Job Description P06129 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 10:59:02 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 595 % Identity 17% Template c1xkhC_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: C: PDB Molecule:ferripyoverdine receptor; PDBTitle: pyoverdine outer membrane receptor fpva from pseudomonas aeruginosa2 pao1 bound to pyoverdine Resolution 3.60 Å

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		14	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	F	S	A	W	A	Q	D	T	S	P	D	T	L	V	V	T	A	N	R	F	E	Q	P	R	S	T	V	L	A	P	T	T	V	V	T	R	Q	D	I	D	R	W	Q	S	T	S	V	N	D	V	L	R	R	L	P	G	V	D	I	T	Q	N	G	G	S	G	Q	L	S	S	I	F	I	R	G	T	N	A
Query Conservation
Alig confidence																																																																			.	.
Template Conservation																																																																			.	.
Template Sequence		L	G	T	I	T	E	D	S	G	S	Y	T	P	G	T	I	A	T	A	T	R	L	V	L	T	P	R	E	T	P	Q	S	I	T	V	V	T	R	Q	N	X	D	D	F	G	L	N	N	I	D	D	V	X	R	H	T	P	G	I	T	V	S	A	Y	D	.	.	T	D	R	N	N	Y	Y	A	R	G	F	S	I
Template Known Secondary structure		S				S	S	S	S			S	S						T	T	T	S	S				S	T	T			S													T	T			B	S					T	T	S	T	T								.	.	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Template SS confidence
		137	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.			.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		94	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	H	V	L	V	L	I	D	G	V	R	L	N	L	A	G	V	S	G	S	A	D	L	S	Q	F	P	I	A	L	V	Q	R	V	E	Y	I	R	G	P	R	S	A	V	Y	G	S	D	A	I	G	G	V	V	N	I	I	T	T	R	D	E	P	G	T	E	I	S	A	G	W	G	S	N	S	Y	Q	N	Y	D
Query Conservation
Alig confidence				.	.
Template Conservation				.	.
Template Sequence		N	N	.	.	F	Q	Y	D	G	I	P	S	T	A	R	N	V	G	Y	S	A	G	N	T	L	S	D	X	A	I	Y	D	R	V	E	V	L	K	G	A	T	G	L	L	T	G	A	G	S	L	G	A	T	I	N	L	I	R	K	K	P	T	H	E	F	K	G	H	V	E	L	G	A	G	S	W	D	N	Y	R
Template Known Secondary structure				.	.	B		B	T	T	B							S	T	T			S	T	T			B	S	T	T											G	G	G	T	S		S			S				B									S	S											T	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.
Template SS confidence
		215	.			.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.																																																						.	200
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	S	T	Q	Q	Q	L	G	D	K	T	R	V	T	L	L	G	D	Y	A	H	T	H	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	V
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	E	L	D	V	S	G	P	L	T	E	S	G	N	V	R	G	R	A	V	A	A	Y	Q	D	K	H	S	F	X	D	H	Y	E	R	K	T	S	V	Y	Y	G	I	L	E	F	D	L	N	P	D	T	X	L	T	V	G	A	D	Y	Q	D	N	D	P	K	G	S	G	W	S	G	S	F	P	L	F	D	S	Q
Template Known Secondary structure										S	S	T	T		S															S	S	T	T																	T	T	S																S				S	S	S	S		S	B		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		293	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
		201	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	Y	G	N	T	G	T	Q	A	Q	T	D	N	D	G	F	L	S	K	T	L	Y	G	A	L	E	H	N	F	T	D	A	W	S	G	F	V	R	G	Y	G	Y	D	N	R	T	N	Y	D	A	Y	Y	S	P	G	S	P	L	L	D	T	R	K	L	Y	S	Q	S	W	D	A	G	L	R	Y	N	G	E	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	N	R	N	D	V	S	R	S	F	N	N	G	A	K	W	S	S	W	E	Q	Y	T	R	T	V	F	A	N	L	E	H	N	F	A	N	G	W	V	G	K	V	Q	L	D	H	K	I	N	G	Y	H	A	P	L	G	A	I	X	G	D	W	P	A	P	D	N	S	A	K	I	V	A	Q	K	Y	T	G	E	T
Template Known Secondary structure		S	S	B					T	T				B		T	T																			T	T	S																							S	S				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		373	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
		281	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	K	S	Q	L	I	T	S	Y	S	H	S	K	D	Y	N	Y	D	P	H	Y	G	R	Y	D	S	S	A	T	L	D	E	M	K	Q	Y	T	V	Q	W	A	N	N	V	I	V	G	H	G	S	I	G	A	G	V	D	W	Q	K	Q	T	T	T	P	G	T	G	Y	V	E	D	G	Y	D	Q	R	N	T	G	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	S	N	S	L	D	I	Y	L	T	G	P	F	Q	F	L	G	R	E	H	E	L	V	V	G	T	S	A	S	F	S	H	W	E	G	K	S	Y	W	N	L	R	N	Y	D	N	T	T	D	D	F	I	N	W	D	G	D	I	G	K	P	D	W	G	T	P	S	Q	Y	I	D	D	K	T	R	Q	L	G	S	Y
Template Known Secondary structure																S	S	S	S																									S						S		S	S	S												S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.									.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	L	T	G	L	Q	Q	V	G	D	F	T	F	E	G	A	A	R	S	D	D	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	F	G	R	H	G	T	W	Q	T	S	A	G	W	E	F	I	E	G	Y	R	F	I	A	S	Y	G	T	S	Y	K	A	P	N	L	G	Q	L	Y	G	F	Y	G	N	P	N	L	D	P
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.																																									.	.
