Job Description P37692 Confidence 97.55% Date Thu Jan 5 11:57:14 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 320 % Identity 13% Template c2r60A_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:glycosyl transferase, group 1; PDBTitle: structure of apo sucrose phosphate synthase (sps) of2 halothermothrix orenii Resolution 1.80 Å

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		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.																.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50										.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	K	I	L	V	I	G	P	S	W	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	M	M	M	S	Q	S	L	Y	R	T	L	Q	A	R	Y	P	Q	A	I	I	D	V	M	A	P	A	W	C	R	P	L	L	S	R	M	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	N	E	A	I	P
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																												.	.
Template Sequence		K	H	V	A	F	L	N	P	Q	G	N	F	D	P	A	D	S	Y	W	T	E	H	P	D	F	G	G	Q	L	V	Y	V	K	E	V	S	L	A	L	A	E	M	.	.	G	V	Q	V	D	I	I	T	R	R	I	K	D	E	N	W	P	E	F	S	G	E	I	D	Y	Y	Q	E	T	N	K	V	R	I	V	R
Template Known Secondary structure										S	S				T	T		T	T	T	T	S	B	T	T	B	S																T	.	.	T												B	T	T	B	G	G	G			S					T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.			50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
		57	.	.	60	.	.	.	.	.												.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.			.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Query Sequence		M	P	L	G	H	G	A	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	G	E	R	R	K	L	G	H	S	L	R	E	K	R	Y	D	R	A	Y	V	L	.	.	P	N	S	F	K	S	A	L	V	P	F	F	A	G	I	P	H	R	T	G	W	R	G	E	M	R	Y	G	L	L	N	D	V	R	V	L
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	P	F	G	G	D	K	F	L	P	K	E	E	L	W	P	Y	L	H	E	Y	V	N	K	I	I	N	F	Y	R	E	E	G	K	F	P	Q	V	V	T	T	H	Y	G	D	G	G	L	A	G	V	L	L	K	N	I	K	G	L	P	F	T	F	T	G	H	S	L	G	A	Q	K	M	E	K	L	N	V	N	T
Template Known Secondary structure					S		S	S				G	G	G		G	G	G																T				S																													S	S								T	T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	K	E	A	W	P	L	M	V	E	R	Y	I	A	L	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	K	G	I	M	R	T	A	Q	D	L	P	Q	P	L	L	W	P	Q	L	Q	V	S
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	N	F	K	E	M	D	E	R	F	K	F	H	R	R	I	I	A	E	R	L	T	M	S	Y	A	D	K	I	I	V	S	T	S	Q	E	R	F	G	Q	Y	S	H	D	L	Y	R	G	A	V	N	V	E	D	D	D	K	F	S	V	I	P	P	G	V	N	T	R	V	F	D	G	E	Y	G	D	K	I	K	A
Template Known Secondary structure		T	T	S																								S					S	S							T	T	T	S	G	G	G	T	T	T			T	T		G	G	G								B		T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		166	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220														.	.	.	.	.	.	.	.	.	230
Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	G	E	K	S	Y	T	C	N	Q	F	S	L	S	S	E	R	P	M	I	G	F	C	P	G	A	E	F	G	P	A	K	R	W	P	H	Y	H	Y	A	E	L	A	K	Q	L	I	D	E	G	Y	Q	V	V	L	F	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	K	D	H	E	A	G	N	E
Query Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																															.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.
Template Sequence		K	I	T	K	Y	L	E	R	D	L	G	S	E	R	M	E	L	P	A	I	I	A	S	S	R	L	D	Q	K	K	N	H	Y	G	L	V	E	A	Y	V	Q	N	K	E	L	.	.	Q	D	K	A	N	L	V	L	T	L	R	G	I	E	N	P	F	E	D	Y	S	R	A	G	Q	E	E	K	E	I	L	G	K
Template Known Secondary structure											S		G	G	G	T	T	S							S				G	G	G											T					.	.											S	S		S	B	T	T	T	B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290			.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		231	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.					.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270						.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.													.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.													.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	A	A	L	N	T	E	Q	Q	A	W	C	R	N	L	A	G	E	T	Q	L	D	Q	A	V	I	L	.	.	.	.	I	A	A	C	K	A	I	V	T	N	D	S	.	.	.	.	.	G	L	M	H	V	A	A	A	L	N	R	P	L	V	A	L	Y	G	P	S	S	P	D	F	T	P	P	L	S	H	K
Query Conservation																														.	.	.	.													.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.													.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	I	E	L	I	D	N	N	D	C	R	G	K	V	S	M	F	P	L	N	S	Q	Q	E	L	A	G	C	Y	A	Y	L	A	S	K	G	S	V	F	A	L	T	S	F	Y	E	P	F	G	L	A	P	V	E	A	M	A	S	G	L	P	A	V	V	T	R	N	G	G	P	A	E	I	L	D	G	G	K	Y	G
Template Known Secondary structure									T	T		B	T	T								S														T	T								S		B				S								T	T							S	S	B						T	G	G	G	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	R	V	I	R	L	I	T	G	Y	H	K	V	R	K	G	D	A	A	E	G	Y	H	Q	S	L	I	D	I	T	P	Q	R	V	L	E	E	L	N	A	L	L	L	Q	E	E
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	D	P	E	D	P	E	D	I	A	R	G	L	L	K	A	F	E	S	E	E
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T														S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		404	.																								.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low