Job Description P75733 Confidence 94.88% Date Thu Jan 5 12:13:33 GMT 2012 Rank 9 Aligned Residues 299 % Identity 16% Template d2fgqx1 SCOP info Transmembrane beta-barrels Porins Porin Resolution 1.45

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		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	L	T	G	G	I	Y	Y	W	Q	R	E	R	D	R	K	D	V	T	D	G	D	K	Y	K	T	N	L	S	H	S	T	W	N	A	N	L	D	F	Q	S	G	Y	A	A	D	M	F	G	L	D	I	A	A	F	T	A	I	E	M	A	E	N	G	D	S	S	H	P	N	E	I	A	F	S	K	S	N	K	A
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	F	G	I	V	D	T	N	V	A	Y	V	N	K	D	A	A	G	D	S	R	Y	G	L	G	T	S	G	A	S	T	S	R	L	G	L	R	G	T	E	D	.	.	.	.	.	L	G	G	G	L	K	A	G	F	W	L	E	G	E	I	F	G	D	D	G	N	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure															S			T	T	S										S	S	S												.	.	.	.	.			T	T													T	T	T	T	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.						.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	D	E	D	W	S	G	D	K	S	G	I	S	L	Y	K	A	A	A	K	F	K	Y	G	P	V	W	A	R	A	G	Y	I	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	T	G	Q	T	L	L	A	P	H	W	S	F	M	P	G	T	Y	Q	G	A	E	A
Query Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	N	F	K	R	R	S	T	V	S	L	S	G	N	F	G	E	V	R	L	G	R	D	L	V	P	T	S	Q	K	L	T	S	Y	D	L	F	S	A	T	G	I	G	P	F	M	G	F	R	N	W	A	A	G	Q	G	A	D	D	N	G	I	R	A	N	N	L	I	S	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.						S									T	T						S	S										G	G	G		T	T	T	T		S	S	S	S				S	S		T	T				S	T	T	T	T	S	S			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	N	F	D	Y	G	D	A	G	A	L	S	F	S	Y	M	W	T	N	E	Y	K	A	P	W	H	L	E	M	D	E	F	Y	Q	N	D	K	T	T	K	V	D	Y	L	H	S	F	G	A	K	Y	D	F	K	N	N	F	V	L	E	A	A	F	G	Q	A	E	G	Y	I	D	Q	Y	F	A	K	A	S	Y
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	T	P	.	.	.	.	N	F	G	G	F	N	A	G	F	G	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	E	K	Q	T	I	G	T	A	D	S	V	G	R	Y	I	G	G	Y	V	A	Y	D	.	N	G	P	L	S	A	S	L	G	L	A	Q	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.	.	.	.		B	T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T			B	T	T	B	S	S	T	T											.		S	S												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		141	.	.					.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.											.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.		180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	F	D	I	A	G	S	P	L	T	T	S	Y	Q	F	Y	G	T	R	D	K	V	D	D	R	S	V	N	D	L	Y	D	G	T	A	W	L	Q	A	L	T	F	G	Y	R	A	A	D	V	V	D	L	R	L	E	G	T	W	V	K	A	D	G	Q	Q	G	Y	F	L	Q	R	M	T	P	T	Y	A	S	S	N
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	A	V	G	G	L	A	T	D	R	D	E	I	T	L	G	A	S	Y	N	F	.	.	.	G	V	A	K	L	S	G	L	L	Q	Q	T	K	F	K	R	D	I	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T																	.	.	.	S	S															T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																									194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.				.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	R	L	D	I	W	W	D	N	R	S	D	F	N	A	N	G	E	K	A	V	F	F	G	A	M	Y	D	L	K	N	W	N	L	P	G	F	A	I	G	A	S	Y	V	Y	A	W	D	A	K	P	A	T	W	Q	S	N	P	D	A	Y	Y	D	K	N	R	T	I	E	E	S	A	Y	S	L	D	A	V	Y	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	I	K	T	N	S	Y	M	L	G	A	S	A	P	V	.	.	.	.	G	G	V	G	E	V	K	L	Q	Y	A	L	Y	D	Q	K	A	I	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	H	Q	I	T	L	G	Y	V	H	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	T	T	T													G	G	G	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.					250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.																270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.							.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	Q	D	G	R	A	K	G	T	M	F	K	L	H	F	T	E	Y	D	N	H	S	.	.	.	.	.	.	D	I	P	S	W	G	G	G	Y	G	N	I	F	Q	D	E	R	D	V	K	F	M	V	I	A	P	F
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.
Template Sequence		L	S	.	.	.	.	K	R	T	A	L	Y	G	N	L	A	F	L	K	N	K	D	A	S	T	L	G	L	Q	A	K	G	V	Y	A	G	G	V	Q	A	G	E	S	Q	T	G	V	Q	V	G	I	R	H	A	F
Template Known Secondary structure		S	S	.	.	.	.	S	S														T	T							B	T	T	T	B		S				T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.
Template SS confidence
		282	.					.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.