Job Description P31441 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:47:32 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 328 % Identity 17% Template c3dc8B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:dihydropyrimidinase; PDBTitle: crystal structure of dihydropyrimidinase from sinorhizobium meliloti Resolution 1.85 Å

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		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.							.	100	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	I	I	D	N	V	S	I	L	D	L	I	N	G	G	E	I	S	G	P	I	V	I	K	G	R	Y	I	A	G	V	G	A	E	Y	T	D	A	P	A	L	Q	R	I	D	A	R	G	A	T	A	V	P	G	F	I	D	A	H	L	H	I	E	S	S	M	M	.	.	.	.	.	.	T	P	V	T	F	E	T
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																						.	.	.																															.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.																						.	.	.
Template Sequence		T	V	I	K	G	G	T	I	V	T	A	.	.	D	L	T	Y	K	A	D	V	K	V	E	G	G	R	I	V	E	I	G	P	N	.	.	.	L	S	G	A	E	T	L	D	A	T	G	C	Y	V	M	P	G	G	I	D	P	H	T	H	L	E	M	P	F	M	G	T	Y	S	S	D	D	F	E	S	G	T	R
Template Known Secondary structure						S						S	.	.	S											T	T							S	S	.	.	.				S						T	T														T	T				T	T				S
Template Predicted Secondary structure													.	.																						.	.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.			.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.				.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	L	P	R	G	L	T	T	V	I	C	D	P	H	E	I	V	N	V	M	G	E	A	G	F	A	W	F	A	R	C	A	E	Q	A	R	Q	N	Q	Y	L	Q	V	S	S	C	V	P	A	L	E	G	C	D	V	N	G	A	S	F	T	L	E	Q	M	L	A	W	R	D	H	P	Q	V	T	G	L	A	E
Query Conservation
Alig confidence																							.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	L	A	G	G	T	T	M	V	V	D	F	A	L	P	S	G	Q	S	L	.	L	E	A	L	T	M	W	D	N	K	S	T	R	A	N	C	D	Y	S	F	H	M	A	I	T	W	W	G	E	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	N	E	M	E	T	I	V	K	D	K	G	I	N	T	F	H	F
Template Known Secondary structure						T	T																.											T	T	T		S	S										S		S			.	.	.	.	.	.	.	.	.												S				B			B
Template Predicted Secondary structure																							.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.		.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.										.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.			.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				220	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	M	D	Y	P	G	V	I	S	G	Q	N	A	L	L	D	K	L	D	A	F	R	.	.	H	L	T	L	D	G	H	C	P	G	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	E	L	N	A	Y	I	T
Query Conservation																								.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	A	Y	K	G	A	L	M	V	D	D	D	E	M	F	S	S	F	Q	R	C	A	A	L	G	A	L	P	L	V	H	A	E	N	G	D	V	V	A	Q	L	Q	A	K	L	L	A	E	G	N	S	G	P	E	A	H	A	Y	S	R	P	A	E	V	E	G	E	A	A	N	R	A	I	M	I	A	D	M	A	G
Template Known Secondary structure		S		S	T	T	T	T	B																	T		B				B		S															T	T			S							T	S																				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240			.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	I	E	N	C	H	E	S	Y	Q	L	.	.	E	E	G	R	R	K	L	Q	L	G	M	S	L	M	I	R	E	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	R	N	L	N	A	L	A	P	L	I	N	E	F	N	S	P	Q
Query Conservation														.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																																																																													.	.
Template Sequence		C	P	V	Y	I	V	H	T	S	C	E	Q	A	H	E	A	I	R	R	A	R	A	K	G	M	R	V	F	G	E	P	L	I	Q	H	L	T	L	D	E	T	E	Y	F	D	K	D	W	D	H	A	A	R	R	V	M	S	P	P	F	R	N	K	L	H	Q	D	S	L	W	A	G	L	A	S	.	.	G	S	L
Template Known Secondary structure							S	S			S													T	T								B								G	G	G	G	G		S	S							T			S	S					G	G	G											.	.	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.			.	.	.
		279	280	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.		.	.	.	.	.	.	.	340
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Query Sequence		C	M	L	C	T	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	P	W	E	I	A	H	E	G	H	I	D	A	L	I	R	R	L	I	E	Q	H	N	V	P	L	H	V	A	Y	R	V	A	S	W	S	T	A	R	H	F	G	L	N	H	L	.	G	L	L	A	P	G	K	Q
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.
Template Conservation
Template Sequence		Q	V	V	A	T	D	H	C	A	F	T	T	E	Q	K	R	F	G	V	G	D	F	T	R	I	P	N	G	T	G	G	L	E	D	R	M	P	M	L	W	T	Y	G	V	A	T	G	R	I	T	M	N	E	F	V	A	V	T	S	T	N	I	A	K	I	L	N	I	Y	P	K	K	G	A	I	L	V	G	A	D
Template Known Secondary structure					B			B									G	G	G	T	T		G	G	G	S							T	T	T										T	T	T	T	S	S										T							T	T		T	T	T	S	S			S	T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
		341	.	.	.	.	.	.																				.	.	350	.	.	.					.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Query Sequence		A	D	I	V	L	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	R	K	V	T	.	.	.	.	V	Q	Q	V	L	V	K	G	E	P	I	D	A	Q	T	L	Q	A	E	E	S	A	R
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	L	V	V	W	D	P	K	R	S	K	T	I	S	A	K	T	Q	Q	S	A	I	D	Y	N	V	F	E	G	K	T	V	T	G	L	P	R	F	T	L	T	R	G	V	V	S	I	E	E	G	T	V	K	T	Q	E	G	H
Template Known Secondary structure																	G	G	G		S	S	S	S	S			T	T	T	T													T	T						T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.