Job Description P0ABZ4 Confidence 98.64% Date Thu Jan 5 11:16:45 GMT 2012 Rank 128 Aligned Residues 131 % Identity 25% Template c3kc2A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:uncharacterized protein ykr070w; PDBTitle: crystal structure of mitochondrial had-like phosphatase from2 saccharomyces cerevisiae Resolution 1.55 Å

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		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90					.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	I	L	D	V	D	G	V	L	S	D	G	L	I	Y	M	G	N	N	G	E	E	L	K	A	F	N	V	R	D	G	Y	G	I	R	C	A	L	T	S	D	I	E	V	A	I	I	T	G	R	K	A	K	L	V	E	D	R	C	A	T	L	.	.	.	.	G	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																	.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	F	A	F	D	I	D	G	V	L	F	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	K	P	I	A	G	A	S	D	A	L	K	L	L	N	R	N	K	I	P	Y	I	L	L	T	N	G	G	G	F	S	E	R	A	R	T	E	F	I	S	S	K	L	D	V	D	V	S	P	L	Q	I	I	Q	S	H
Template Known Secondary structure								B	T	T	T			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				T	T											T	T								S			S	S														T	S				G	G	G				T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.												.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	P	Y	K	S	L	V	N	K	Y	S	R	I	L	A	V	G	T	P	S	V	R	G	V	A	E	G	Y	G	F	Q	D	V	V	H	Q	T	D	I	V	R	Y	N	R	D	I	A	P	F	S	G	L	S	D	E	Q	V	X	E	Y	S	R	D	I	P	D	L	T	T	K	K	F	D	A	V	L	V	F	N	D
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G	G	T	T	T		S						S	S	T	T									T		S													G	G	G		T	T																T	T	T	T	T	S									S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
																																																																														94	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	Y	Q
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	H	D	W	A	A	D	I	Q	I	I	S	D	A	I	N	S	E	N	G	X	L	N	T	L	R	N	E	K	S	G	K	P	S	I	P	I	Y	F	S	N	Q	D	L	L	W	A	N	P	Y	K	L	N	R	F	G	Q	G	A	F	R	L	L	V	R	R	L	Y	L	E	L	N	G	E	P	L	Q	D	Y	T
Template Known Secondary structure			S														T	S	B	T	T	B	T	T				S				S	S		S	S					S				S					S	S	S	S																					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.														.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.		.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.		.	140	.	.	.	.	.	.	.						.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.													.										.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.													.										.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Q	S	N	K	L	I	A	F	S	D	L	L	E	K	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	A	P	E	N	V	A	Y	V	G	D	D	.	L	I	D	W	P	V	M	E	K	V	G	L	.	S	V	A	V	A	D	A	H	P	.	.	.	.	.	L	L	I	P	R	A	D	Y	V	T
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.													.										.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.													.										.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	K	P	T	K	L	T	Y	D	F	A	H	H	V	L	I	D	W	E	K	R	L	S	G	T	K	P	S	T	S	P	F	H	A	V	F	X	V	G	D	N	P	A	S	D	I	I	G	A	Q	N	Y	G	W	N	S	C	L	V	K	T	G	V	Y	N	E	G	D	D	L	K	E	C	K	P	T	L	I	V
Template Known Secondary structure			S	T	T																								T	T	T	T	T	S	S							S		T	T	T									T							S	S	S	S			T	T				T	T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	I	A	G	G	R	G	A	V	R	E	V	C	D	L	L	L	L
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	.	.	.	.	.	.	V	F	D	A	V	T	K	T	L	E
Template Known Secondary structure		S	S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		338	.							340	.	.	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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