Job Description P20099 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:37:46 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 711 % Identity 16% Template c1g8jC_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: C: PDB Molecule:arsenite oxidase; PDBTitle: crystal structure analysis of arsenite oxidase from2 alcaligenes faecalis Resolution 2.03 Å

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.						.	.	.	30	.	.				.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.						.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.							.	.	.																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.							.	.	.																							.	.	.	.	.
Query Sequence		A	N	S	S	S	R	Y	S	V	L	T	A	A	H	W	G	P	M	L	V	E	T	D	G	E	.	.	.	.	.	T	V	F	S	S	R	.	.	.	G	A	L	A	T	G	M	E	N	S	L	Q	S	A	V	R	D	Q	V	H	S	N	.	.	.	.	.	T	R	V	R	F	P	M	V	R	K	G	F	L	A
Query Conservation																											.	.	.	.	.							.	.	.																							.	.	.	.	.
Alig confidence																											.	.	.	.	.							.	.	.																							.	.	.	.	.												.	.	.
Template Conservation																																																																															.	.	.
Template Sequence		L	D	F	R	K	Q	L	P	P	L	A	S	T	L	T	P	A	M	T	N	V	V	T	E	H	D	G	A	R	Y	D	I	M	V	V	P	D	K	A	C	V	V	N	S	G	L	S	S	T	R	G	G	K	M	A	S	Y	M	Y	T	P	T	G	D	G	K	E	R	L	S	A	P	R	L	Y	A	A	.	.	.
Template Known Secondary structure					S	S				T	T	S					G	G	G							T	T	S											T	T		T	T	T	T	T				T	T	G	G	G	T	G	G	G	S			S	S	S	T	T	T	T				S						T	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Template SS confidence
		52	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.
		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.			.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																												.	.
Query SS confidence																																																																												.	.
Query Sequence		S	P	E	N	P	Q	G	I	R	G	Q	D	E	F	V	R	V	S	W	D	E	A	L	D	L	I	H	Q	Q	H	K	R	I	R	E	A	Y	G	P	A	S	I	F	A	G	S	Y	G	W	R	S	N	G	V	L	H	K	A	S	T	L	L	Q	R	Y	M	A	L	A	G	G	Y	T	G	.	.	H	L	G	D
Query Conservation																																																																												.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	W	V	D	T	T	W	D	H	A	M	A	L	Y	A	G	L	I	K	K	T	L	D	S	D	G	P	Q	G	V	F	F	S	C	F	D	H	G	G	A	G	G	G	F	E	N	T	W	G	T	G	K	L	M	F	S	A	I	Q	T	P	M	V	R	I	H	N	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T																									T		G	G	G										S	T	T															T	T	S								S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
													129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.										.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	S	T	G	A	A	Q	A	I	M	P	Y	V	V	G	G	S	E	V	Y	Q	Q	Q	T	S	W	P	L	V	L	E	H	S	D	V	V	V	L	W	S	A	N	P	L	N	T	L	K	I	A	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	S	D	E	Q	G	L	S	Y	F	S	A	L	R	D	S	G	K	K
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence															.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.	.	.
Template Sequence		P	A	Y	N	S	E	C	H	A	T	R	E	M	.	.	.	.	.	G	I	G	E	L	N	N	A	Y	E	D	A	Q	L	A	D	V	I	W	S	I	G	N	N	P	Y	E	S	Q	T	N	Y	F	L	N	H	W	L	P	N	L	Q	G	A	T	T	S	K	K	K	E	R	F	P	N	E	N	F	P	Q	A	R
Template Known Secondary structure		S	S	S			T	T						T	.	.	.	.	.	T			S			S		T	T						S						S							S							T						T	T	T	T								S	S	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210						.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		218	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.									.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	C	I	D	P	M	R	S	E	T	V	D	F	F	G	D	K	M	.	.	.	.	.	.	.	.	E	W	V	A	P	H	M	G	T	D	V	A	L	M	L	G	I	A	H	T	L	V	E	N	G	W	H	D	E	A	F	L	A	R	C	T	T	G	Y	A	V	F	A	S	Y	L	L	G	E	S	D	G	I
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	I	F	V	D	P	R	E	T	P	S	V	.	.	.	A	I	A	R	H	V	A	G	N	D	R	V	L	H	L	A	I	E	P	G	T	D	T	A	L	F	N	G	L	F	T	Y	V	V	E	Q	G	W	I	D	K	P	F	I	E	A	H	T	K	G	F	D	D	A	V	K	.	.	.	.	.	.	.	T	N
Template Known Secondary structure							S	S						.	.	.									G	G	G								T	T																	T		S																		.	.	.	.	.	.	.		T
Template Predicted Secondary structure														.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.				.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340								.	.
