Job Description P20099 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:46 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 708 % Identity 20% Template c1kqgA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit; PDBTitle: formate dehydrogenase n from e. coli Resolution 2.80 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.							.	.	.	30	.	.	.					.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Query Sequence		R	Y	S	V	L	T	A	A	H	W	G	P	M	L	V	E	T	D	G	E	.	.	.	.	.	.	T	V	F	S	S	R	G	.	.	.	.	A	L	A	T	G	M	E	N	S	L	Q	S	A	V	R	D	Q	V	H	S	N	T	R	V	R	F	P	M	V	R	K	G	F	L	A	S	P	E	N	P	Q	G	I
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.								.	.	.	.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.								.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	C	T	Y	C	S	V	G	C	G	L	L	M	Y	S	L	G	D	G	A	K	N	A	R	E	A	I	Y	H	I	E	G	D	P	D	H	P	V	S	R	G	A	L	C	P	K	G	A	G	L	L	D	Y	V	N	S	E	N	R	L	R	Y	P	E	Y	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S	B	T	T										S		S		T	T	S											T	T		T	T	T	T	T								T	T					T		T	T	B			S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.													110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	G	Q	D	E	F	V	R	V	S	W	D	E	A	L	D	L	I	H	Q	Q	H	K	R	I	R	E	A	Y	G	P	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	F	A	G	S	Y	G	W	R	S	N	G	V	L	H	K	A	S	T	L	L	Q	R	Y	M	A	L	A	G	G	Y	T	G	H	L
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.	.
Template Sequence		P	G	S	D	K	W	Q	R	I	S	W	E	E	A	F	S	R	I	A	K	L	M	K	A	D	R	D	A	N	F	I	E	K	N	E	Q	G	V	T	V	N	R	W	L	S	T	G	M	L	C	A	S	G	A	S	N	.	.	.	.	E	T	G	M	L	T	Q	K	F	A	R	S	L	G	M	L	A	V	D	N
Template Known Secondary structure		T	T		S	S																														T	T	S						B		S							T	T	S			.	.	.	.													T	T	B
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.	.
Template SS confidence
		116	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.					.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	D	Y	S	T	G	A	A	Q	A	I	M	P	Y	V	V	G	G	S	E	V	Y	Q	Q	Q	T	S	W	P	L	V	L	E	H	S	D	V	V	V	L	W	S	A	N	P	L	N	T	L	K	I	A	W	N	A	S	D	E	Q	G	L	S	Y	F	S	A	L	R	D	S	G	K	K	L	I	C	I	D	P	M
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	A	R	V	H	G	P	T	V	A	S	L	A	P	T	F	G	.	.	.	.	R	G	A	M	T	N	H	W	V	D	I	K	N	A	N	V	V	M	V	M	G	G	N	A	A	E	A	H	P	V	G	F	.	.	.	.	.	.	.	R	W	A	M	E	A	K	N	N	N	D	A	T	L	I	V	V	D	P	R
Template Known Secondary structure		G	G	G														S	.	.	.	.			S		S	S		T	G	G	G	G	G		S						S							S					.	.	.	.	.	.	.										S									S	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.					.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240								.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260
		225	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	S	E	T	V	D	F	F	G	D	K	M	E	W	V	A	P	H	M	G	T	D	V	A	L	M	L	G	I	A	H	T	L	V	E	N	G	W	H	D	E	A	F	L	A	R	C	T	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.
Template Sequence		F	T	R	T	A	.	.	.	S	V	A	D	I	Y	A	P	I	R	S	G	T	D	I	T	F	L	S	G	V	L	R	Y	L	I	E	N	N	K	I	N	A	E	Y	V	K	H	Y	T	N	A	S	L	L	V	R	D	D	F	A	F	E	D	G	L	F	S	G	Y	D	A	E	K	R	Q	Y	D	K	S	S	W
Template Known Secondary structure							.	.	.		T		S							T	T																T	T		S									B	S	T	T	B	B	B		T	T					T	T			T	T			T	T	T	T					T	T	S
Template Predicted Secondary structure							.	.	.
Template SS confidence
		262	.	.	.	.				.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.
