Job Description P76641 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:13 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 370 % Identity 18% Template c2vr2A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:dihydropyrimidinase; PDBTitle: human dihydropyrimidinase Resolution 2.80 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	K	A	V	R	G	S	F	I	D	V	T	R	T	I	D	N	P	E	E	I	A	S	A	L	R	F	I	E	D	G	L	L	L	I	K	Q	G	K	V	E	W	F	G	E	W	E	N	G	K	H	Q	I	P	D	T	I	R	V	R	D	Y	R	G	K	L	I	V	P	G	F	V	D	T	H	I	H	Y	P
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	R	L	L	I	R	G	G	R	V	V	N	D	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	E	V	A	D	V	L	V	E	D	G	V	V	R	A	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	L	R	V	L	D	A	A	G	K	L	V	L	P	G	G	I	D	T	H	T	H	M	Q
Template Known Secondary structure								S						S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	S													T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.														20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.												.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.						.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	S	E	M	V	G	A	Y	G	E	Q	L	L	E	W	L	N	K	H	T	F	P	T	E	R	R	Y	E	D	L	E	Y	A	R	E	M	S	A	F	F	I	K	Q	L	L	R	N	G	T	T	T	A	L	V	F	G	T	V	H	.	.	.	.	.	P	Q	S	V	D	A	L	F	E	A	A	S	H	I	N	M
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	P	F	M	G	S	R	S	I	D	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	Q	G	T	K	A	A	L	S	G	G	T	T	M	I	I	D	F	A	I	P	Q	K	G	G	S	L	I	E	A	F	E	T	W	R	S	W	A	D	P	K	V	C
Template Known Secondary structure			B		S	S	S	B		S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T								T	T	T												T	T															T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	M	I	A	G	K	V	M	M	D	R	N	A	P	D	Y	L	L	D	T	A	E	S	S	Y	H	Q	S	K	E	L	I	E	R	W	H	K	N	G	R	L	L	Y	A	I	T	P	R	F	A	P	T	S	S	P	E	Q	M	A	M	A	Q	R	L	K	E	E	Y	P	D	T	W	V	H	T	H	L	C	E	N
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template Sequence		C	D	Y	S	L	H	V	A	V	T	W	W	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	V	K	E	E	M	K	I	L	V	Q	D	K	G	V	N	S	F	K	M	F	M	A	Y	K	D	L	Y	M	V	T	D	L	E	L	Y	E	A	F	S	R	C	K	E	I	.	G	A	I	A	Q	V	H	A	E	N	G
Template Known Secondary structure		S										S		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	S									S	S	S	T	T	T	T	B																	.	T								S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.																																														.
Template SS confidence
		127	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140										.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.		.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
		242	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.		.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Query Sequence		K	D	E	I	A	W	V	K	S	L	Y	P	D	H	D	G	Y	L	D	V	Y	H	Q	Y	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	K	N	C	V	F	A	H	C	V	.	H	L	E	E	K	E	W	D	R	L	S	E	T	K	S	S	I	A	F	C	P	T	S	N	L
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation
Template Sequence		D	L	I	A	E	G	A	K	K	M	L	A	L	G	I	T	G	P	E	G	H	E	L	C	R	P	E	A	V	E	A	E	A	T	L	R	A	I	T	I	A	S	A	V	N	C	P	L	Y	I	V	H	V	M	S	K	S	A	A	K	V	I	A	D	A	R	R	D	G	K	V	V	Y	G	E	P	I	A	A	S
Template Known Secondary structure														T	T			S	T						T	S																				T																							T	T								B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
		304	.	.	.	.	.	310																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	L	G	S	G	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	K	K	A	W	Q	K	K	V	K	V	G	M	G	T	D	I	G	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	T	F	N	M	L	Q	T	L	N
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	T	D	G	T	H	Y	W	N	K	E	W	H	H	A	A	H	H	V	M	G	P	P	L	R	P	D	P	S	T	P	D	F	L	M	N	L	L	A	N	D	D	L	T	T	T	G	T	D	N	C	T	F	N	T	C	Q	K	A	L	G	K	D	D	F	T	K	I	P	N	G	V	N	G	V	E	D	R	M
Template Known Secondary structure						S	G	G	G	G		S	S						T	T			S	S				S		T	T											T	T	S	S				B			B									G	G	G	S	S		G	G	G	S				B			T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	Y	K	V	L	Q	L	Q	G	Y	R	L	S	A	Y	E	A	F	Y	L	A	T	L	G	G	A	K	S	L	G	L	D	D	L	I	G	N	F	L	P	G	K	E	A	D	F	V	V	M	E	P	T	A	T	P	L	Q	Q	L	R	Y	D	N	S	V	S	L	V	D	K	L	F	V	M	M	T	L	G	D
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	V	I	W	E	K	G	V	H	S	G	K	M	D	E	N	R	F	V	A	V	T	S	T	N	A	A	K	I	F	N	L	Y	P	R	K	G	R	I	A	V	G	S	D	A	D	I	V	I	W	D	P	K	G	T	R	T	I	S	A	K	T	H	H	Q	A	V	N	F	N	I	F	E	G	M	V	C	H	G	V
Template Known Secondary structure									T	T	T	T	S	S										T							T	T		T	T	T	S	S			S	T	T	S	B																T	T	T		S	S	S		S			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
		422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	R	S	I	Y	R	T	Y	V	D	G	R	L	V	Y	E	R
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	P	L	V	T	I	S	R	G	K	V	V	Y	E	A
Template Known Secondary structure		.	.	.							T	T						T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450