Job Description P37127 Confidence 99.60% Date Thu Jan 5 11:54:48 GMT 2012 Rank 133 Aligned Residues 249 % Identity 24% Template c2bs3A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:quinol-fumarate reductase flavoprotein subunit a; PDBTitle: glu c180 -> gln variant quinol:fumarate reductase from2 wolinella succinogenes Resolution 2.19 Å

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		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	V	A	I	I	G	A	G	P	A	G	L	A	C	A	D	V	L	T	R	N	G	V	G	V	T	V	Y	D	R	H	P	E	I	G	G	L	L	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	P	S	F	K	L	D
Query Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	S	L	V	I	G	G	G	L	A	G	L	R	A	A	V	A	T	Q	Q	K	G	L	S	T	I	V	L	S	L	I	P	V	K	R	S	H	S	A	A	A	Q	G	G	M	Q	A	S	L	G	N	S	K	M	S	D	G	D	N	E	D	L	H	F	M	D	T	V	K	G	S	D	W	G	C	D	Q	K	V	A
Template Known Secondary structure		S							S												T	T	T								S	S		G	G	G	S	G	G	G	G			S									S	G	G	G	T	T														T	T	T		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		377	.	.	380	.	.				.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.
Query SS confidence								.	.	.
Query Sequence		K	S	L	L	A	R	.	.	.	R	R	E	I	F	S	A	M	G	I	H	F	E	L	N	C	E	V	G	K	D	V	S	L	D	S	L	L	E	Q	Y	D	A	V	F	V	G	V	G	T	Y	R	S	M	K	A	G	L	P	N	E	D	A	P	G	V	Y	D	A	L	P	F	L	I	A	N	T	K	Q	V	M
Query Conservation								.	.	.
Alig confidence								.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	M	F	V	N	T	A	P	K	A	I	R	E	L	A	A	W	G	V	P	W	T	R	I	H	K	G	D	R	M	A	I	I	N	A	Q	K	T	T	I	T	E	E	D	F	R	H	G	L	I	H	S	R	D	F	G	G	T	K	K	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																		T	T					B			S								S	S									G	G	G	T	T	S	B			B			T	T		S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		87	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	L	E	E	L	P	E	E	P	F	I	N	T	A	G	L	N	V	V	V	L	G	G	G	D	T	A	M	D	C	V	R	T	A	L	R	H	G	A	S	N	V	T	C	A	Y	R	R	D	E	A	N	M	P	G	S	K	K	E	V	K	N	A	R	E	E	G	A	N	F	E	F	N	V	Q	P	V	A	L	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	C	Y	T	A	D	A	T	G	H	T	M	L	F	A	V	A	N	E	C	L	K	L	G	V	S	I	Q	D	R	K	E	A	I	A	L	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	T	T																		T						S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																												148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	N	E	Q	G	H	V	C	G	I	R	F	L	R	T	R	L	G	E	P	D	A	Q	G	R	R	R	P	V	P	V	E	G	S	E	F	V	M	P	A	D	A	V	I	M	A	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	.	Q	D	G	K	C	Y	G	A	V	V	R	D	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	G	D	I	I	A	Y	V	A	K	G	T	L	I	A	T	G	G	Y	G	R	I	Y	K	N	T	T	N	A	V	V	C	E	G	T	G	T	A	I	A	L	E	T	G	I	A	Q	L	G
Template Known Secondary structure			.		T	T										T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T									S										G	G	G	S	S	S	B	S	S		T	T		S									T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure			.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		186		.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200																.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	M	E	A	V	Q	F	H	P	T	P	L	F	P	S	G	I	L	L	T	E	G	C	R	G	D	G	G	I	L	R	D	V	D	G	H	R	F	M	P	D	Y	E	P	E	K	K	E	L	A	S	R	D	V	V	S	R	R	M	I	E	H	I	R	K	G	K	G	V	Q	S	P	Y	G	Q	H	L	W	L	D
Template Known Secondary structure			T	T						S		B	B	T	T	T			B			T						T						T	T	S		B							T	T	T	G	G	G	S															T	T	T	S	B			T	T			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.
														582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600													.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	N	P	H	G	M	P	W	L	E	S	H	G	V	T	V	D	K	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	I	I	A	D	V	E	S	Q	Y	R	Y	Q	T	T	N	P	K	I	F	A	G	G	D	A	V	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																					.	.	.	.
Template Sequence		I	S	I	L	G	R	K	H	I	E	T	N	L	R	D	V	Q	E	I	C	E	Y	F	A	G	I	D	P	A	E	K	W	A	P	V	L	P	M	Q	H	Y	S	M	G	G	I	R	T	D	Y	R	.	.	.	.	G	E	A	K	L	K	G	L	F	S	A	G	E	A	A	C	W	D	M	H	G	F	N	R	L
Template Known Secondary structure			G	G	G																			T	S		S		T	T	T	S																			T	T	.	.	.	.	S	B		S	S	B	T					G	G	G					S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.
Template SS confidence
		330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380					.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.
		629	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	D	L	V	V	T	A	M	A	E	G	R	H	A	A	Q	G	I	I	D	W	L	G	V	K	S	V	K	S
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	G	N	S	V	S	E	A	V	V	A	G	M	I	V	G	E	Y	F	A	E	H	C	A	N	T	Q	V	D	L
Template Known Secondary structure		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.