																								275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.						.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	A	V	F	A	S	Y	L	L	G	E	S	D	G	I	A	K	T	A	E	W	A	A	E	I	C	G	V	G	A	A	K	I	R	E	L	A	A	I	F	H	Q	.	.	.	.	.	N	T	T	M	L	M	A	G	W	G	M
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	Y	Q	L	D	E	N	G	Y	A	K	R	D	E	T	L	T	H	P	R	C	V	W	N	L	L	K	E	H	V	S	.	.	.	.	.	.	R	Y	T	P	D	V	V	E	N	I	C	G	T	P	K	A	D	F	L	K	V	C	E	V	L	A	S	T	S	A	P	D	R	T	T	T	F	L	Y	A	L	G	W
Template Known Secondary structure		S	B		B		T	T	S	S	B		B		T	T	S		S	T	T	B										T	.	.	.	.	.	.	T																										G	G	G	S	T	T								S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		339	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.							370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
		328	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	Q	Q	F	G	E	Q	K	H	W	M	I	V	T	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	T	P	G	G	G	F	G	L	S	Y	H	F	A	N	G	G	N	P	T	R	R	S	A	V	L	S	S	M	Q	G	S	L	P	G	G	C	D	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	Q	H	T	V	G	A	Q	N	I	R	T	M	A	M	I	Q	L	L	L	G	N	M	G	M	A	G	G	G	V	N	A	L	R	G	H	S	N	I	Q	G	L	T	D	L	G	L	L	S	T	S	L	P	G	Y	L	T	L	P	S	E	K	Q	V	D	L	Q	S	Y	L	E	A	N	T	P	K	A	T	L	A
Template Known Secondary structure			S	S	T	T															T	T		T	T	S	T	T		S							B	T	T							T	T		S	T	T			G	G	G					B	T	T			S									S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
																											390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	K	I	P	V	A	R	I	V	E	A	L	E	N	P	G	G	A	Y	Q	H	N	G	M	N	R	H	F	P	D	I	R	F	I	W	W	A	G	G	A	N	F	T	H	H	Q	D	T	N	R	L	I	R	A
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	Q	V	N	Y	W	S	N	Y	P	K	F	F	V	S	L	M	K	S	F	Y	G	D	A	A	Q	K	E	N	N	W	G	Y	D	W	L	P	K	W	D	Q	T	Y	D	V	I	K	Y	F	N	M	M	D	E	G	K	V	T	G	Y	F	C	Q	G	F	N	P	V	A	S	F	P	D	K	N	K	V	V	S	C
Template Known Secondary structure		S				G	G	G	G														G	G	G			G	G	G	G	G	G	G	G	G	S			B	S	S													T	T									S							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Q	K	P	E	L	V	V	I	S	E	C	F	W	T	A	A	A	K	H	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	V	L	P	A	T	T	S	F	E	R	N	D	L	T	M	T	G	D	Y	S	N	Q	H	L	V	P	M	K	Q	V	V	P	P	R	Y	E	A	R	N	D
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.
Template Conservation																																																										.	.	.
Template Sequence		L	S	K	L	K	Y	M	V	V	I	D	P	L	V	T	E	T	S	T	F	W	Q	N	H	G	E	S	N	D	V	D	P	A	S	I	Q	T	E	V	F	R	L	P	S	T	C	F	A	E	E	D	G	S	I	A	N	.	.	.	S	G	R	W	L	Q	W	H	W	K	G	Q	D	A	P	G	E	A	R	N	D
Template Known Secondary structure			T	T		S							S	B			T	G	G	G	T	T	S			G	G	G	G				G	G	G										B			G	G	G	S							.	.	.	T	T	S									S			S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																																										.	.	.
