Job Description P02919 Confidence 95.93% Date Thu Jan 5 10:57:35 GMT 2012 Rank 100 Aligned Residues 247 % Identity 17% Template c2qz6A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:beta-lactamase; PDBTitle: first crystal structure of a psychrophile class c beta-2 lactamase Resolution 2.26 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		V	A	Q	D	A	A	E	K	A	A	V	E	G	I	P	A	L	K	K	Q	R	K	L	S	D	L	E	T	A	I	V	V	V	D	R	F	S	G	E	V	R	A	M	V	G	G	S	E	P	Q	F	A	G	Y	N	R	A	M	Q	A	R	R	S	I	G	S	L	A	K	P	A	T	Y	L	T	A	L	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.									.	.																																									.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.	.									.	.
Template Sequence		D	I	R	Q	V	V	D	S	T	V	E	P	L	M	Q	Q	Q	D	I	A	G	.	.	.	.	.	.	L	S	V	A	V	I	Q	N	.	.	G	K	A	Q	Y	F	N	Y	G	V	A	N	K	D	S	K	Q	P	I	T	E	N	T	L	F	E	I	G	S	V	S	K	T	F	T	A	T	L	A	G	Y	A	L
Template Known Secondary structure																		T	T		S		.	.	.	.	.	.								T	.	.	T									B	S		T	T	T			B			T	T		B				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.									.	.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.							.	.	30	.	.	.	.	.			.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	Q	P	K	I	Y	R	L	N	T	W	I	A	D	A	P	I	A	L	R	Q	P	N	G	Q	V	W	S	P	Q	N	D	D	R	R	Y	S	E	S	G	R	V	M	L	V	D	A	L	T	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Template Sequence		A	N	G	K	L	.	K	L	S	D	P	A	S	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	P	A	L	R	G	D	K	F	.	.	.	D	H	I	S	L	L	N	L	G	T	Y	T	A	G	G	L	P	L	Q	F	P	T	G	K	M	I	S	Y	Y	Q	H	W	K	P	A	F	A	P	G	T	Q
Template Known Secondary structure			T	T	S		.		T	T	S	B	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G		G	G	G	T	T	S	G	G	.	.	.	G	S	S	B						T	T		S	S				S	S																S	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure							.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.		.	.	.	.	.	.	90	.													.	.	.	.	.	.	.	.	100	.				.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.
					573	.	.	.	.	.	.	580	.				.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.						.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									610	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.										.	.	.															.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.										.	.	.															.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	M	N	V	P	T	V	N	L	G	.	.	.	M	A	L	G	L	P	A	V	T	E	T	W	I	K	.	.	.	.	.	L	G	V	P	K	D	Q	L	H	P	V	P	A	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	L	G	A	L	N	L	T
Query Conservation		.	.	.										.	.	.															.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.										.	.	.															.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	Y	S	N	P	S	I	G	L	F	G	H	L	A	A	Q	S	L	G	Q	P	F	E	K	L	M	E	Q	T	V	L	P	K	L	G	L	K	H	T	F	I	S	V	P	E	T	Q	M	S	L	Y	A	Q	G	Y	D	K	A	G	K	P	V	R	V	S	P	G	A	L	D	A	E	A	Y	G	I	K	T	S
Template Known Secondary structure																			T	T	T	S									T	T	T	G	G	G	T		S	S			S	S			G	G	G	G	G	G	B				B		T	T	S		B							T	T					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	I	E	V	A	Q	A	F	Q	T	I	A	S	G	G	N	R	A	P	L	S	A	L	R	S	V	I	A	E	D	G	K	V	L	Y	Q	S	F	P	Q	A	E	R	A	V	P	A	Q	A	A	Y	L	T	L	W	T	M	Q	Q	V	V	Q	R	G	T	G	R	Q	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	S	D	L	I	H	Y	V	E	V	N	M	H	P	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	E	K	P	L	Q	Q	A	I	A	A	T	H	T	G	Y	Y	T	V	D	G	M	T	Q	G	L	G	W	E	M	Y	P	Y	P	I	K
Template Known Secondary structure															G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	S												T	S						T	T					S	S						S	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																											688	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	K	Y	P	N	L	H	L	A	G	K	T	G	T	T	N	N	N	V	D	T	W	F	A	G	I	D	G	S	T	V	T	I	T	W	V	G	R	D	N	N	Q	P	T	K	L	Y	G	A	S	G	A	M	S	I
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	A	L	V	E	G	N	S	T	Q	M	A	M	E	P	H	K	V	N	W	L	T	P	P	Q	A	A	P	L	D	T	L	V	N	K	T	G	S	T	G	G	F	G	A	Y	V	A	Y	.	V	P	S	K	G	L	G	V	V	I	L	A	N	.	.	.	.	.	.	K	N	Y	P	N	A	E	R	V	K	A
Template Known Secondary structure									T		S					S															S	S										S	S								.		T	T	T	T								S	.	.	.	.	.	.	B
Template Predicted Secondary structure																																																			.														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.		.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.							.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		743	.	.	.	.	.	.	750
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Q	R	Y	L	A	N	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	H	A	I	L	S	A	M
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360

No model constructed - rank, confidence too low

---

Phyre is for academic use only

Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions