Job Description P0AGC0 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:28:42 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 426 % Identity 30% Template d1pw4a_ SCOP info MFS general substrate transporter MFS general substrate transporter Glycerol-3-phosphate transporter Resolution 3.30

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	V	R	K	P	T	L	D	L	P	L	E	V	R	R	K	M	W	F	K	P	F	M	Q	S	Y	L	V	V	F	I	G	Y	L	T	M	Y	L	I	R	K	N	F	N	I	A	Q	N	D	M	I	S	T	Y	G	L	S	M	T	Q	L	G	M	I	G	L	G	F	S	I	T	Y	G	V	G	K	T	L	V	S
Query Conservation
Alig confidence																																																					.
Template Conservation																																																					.
Template Sequence		K	P	A	P	H	K	A	R	L	P	A	A	E	I	D	P	T	Y	R	R	L	R	W	Q	I	F	L	G	I	F	F	G	Y	A	A	Y	Y	L	V	R	K	N	F	A	L	A	M	P	Y	L	V	.	E	Q	G	F	S	R	G	D	L	G	F	A	L	S	G	I	S	I	A	Y	G	F	S	K	F	I	M	G
Template Known Secondary structure													S																													T	S								T	T	.	S	S	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.		.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Y	A	D	G	K	N	T	K	Q	F	L	P	F	M	L	I	L	S	A	I	C	M	L	G	F	S	A	S	M	G	S	G	S	V	S	L	F	L	M	I	A	F	Y	A	L	S	G	F	F	Q	S	T	G	G	S	C	S	Y	S	T	I	T	K	W	T	P	R	R	K	R	G	T	F	L	G	F	W	N	I
Query Conservation
Alig confidence																																		.
Template Conservation																																		.
Template Sequence		S	V	S	D	R	S	N	P	R	V	F	L	P	A	G	L	I	L	A	A	A	V	M	L	F	M	G	F	V	P	W	A	.	T	S	S	I	A	V	M	F	V	L	L	F	L	C	G	W	F	Q	G	M	G	W	P	P	C	G	R	T	M	V	H	W	W	S	Q	K	E	R	G	G	I	V	S	V	W	N	C
Template Known Secondary structure							S																											.		S	S	S	S																T										T	T		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																		.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.		.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	H	N	L	G	G	A	G	A	A	G	V	A	L	F	G	A	N	Y	L	F	D	G	H	V	I	G	M	F	I	F	P	S	I	I	A	L	I	V	G	F	I	G	L	R	Y	G	S	D	S	P	E	S	Y	G	L	G	K	A	E	E	L	F	G	E	E	I	S	E	E	D	K	E	T	E	S	T	D	M	T
Query Conservation
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	H	N	V	G	G	G	I	P	P	L	L	F	L	L	G	M	A	W	F	N	D	W	H	A	A	L	Y	M	P	A	F	C	A	I	L	V	A	L	F	A	F	A	M	M	R	D	T	P	Q	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	G	L	P	P	I	E	E	Y	K	N	D	T
Template Known Secondary structure								T	S												T			S	T	T		T																					S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T				S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		247	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	W	Q	I	F	V	E	Y	V	L	K	N	K	V	I	W	L	L	C	F	A	N	I	F	L	Y	V	V	R	I	G	I	D	Q	W	S	T	V	Y	A	F	Q	E	L	K	L	S	K	A	V	A	I	Q	G	F	T	L	F	E	A	G	A	L	V	G	T	L	L	W	G	W	L	S	D	L	A	N	G	R	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		A	K	Q	I	F	M	Q	Y	V	L	P	N	K	L	L	W	Y	I	A	I	A	N	V	F	V	Y	L	L	R	Y	G	I	L	D	W	S	P	T	Y	L	K	E	V	K	H	F	A	L	D	K	S	S	W	A	Y	F	L	Y	E	Y	A	G	I	P	G	T	L	L	C	G	W	M	S	D	K	V	F	R	G	N
Template Known Secondary structure			T							T	S	S																													B	T	T	B	S																																T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
					327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.
Query SS confidence		.	.	.
Query Sequence		.	.	.	G	L	V	A	C	I	A	L	A	L	I	I	A	T	L	G	V	Y	Q	H	A	S	N	E	Y	I	Y	L	A	S	L	F	A	L	G	F	L	V	F	G	P	Q	L	L	I	G	V	A	A	V	G	F	V	P	K	K	A	I	G	A	A	D	G	I	K	G	T	F	A	Y	L	I	G	D	S	F	A
Query Conservation		.	.	.
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	G	A	T	G	V	F	F	M	T	L	V	T	I	A	T	I	V	Y	W	M	N	P	A	G	N	P	T	V	D	M	I	C	M	I	V	I	G	F	L	I	Y	G	P	V	M	L	I	G	L	H	A	L	E	L	A	P	K	K	A	A	G	T	A	A	G	F	T	G	L	F	G	Y	L	G	G	S	V	A	A
Template Known Secondary structure																				T	T	S			T	T																	T													T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	G	L	G	M	I	A	D	G	T	P	V	F	G	L	T	G	W	A	G	T	F	A	A	L	D	I	A	A	I	G	C	I	C	L	M	A	I	V	A	V	M	E	E	R	K	I	R	R	E	K	K
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	A	I	V	G	Y	T	V	D	F	.	.	.	.	.	.	F	G	W	D	G	G	F	M	V	M	I	G	G	S	I	L	A	V	I	L	L	I	V	V	M	I	G	E	K	R	R	H	E	Q	L	L	Q
Template Known Secondary structure											S	.	.	.	.	.	.	S		S																															G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410							.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.