Job Description P06129 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:02 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 579 % Identity 15% Template c1xkwA_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: A: PDB Molecule:fe(iii)-pyochelin receptor; PDBTitle: pyochelin outer membrane receptor fpta from pseudomonas2 aeruginosa Resolution 2.00 Å

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		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	A	Q	D	T	S	P	D	T	L	V	V	T	A	N	R	F	E	Q	P	R	S	T	V	L	A	P	T	T	V	V	T	R	Q	D	I	D	R	W	Q	S	T	S	V	N	D	V	L	R	R	L	P	G	V	D	I	T	Q	N	G	G	S	G	Q	L	S	S	I	F	I	R	G	T	N	A	S	H	V	L	V
Query Conservation
Alig confidence																																																															.	.													.	.
Template Conservation																																																															.	.													.	.
Template Sequence		E	S	T	S	A	T	Q	P	P	G	V	T	T	L	G	K	V	P	L	K	P	R	E	L	P	Q	S	A	S	V	I	D	H	E	R	L	E	Q	Q	N	L	F	S	L	D	E	A	M	Q	Q	A	T	G	V	T	V	Q	P	F	Q	L	.	.	L	T	T	A	Y	Y	V	R	G	F	K	V	.	.	D	S	F
Template Known Secondary structure					T	T				T	T		B		T	T	S	S		B		G	G	G		S	S													T	T			B							T	S	T	T								T	.	.	T							T	T				.	.
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.													.	.
Template SS confidence
		56	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.			.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.			.	130	.
		99	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	D	G	V	R	L	N	L	A	G	V	S	G	S	A	D	L	S	Q	F	P	I	A	L	V	Q	R	V	E	Y	I	R	G	P	R	S	A	V	Y	G	S	D	A	I	G	G	V	V	N	I	I	T	T	R	D	E	P	G	T	E	I	S	A	G	W	G	S	N	S	Y	Q	N	Y	D	V	S	T	Q	Q
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.
Template Sequence		E	L	D	G	V	P	A	L	L	G	N	T	A	.	.	.	.	S	S	P	Q	D	M	A	I	Y	E	R	V	E	I	L	R	G	S	N	G	L	L	H	G	T	G	N	P	A	A	T	V	N	L	V	R	K	R	P	Q	R	E	F	A	A	S	T	T	L	S	A	G	R	W	D	R	Y	R	A	E	V	D	V
Template Known Secondary structure				T	T						S	S	T	T	.	.	.	.					B		T	T									S			T	T	T	T		S			S	S												S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.					.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.
		179	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	200	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	L	G	D	K	T	R	V	T	L	L	G	D	Y	A	H	T	H	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V	V	A	Y	G	N	T	G
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	G	P	L	S	A	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	E	D	R	D	Y	F	Y	D	V	A	D	Q	G	T	R	L	L	Y	G	V	T	E	F	D	L	S	P	D	T	L	L	T	V	G	A	Q	Y	Q	H	I	D	S	I	T	N	M	A	G	V	P	M	A	K	D	G	S	N	L	G	L	S	R
Template Known Secondary structure					S	S	S	S	S	S															S	S	S	S																		T	T																		S	S		B			B	T	T	S							T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Q	A	Q	T	D	N	D	G	F	L	S	K	T	L	Y	G	A	L	E	H	N	F	T	D	A	W	S	G	F	V	R	G	Y	G	Y	D	N	R	T	N	Y	D	A	Y	Y	S	P	G	S	P	L	L	D	T	R	K	L	Y	S	Q	S	W	D	A	G	L	R	Y	N	G	E	L	I	K	S	Q	L	I	T
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	T	Y	L	D	V	D	W	D	R	F	K	W	D	T	Y	R	A	F	G	S	L	E	Q	Q	L	G	G	G	W	K	G	K	V	S	A	E	Y	Q	E	A	D	S	R	L	R	Y	A	G	S	F	G	A	I	D	P	Q	T	G	D	G	G	Q	L	M	G	A	A	Y	K	F	K	S	I	Q	R	S	L	D	A
Template Known Secondary structure		T				B		T	T																				T	T																							S		B		T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