Template SS confidence
		573	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.				.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.									540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	D	V	F	A	E	L	S	E	R	W	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	G	Y	A	R	F	T	E	G	K	S	E	L	Q	W	L	E	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	N	V	A	R	Q	R	G	A	S	Q	Q	V	E	L	P	P	F	A	E	F	W	Q	A
Query Conservation														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	E	I	L	A	G	I	Y	H	H	L	R	E	L	Y	Q	S	E	G	G	K	G	V	E	P	L	M	K	M	S	W	N	Y	K	Q	P	H	E	P	Q	S	D	E	V	A	K	E	N	N	G	Y	A	L	E	D	L	Y	D	A	N	G	V	L	I	A	K	K	G	Q	L	L	S	S	F	A	H	L	R	D	D
Template Known Secondary structure																						S	S							S					S	S	T	T	S															S	S					T	T	S						T	T		B		S		G	G	G			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		564	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	Q	L	I	E	M	P	E	N	P	D	S	E	R	F	I	R	F	A	D	F	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	T	A	S	S	C	W	I	Y	T	G	S	W	T	E	Q	G	N	Q	M	A	N	R	D	N	S	D	P	S	G	L	G	N	T	L	G	W	A	W	A	W	P	L	N	R	R	V	L	Y	N	R	A	S	A	D	I	N	G	K	P	W	D	P	K	R	M	L	I	Q	W	N	G	S	K	W	T	G	N	D
Template Known Secondary structure		S	S				S		G	G	G	T	T	S			T	T			G	G	G		B					T	T	S	S	S			T	T	B	S			T	T	T	T		S	S	T	T	G	G	G	G	B		T	T	S		B	S	S	G	G	G							S	S	S				S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.
			586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.				.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630																											.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																												.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.																												.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	R	D	P	L	A	H	P	L	K	T	A	S	G	K	I	E	I	F	S	Q	R	I	A	D	Y	G	Y	.	.	.	P	D	C	P	G	H	P	M	W	L	E	P	D	E	W	Q	G	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	E	P	E	Q
Query Conservation		.																												.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																												.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	P	D	F	G	N	A	A	P	G	T	P	T	G	P	F	I	M	Q	P	E	G	M	G	R	L	F	A	I	N	K	M	A	E	G	P	F	P	E	H	Y	E	P	I	E	T	P	L	G	T	N	P	L	H	P	N	V	V	S	N	P	V	V	R	L	Y	E	Q	D	A	L	R	M	G	K	K	E	Q	F	P
Template Known Secondary structure				S	S		S			T	T	S	S			S		T	T	S	T	T	S	S	B		S	S		T	T		S	T	T		S	S							S	S		T	T	S	S		T	T		T	T			S		T	T									T	T				T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		636	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	Q	V	L	S	A	H	P	A	H	R	L	H	S	Q	L	N	Y	S	S	L	R	E	L	Y	A	V	A	N	R	E	P	V	T	I	H	P	D	D	A	Q	E	R	G	I	Q	D	G	D	T	V	R	L	W	N	A	R	G	Q	I	L	A	G	A	V	I	S	E	G	I	K	P	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.
Template Sequence		Y	V	G	T	T	Y	R	L	T	E	H	F	H	T	W	T	K	H	.	.	A	L	L	N	A	I	A	Q	P	E	Q	F	V	E	I	S	E	T	L	A	A	A	K	G	I	N	N	G	D	R	V	T	V	S	S	K	R	G	F	I	R	A	V	A	V	V	T	R	R	L	K	P	L	N	V	N	G	Q	Q	V
Template Known Secondary structure										T	T			T	T	T	G	G	G	.	.	S							S		S														T			T	T								T	T											T	T	S						T	T
Template Predicted Secondary structure																				.	.
Template SS confidence
		890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.			.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.
		708	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	I	C	I	H	E	G	A	W	P	D	L	D	L	T	A	D	G	I	C	K	N	G	A	V	N	V	L	T	K	D	L	P	S	S	R	L	G	N	G	C	A	G	N	T	A	L	A	W	L	E	K	Y
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.													.
Template Conservation																		.	.	.	.	.													.
Template Sequence		E	T	V	G	I	P	I	H	W	G	F	E	G	V	A	R	.	.	.	.	.	K	G	Y	I	A	N	T	L	T	P	N	V	.	G	D	A	N	S	Q	T	P	E	Y	K	A	F	L	V	N	I	E	K	A
Template Known Secondary structure												S	S	S	S	S		.	.	.	.	.					G	G	G	S			S		.	B		T	T	T			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.													.
Template SS confidence
		968	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.						.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.		.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.