Job Description P76641 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 12:25:13 GMT 2012 Rank 23 Aligned Residues 358 % Identity 20% Template c2r8cB_ PDB info PDB header:structural genomics, unknown function Chain: B: PDB Molecule:putative amidohydrolase; PDBTitle: crystal structure of uncharacterized protein eaj56179 Resolution 2.31 Å

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		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	F	I	D	V	T	R	T	I	D	N	P	E	E	I	A	S	A	L	R	F	I	E	D	G	L	L	L	I	K	Q	G	K	V	E	W	F	G	E	W	E	N	G	K	H	Q	I	P	D	T	I	R	V	R	D	Y	R	G	K	L	I	V	P	G	F	V	D	T	H	I	H	Y	P	Q	S	E	M	V	G	A
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.	.																													.	.	.	.																															.	.
Template Conservation														.	.	.	.																													.	.	.	.																															.	.
Template Sequence		T	F	L	F	R	N	G	A	L	L	D	P	.	.	.	.	D	H	P	D	L	L	Q	G	F	E	I	L	I	E	D	G	F	I	R	E	V	S	D	K	P	I	K	S	.	.	.	.	S	N	A	H	V	I	D	V	K	G	K	T	I	M	P	G	L	I	D	L	H	V	H	V	V	A	I	E	F	N	.	.
Template Known Secondary structure							S	S					T	.	.	.	.	T							S							T	T							S	S					.	.	.	.		S	S						T	T														T	T			S	S		.	.
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.																													.	.	.	.																															.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.					.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.					.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure																																																																																.	.
Query SS confidence																																																																																.	.
Query Sequence		Y	G	E	Q	L	L	E	W	L	N	K	H	T	F	P	T	E	R	R	Y	E	D	L	E	Y	A	R	E	M	S	A	F	F	I	K	Q	L	L	R	N	G	T	T	T	A	L	V	F	G	T	V	H	P	Q	S	V	D	A	L	F	E	A	A	S	H	I	N	M	R	M	I	A	G	K	V	M	M	D	.	.
Query Conservation																																																																																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	R	V	A	T	L	P	N	V	L	V	T	L	R	A	V	P	I	M	R	A	M	L	R	R	G	F	T	T	V	R	D	A	G	G	A	G	Y	P	F	K	Q	A	V	E	S	G	L	V	E	G	P	R	L	F	V	S	G	R	A	L	S	Q	T	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S																			T	T								S	S											T	T	S	S										S					T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																73	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
																								172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.					.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	A	P	D	Y	L	L	D	T	A	E	S	S	Y	H	Q	S	K	E	L	I	E	R	W	H	K	N	G	R	L	L	Y	A	I	T	P	.	.	.	.	R	F	A	P	T	S	S	P	E	Q	M	A	M	A	Q	R	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	H	A	D	P	R	A	R	S	D	Y	M	P	P	D	S	P	G	C	C	V	R	V	G	A	L	G	R	V	A	D	G	V	D	E	V	R	R	A	V	R	E	E	L	Q	M	G	A	D	Q	I	K	I	M	A	S	G	G	V	P	T	D	P	V	G	V	F	G	Y	S	E	D	E	I	R	A	I	V	A	E
Template Known Secondary structure		S	T	T						S	S	S				S					S			T	T								S														T	T		S	S						B								S	S	S	B		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		139	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	E	E	Y	P	D	T	W	V	H	T	H	L	C	E	N	K	D	E	I	A	W	V	K	S	L	Y	P	D	H	D	G	Y	L	D	V	Y	H	Q	Y	G	L	T	G	K	N	C	V	F	A	H	C	V	H	L	E	E	K	E	W	D	R	L	S	E	T	K	S	S	I	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	G	R	.	G	T	Y	V	L	A	H	A	Y	T	P	A	A	I	A	R	A	V	R	C	G	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	E	H	G	N	L	I	D	D	E	T	A	R	L	V	A	E	H	G	A	Y	V	V	P	T	L	V	T	Y	D	A	L
Template Known Secondary structure					T	.	T									S										T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure						.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.		.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
															298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	P	T	S	N	L	Y	L	G	S	G	L	F	N	L	K	K	A	W	Q	K	K	V	K	V	G	M	G	T	D	I	G	A	G	T	T	F	N	M	L	Q	T	L	N	E	A	Y	K	V	L	Q	L	Q	G	Y	R	L	S	A	Y	E	A	F	Y	L	A	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	S	E	G	E	K	Y	G	L	P	P	E	S	I	A	K	I	A	D	V	H	G	A	G	L	H	S	I	E	I	M	K	R	A	G	V	K	M	G	F	G	T	D	L	L	G	E	A	Q	R	L	Q	S	D	E	F	R	I	L	.	.	.	.	.	.	.	A	E	V	L	S	P	A	E	V	I	A	S	A	T
Template Known Secondary structure				S	T	G	G	G	T			T	T	S	S	T	T						T	T											T	T											G	G	G	G	G	G	T	T							.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	S									T	T
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340								.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
		365	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	G	A	K	S	L	G	L	D	D	L	I	G	N	F	L	P	G	K	E	A	D	F	V	V	M	E	P	T	A	T	P	L	Q	Q	L	R	Y	D	N	S	V	S	L	V	D	K	L	F	V	M	M	T	L	G	D	D	R	S	I	Y	R	T	Y	V	D	G	R	L	V	Y	E	R
Query Conservation
Alig confidence																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	V	S	A	E	V	L	G	M	Q	D	K	L	G	R	I	V	P	G	A	H	A	D	V	L	V	V	D	G	N	P	L	K	S	V	D	C	L	L	G	Q	G	E	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	L	V	M	K	D	G	R	L	F	V	N	E
Template Known Secondary structure								T	T		B	T	T	B	S	S			T	T	S	B							S	S		T	T	T		G	G	G	S		S	S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.