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.								.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	K	T	A	E	W	A	A	E	I	C	G	V	G	A	A	K	I	R	E	L	A	A	I	F	H	Q	.	.	.	.	.	.	.	N	T	T	M	L	M	A	G	W	G	M	Q	R	Q	Q	F	G	E	Q	K	H	W	M	I	V	T	L	A	A	M	L	G	Q	I	G	T	P	G	G	G	F	G	L	S	Y	H
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	L	S	L	D	E	C	S	N	I	T	G	V	P	V	D	M	L	K	R	A	A	E	W	S	Y	K	P	K	A	S	G	Q	A	P	R	T	M	H	A	Y	E	K	G	I	I	W	G	N	D	N	Y	V	I	Q	S	A	L	L	D	L	V	I	A	T	H	N	V	G	R	R	G	T	G	C	V	R	M	G	G
Template Known Secondary structure																												S			T	T	S	S														T	S	T	T															T	T		S	S	S	T	T								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		343	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
		363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	A	N	G	G	N	P	T	R	R	S	A	V	L	S	S	M	Q	G	S	L	P	G	G	C	D	A	V	D	K	I	P	V	A	R	I	V	E	A	L	E	N	P	G	G	A	Y	Q	H	N	G	M	N	R	H	F	P	D	I	R	F	I	W	W	A	G	G	A	N	F	T	H	H	Q	D	T	N	R	L	I
Query Conservation
Alig confidence																										.	.
Template Conservation																										.	.
Template Sequence		H	Q	E	G	Y	T	R	P	P	Y	P	G	D	K	K	I	Y	I	D	Q	E	L	I	K	.	.	G	K	G	R	I	M	T	W	W	G	C	N	N	F	Q	T	S	N	N	A	Q	A	L	R	E	A	I	L	Q	R	S	A	I	V	K	Q	A	M	Q	K	A	R	G	A	T	T	E	E	M	V	D	V	I	Y
Template Known Secondary structure		B		B								S		S	S											.	.	T			S						S							S	T	T																						T	T	T
Template Predicted Secondary structure																										.	.
Template SS confidence
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.			.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
		443	.	.	.	.	.	.		450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.																																																																						.	.	.
Query SS confidence									.																																																																						.	.	.
Query Sequence		R	A	W	Q	K	P	E	.	L	V	V	I	S	E	C	F	W	T	A	A	A	K	H	A	D	I	V	L	P	A	T	T	S	F	E	R	N	D	L	T	M	T	G	D	Y	S	N	Q	H	L	V	P	M	K	Q	V	V	P	P	R	Y	E	A	R	N	D	F	D	V	F	A	E	L	S	E	R	W	.	.	.
Query Conservation									.																																																																						.	.	.
Alig confidence									.																																			.	.	.																																	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.
Template Sequence		E	A	T	Q	N	G	G	L	F	V	T	S	I	N	L	Y	P	T	K	L	A	E	A	A	H	L	M	L	P	A	A	H	P	G	E	M	N	L	T	S	M	N	.	.	.	G	E	R	R	I	R	L	S	E	K	F	M	D	P	P	G	T	A	M	A	D	C	L	I	A	A	R	I	A	N	A	L	R	D	M
Template Known Secondary structure				T	T	T	T									S	S		T	G	G	G	G	T		S					B			B	T	T	B							.	.	.	T	T										S			S	T	T		B
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.