		288	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Y	S	H	S	K	D	Y	N	Y	D	P	H	Y	G	R	Y	D	S	S	A	T	L	D	E	M	K	Q	Y	T	V	Q	W	A	N	N	V	I	V	G	H	G	S	I	G	A	G	V	D	W	Q	K	Q	T	T	T	P	G	T	G	Y	V	E	D	G	Y	D	Q	R	N	T	G	I	Y	L	T	G	L	Q	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	L	N	G	P	V	R	L	F	G	L	T	H	E	L	L	G	G	V	T	Y	A	Q	G	E	T	R	Q	D	T	A	R	F	L	N	L	P	N	T	P	V	N	V	Y	R	W	D	P	H	G	V	P	R	P	Q	I	G	Q	Y	T	S	P	G	T	T	T	T	T	Q	K	G	L	Y	A	L	G	R	I	K	L
Template Known Secondary structure										T	T																							B	S	S								T	T	T			S	S	S						B				B		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
		368	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	G	D	F	T	F	E	G	A	A	R	S	D	D	N	S	Q	F	G	R	H	G	T	W	Q	T	S	A	G	W	E	F	I	E	G	Y	R	F	I	A	S	Y	G	T	S	Y	K	A	P	N	L	G	Q	L	Y	G	F	Y	G	N	P	N	L	D	P	E	K	S	K	Q	W	E	G	A	F	E	G	L	T	A
Query Conservation
Alig confidence																																																		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	P	L	T	L	V	V	G	G	R	E	S	W	W	D	Q	D	T	P	A	T	R	F	K	P	G	R	Q	F	T	P	Y	G	G	L	I	W	D	F	A	R	D	W	S	W	Y	V	.	.	.	.	.	S	Y	A	E	V	Y	Q	P	P	L	S	P	V	E	G	K	T	Y	E	T	G	I	K	G	E	L	A
Template Known Secondary structure			T	T																	S	S																					T	T						.	.	.	.	.																											G
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.						.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
		448	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.										.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.							.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	V	N	W	R	I	S	G	Y	R	N	D	V	S	D	L	I	D	Y	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	T	L	K	Y	Y	N	E	G	K	A	R	I	K	G	V	E	A	T	A	N	F	D	T	G	P	L	T	H	T	V	S	Y	D	Y	V	D	A	R	N	A	I	T	.	.	.	.	.	.	D
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	G	R	L	N	L	S	L	A	A	F	R	I	D	L	E	N	N	P	Q	E	D	P	D	H	P	G	P	P	N	N	P	F	Y	I	S	G	G	K	V	R	S	Q	G	F	E	L	E	G	T	G	Y	L	T	P	Y	W	S	L	S	A	G	Y	T	Y	T	S	T	E	Y	L	K	D	S	Q	N	D	S	G	T
Template Known Secondary structure		G	G	T																				S	S	S			S	T	T																									T	T																		T	T	S		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
		513	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.					.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.
Query Sequence		T	P	L	L	R	R	A	K	Q	Q	V	K	Y	Q	L	D	W	Q	L	.	.	.	.	Y	D	F	D	W	G	I	T	Y	Q	Y	L	G	T	R	Y	D	K	D	Y	S	S	Y	P	Y	Q	T	V	K	M	G	G	V	S	L	W	D	L	A	V	A	Y	P	V	T	S	H	L	T	V	R	G	K	I	A	N	L
Query Conservation																					.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.																							.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.
Template Sequence		R	Y	S	T	F	T	P	R	H	L	L	R	L	W	S	N	Y	D	L	P	W	Q	D	R	R	W	S	V	G	G	G	L	Q	A	Q	S	D	Y	S	V	D	Y	R	G	V	.	.	.	.	S	M	R	Q	G	G	Y	A	L	V	N	M	R	L	G	Y	K	I	D	E	H	W	T	A	A	V	N	V	N	N	L
Template Known Secondary structure		B	S		T	T	S		S												S																							T	T		.	.	.	.																		S	S	S	S									S	T
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.
Template SS confidence
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.					.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.							.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	D	K	D	Y	E	T	V	Y	G	.	.	.	.	.	.	Y	Q	T	A	G	R	E	Y	T	L	S	G	S	Y	T	F
Query Conservation												.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	D	R	T	Y	Y	Q	S	L	S	N	P	N	W	N	N	R	Y	G	E	P	R	S	F	N	V	S	L	R	G	A	F
Template Known Secondary structure		T											T	T	S		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		689	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720