Template Conservation																																																																									.	.
Template Sequence		X	T	A	R	F	N	V	T	D	D	L	N	L	F	L	G	G	R	V	V	D	Y	R	V	T	G	L	N	P	T	I	R	E	S	G	R	F	I	P	Y	V	G	A	V	Y	D	L	N	D	T	Y	S	V	Y	A	S	Y	T	D	I	F	X	P	Q	D	S	W	Y	R	D	S	.	.	S	N	K	L	L	E	P
Template Known Secondary structure								S	S	S	S																S	S	S	S																			S	S	S																T	T				S	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.
Template SS confidence
		533	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.			.	.	.	.	.	.	610
		433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.			.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.										.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.		.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure															.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Query SS confidence															.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Query Sequence		E	K	S	K	Q	W	E	G	A	F	E	G	L	.	.	T	A	G	V	N	W	R	I	S	G	Y	R	N	D	V	S	D	L	I	D	Y	D	D	H	T	L	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	N	E	G	K	A	R	I	K	G	V	E	A	T	A	N	F	D	.	T	G	P	L	T	H	T	V	S
Query Conservation															.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Alig confidence															.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation
Template Sequence		D	E	G	Q	N	Y	E	I	G	I	K	G	E	Y	L	D	G	R	L	N	T	S	L	A	Y	F	E	I	H	E	E	N	R	A	E	E	D	A	L	Y	N	S	K	P	T	N	P	A	I	T	Y	A	Y	K	G	I	K	A	K	T	K	G	Y	E	A	E	I	S	G	E	L	A	P	G	W	Q	V	Q	A	G
Template Known Secondary structure																T	T	T	T																				S	S	T	T	S					T	T		S																					S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		611	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.					.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.			.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		Y	D	Y	V	D	A	R	N	A	I	T	D	T	P	L	L	R	R	A	K	Q	Q	V	K	Y	Q	L	D	W	Q	L	.	.	.	.	Y	D	F	D	W	G	I	T	Y	Q	Y	L	G	T	R	Y	D	K	D	Y	S	S	.	.	Y	P	Y	Q	T	V	K	M	G	G	V	S	L	W	D	L	A	V	A	Y	P
Query Conservation																																	.	.	.	.																							.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	T	H	K	I	I	R	D	D	S	G	K	K	V	S	T	W	E	P	Q	D	Q	L	S	L	Y	T	S	Y	K	F	K	G	A	L	D	K	L	T	V	G	G	G	A	R	W	Q	G	K	S	W	Q	X	V	Y	N	N	P	R	S	R	W	E	K	F	S	Q	E	D	Y	W	L	V	D	L	X	A	R	Y	Q
Template Known Secondary structure										T	T			B			T	T	S		S													G	G	G	T	T																				G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		691	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770
		575	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.						.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.
Query Sequence		V	T	S	H	L	T	V	R	G	K	I	A	N	L	F	D	K	D	Y	E	T	V	Y	G	.	.	.	.	.	Y	Q	T	A	G	R	E	Y	T	L	S	G	S	Y	T	F
Query Conservation																										.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	T	D	K	L	S	A	S	V	N	V	N	N	V	F	D	K	T	Y	Y	T	N	I	G	F	Y	T	S	A	S	Y	G	D	P	R	N	L	X	F	S	T	R	W	D	F
Template Known Secondary structure			S	S	S								T	T	T	T								S		S	S	S								S								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		771	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.