Job Description P38036 Confidence 97.77% Date Thu Jan 5 11:57:49 GMT 2012
Rank 160 Aligned Residues 101
% Identity 16% Template c3ccgA_
PDB info
PDB header: hydrolaseChain: A: PDB Molecule: hd superfamily hydrolase;
PDBTitle: crystal structure of predicted hd superfamily hydrolase involved in2 nad metabolism (np_347894.1) from clostridium acetobutylicum at 1.503 a resolution
Resolution 1.50 Å
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27 . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
L I Y H C L D V A A V A D C W W D Q S V V L Q N T F C R N E M L S K Q R V K A W L L F F I A L H D I G K F D I R F Q Y K S A E S W L K L N P A T P S L N G P S T
Query Conservation  
                                                                                                                               
Alig confidence  
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Template Conservation  
                . . . . . . . . . . .                 . . . .           .                                   . . . . .  
Template Sequence  
R Y K H S L G V X D T A V R L .
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A G I Y N E D T E K A R .
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I A G L V H D C A K K L P G .
E K I I E I C T N E G Y E L G D E .
.
.
.
.
D
Template Known Secondary structure  
. . . . . . . . . . . T . . . . T T T T T T S . T T . . . . .
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
19 20 . . . . . . . . . 30 . . .
. . . . . . 40 . . . . .
. . . . 50 . . . . . . . . .
60 . . . . . . . . . 70 . . . . . .
.
 
   
107 . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
Q M C R K F N H G A A G L Y W F N Q D S L S E Q S L G D F F S F F D A A P H P Y E S W F P W V E A V T G H H G F I L H S Q
Query Conservation  
                                                                                                               
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
                                      . . . . . . . . . . . . . . . . . . .                          
Template Sequence  
I R N S Y L L H G L A G R I L A K K V I G I D D .
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E D V L N A I E F H T T G R P N X S
Template Known Secondary structure  
T T T T . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T T T S S
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
78 . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 .
. . . . . . . . 110 . . . . . . . . .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]