Template SS confidence
		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.				.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.
						519	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.											.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	E	K	G	G	Y	A	R	F	T	E	G	K	S	E	L	Q	W	L	E	T	F	Y	N	V	A	R	Q	R	G	A	S	Q	Q	V	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	F	A	E	F	W	Q	A	N	Q	L	I	E	M	P	E	N	P	D	S	E	R	F	I	R	F	A	D	F
Query Conservation		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	Q	K	D	G	K	A	E	M	A	A	Q	F	E	G	F	D	W	K	T	E	E	D	A	F	N	D	G	F	R	R	A	G	Q	P	G	A	P	A	I	D	S	Q	G	G	S	T	G	H	L	V	T	Y	D	R	L	R	K	S	G	N	N	G	V	Q	L	P	V	V	S	W	D	E	S	K	G	L	V	G	T
Template Known Secondary structure				T	T	T								T		S				S	S								T	T	T	T	T	T		T	T							T	T	G	G	G	G	G	G										G	G	G				S	S			B			T	T	T			B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		578	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	R	D	P	L	A	H	P	L	K	T	A	S	G	K	I	E	I	F	S	Q	R	I	A	D	Y	G	Y	P	D	C	P	G	H	P	M	W	L	E	P	D	E	W	Q	G	N	A	E	P	E	Q	L	Q	V	L	S	A	H	P	A	H	R	L	H	S	Q	L	N	Y	S	S	L	R	E	L	Y	A	V	A	N
Query Conservation
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	M	L	Y	T	E	G	K	F	D	T	D	D	G	K	A	H	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	P	W	N	G	L	P	A	T	V	Q	Q	Q	K	D	K	Y	R	F	W	L	N	N	G	R	N	N	E	V	W	Q	T	A	Y	H	D	Q	Y	N	S	L	M	Q	E	R	Y	P
Template Known Secondary structure		S		S		T	T	S			S	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S												S									S	S			T	T		T	T	G	G	G									S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		658	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.														.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.
		665	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	P	V	T	I	H	P	D	D	A	Q	E	R	G	I	Q	D	G	D	T	V	R	L	W	N	A	R	G	Q	I	L	A	G	A	V	I	S	E	G	I	K	P	G	V	I	C	I	H	E	G	A	W	P	D	L	D	L	T	A	D	G	I	C	K	N	G	A	V	N	V	L	T	K	D	L	P	S	S	R
Query Conservation
Alig confidence																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Conservation																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template Sequence		M	A	Y	I	E	M	N	P	D	D	C	K	Q	L	D	V	T	G	G	D	I	V	E	V	Y	N	D	F	G	S	T	F	A	M	V	Y	P	V	A	E	I	K	R	G	Q	T	F	M	L	F	G	Y	V	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	Q	G	D	V	T	T	D	W	.	T	D	R
Template Known Secondary structure		S														T			T	T								T	T											T	T	S		T	T							S		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		G	G	G	G			S		.	B		T
Template Predicted Secondary structure																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.
Template SS confidence
		725	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.													.	780	.	.	.	.	.	.	.	.		.	790	.
		745	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770				.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.
Query Sequence		L	G	N	G	C	A	G	N	T	A	L	A	W	L	E	K	Y	N	G	P	E	L	T	L	T	A	.	.	.	F	E	P	P
Query Conservation																												.	.	.
Alig confidence				.															.									.	.	.
Template Conservation				.															.
Template Sequence		D	I	.	I	P	Y	Y	K	G	T	W	G	D	I	R	K	V	.	G	S	M	S	E	F	K	R	T	V	S	F	K	S	R
Template Known Secondary structure		T		.		B		T	T										.													S
Template Predicted Secondary structure				.															.
Template SS confidence
		792	.		.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.		.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.