F	L	V	M	P	T	G	G	G	K	S	L	C	Y	Q	L	P	A	L	.	.	.	C	S	D	G	F	T	L	V	I	C	P	L	I	S	L	M	E	D	Q	L	M	V	L	K	Q	L	.
Template Known Secondary structure									T	S				S			T	T										T	T									T	T	S			T									.	.	.	S	S	S	S							S																.
Template Predicted Secondary structure																																																				.	.	.																											.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.				.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170									.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	F	L	G	L	T	V	G	I	N	L	P	G	M	P	A	P	A	K	R	E	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	D	I	T	Y	G	T	N	N	E	Y	G	F	D	Y	L	R	D	N	M	A	F	S	P	E	E	R	V	Q	R	K	L	H	Y	A	L	V	D	E	V	D	S	I	L	I	D	E	A
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.																						.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																																																			.	.																						.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	G	I	S	A	T	M	L	N	A	S	S	S	K	E	H	V	K	W	V	H	A	E	M	V	N	K	N	S	E	L	K	L	I	Y	V	T	P	E	K	I	A	K	S	K	M	F	M	S	R	L	.	.	E	K	A	Y	E	A	R	R	F	T	R	I	A	V	D	E	V	H	C	C	S	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	T								S	S																T	T										T					S									.	.						T	T									T	G	G	G	G	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																																																			.	.																						.	.	.	.
Template SS confidence
					155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.			.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	T	P	L	I	I	S	G	P	A	E	D	S	S	E	M	Y	K	R	V	N	K	I	I	P	H	L	I	R	Q	E	K	E	D	S	E	T	F	Q	G	E	G	H	F	S	V	D	E	K	S	R	Q	V	N	L	T	E	R	G	L	V	L	I	E	E	L	L	V	K	E	G	I	M	D	E	G	E	S	L	Y
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	W	G	H	D	F	R	P	D	Y	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	T	T			G	G	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																								226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	P	A	N	I	M	L	M	H	H	V	T	A	A	L	R	A	H	A	L	F	T	R	D	V	D	Y	I	V	K	D	G	E	V	I	I	V	D	E	H	T	G	R	T	M	Q	G	R	R	W	S	D	G	L	H	Q	A	V	E	A	K	E	G	V	Q	I	Q	N	E	N	Q	T	L	A	S	I	T	F	Q	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	I	L	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																													238	.	240	.	.
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.					.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.
Query Sequence		Y	F	R	L	Y	E	K	L	A	G	M	T	G	T	A	D	T	.	.	.	.	E	A	F	E	F	S	S	I	Y	K	L	D	T	V	V	V	P	T	N	R	P	M	I	R	K	D	L	P	D	L	V	Y	M	T	E	A	E	K	I	Q	A	I	I	E	D	I	K	E	R	T	A	K	G	Q	P	V	L	V	G
Query Conservation																			.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.																												.	.
Template Conservation																																																		.	.
Template Sequence		R	Q	F	P	N	A	S	L	I	G	L	T	A	T	A	T	N	H	V	L	T	D	A	Q	K	I	L	C	I	E	K	C	F	T	F	T	A	S	F	N	R	P	N	L	Y	Y	E	V	.	.	R	Q	K	P	S	N	T	E	D	F	I	E	D	I	V	K	L	I	N	G	R	Y	K	G	Q	S	G	I	I	Y
Template Known Secondary structure					T	T	S							S	S													T	T			S											T	T						.	.					S	S													T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290			.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		456	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.			.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure																																								.	.
Query SS confidence																																								.	.
Query Sequence		T	I	S	I	E	K	S	E	L	V	S	N	E	L	T	K	A	G	I	K	H	N	V	L	N	A	K	F	H	A	N	E	A	A	I	V	A	Q	.	.	A	G	Y	P	A	A	V	T	I	A	T	N	M	A	G	R	G	T	D	I	V	L	G	G	S	W	Q	A	E	V	A	A	L	E	N	P	T	A	E	Q
Query Conservation																																								.	.
Alig confidence																																								.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	F	S	Q	K	D	S	E	Q	V	T	V	S	L	Q	N	L	G	I	H	A	G	A	Y	H	A	N	L	E	P	E	D	K	T	T	V	H	R	K	W	S	A	N	E	I	Q	V	V	V	A	T	V	A	F	G	M	G	I	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S														T	T								T	T	S														T	T	S	S	S						T	T	S		T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	E	K	I	K	A	D	W	Q	V	R	H	D	A	V	L	E	A	G	G	L	H	I	I	G	T	E	R	H	E	S	R	R	I	D	N	Q	L	R	G	R	S	G	R	Q	G	D	A	G	S	S	R	F	Y	L	S	M	E	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	D	V	R	.	.	.	.	.	F	V	I	H	H	S	M	S	K	S	M	E	N	Y	Y	Q	E	S	G	R	A	G	R	D	D	M	K	A	D	C	I	L	Y	Y	G	F	G	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T			.	.	.	.	.					S	S			S	S									T	T	S		T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.
Template SS confidence
														381	.	.	.						.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.