Job Description P31441 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:47:32 GMT 2012 Rank 52 Aligned Residues 332 % Identity 17% Template c2oodA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:blr3880 protein; PDBTitle: crystal structure of guanine deaminase from bradyrhizobium japonicum Resolution 2.62 Å

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		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.														.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.				.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Query Sequence		Y	I	I	D	N	V	S	I	L	D	L	I	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	I	S	G	P	I	V	I	K	G	R	Y	I	A	G	V	G	A	E	Y	.	.	.	T	D	A	P	A	L	Q	R	I	D	A	R	G	A	T	A	V	P	G	F	I	D	A	H	L	H	I	E	S
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	V	G	I	R	G	T	F	F	D	F	V	D	D	P	W	K	H	I	G	N	E	Q	A	A	A	R	F	H	Q	D	G	L	X	V	V	T	D	G	V	I	K	A	F	G	P	Y	E	K	I	A	A	A	H	P	G	V	E	I	T	H	I	K	D	R	I	I	V	P	G	F	I	D	G	H	I	H	L	P	Q
Template Known Secondary structure													S	S		G	G	G	S	T	T		G	G	G	G													S	S	B														S	T	T																						G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
		96	.	.	.																																100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	M	M	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	T	F	E	T	A	T	L	P	R	G	L	T	T	V	I	C	D	P	H	E	I	V	N	V	M	G	E	A	G	F	A	W	F	A	R	C	A	E	Q	A	R	Q	N
Query Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.
Template Sequence		T	R	V	L	G	A	Y	G	E	Q	L	L	P	W	L	Q	K	S	I	Y	P	E	E	I	K	Y	K	D	R	N	Y	A	R	E	G	V	K	R	F	L	D	A	L	L	A	A	G	T	T	T	C	Q	A	F	T	.	.	.	.	.	S	S	S	P	V	A	T	E	E	L	F	E	E	A	S	R	R	N	X	R
Template Known Secondary structure		T	T		T	T			S											T					G	G	G	G	S																		T	T									.	.	.	.	.		S	S															T
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.						140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.						.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	Y	L	Q	V	S	S	C	V	P	A	L	E	G	C	D	V	N	G	A	S	F	T	L	E	Q	M	L	A	W	R	D	H	.	.	.	.	.	P	Q	V	T	G	L	A	E	M	M	D	Y	P	G	V	I	S	G	Q	N	A	L	L	D	K	L	D	A	F	R	H	L	T	L	D	G	H	C	P	G	L	G
Query Conservation																																			.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	I	A	G	L	T	G	I	D	R	N	A	P	A	E	F	I	D	T	P	E	N	F	Y	R	D	S	K	R	L	I	A	Q	Y	H	D	K	G	R	N	L	Y	A	I	T	P	R	F	A	F	G	A	S	P	E	L	L	K	A	C	Q	R	L	K	H	E	H	P	D	C	W	V	N	T	H	I	S	E	N	P
Template Known Secondary structure											S	S	S		T	T	T																			T	T	B	T	T									B	G	G	G																	T	T	S							S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.				.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Query Sequence		G	K	E	L	N	A	Y	I	T	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	E	N	C	H	E	S	Y	Q	L	E	E	G	R	R	K	L	Q	L	G	M	S	L	M	I	R	E	G	S	A	A	.	.	.	R	N	L	N	A	L	A	P	L	I	N	E	F	N	S	P
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	E	C	S	G	V	L	V	E	H	P	D	C	Q	D	Y	L	G	V	Y	E	K	F	D	L	V	G	P	K	F	S	G	G	H	G	V	Y	L	S	N	N	E	F	R	R	X	S	K	K	G	A	A	V	V	F	C	P	C	S	N	L	F	L	G	S	G	L	F	R	L	G	R	A	T	D	P	E	H	R	V
Template Known Secondary structure												T	T		S	S							T	T	T			S	T	T							T	T													T													T	T										T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Query Sequence		Q	C	M	L	C	T	D	D	R	N	P	W	E	I	A	H	E	G	H	I	D	A	L	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	R	L	I	E	Q	H	N	V	P	L	H	V	A	Y	R	V	A	S	W	S	T	A	R	H	F	G	L	N	H	L	.	G	L	L	A
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.
Template Conservation
Template Sequence		K	X	S	F	G	T	D	V	G	G	G	N	R	F	S	X	I	S	V	L	D	D	A	Y	K	V	G	X	C	N	N	T	L	L	D	G	S	I	D	P	S	R	K	D	L	A	E	A	E	R	N	K	L	S	P	Y	R	G	F	W	S	V	T	L	G	G	A	E	G	L	Y	I	D	D	K	L	G	N	F	E
Template Known Secondary structure									B	T	T	B	S																						S	S	S	S	S		G	G	G									T											T	T							T	T		T	T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	G	K	Q	A	D	I	V	L	L	S	D	A	R	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	Q	Q	V	L	V	K	G	E	P	I	D	A	Q	T
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	K	E	A	D	F	V	A	L	D	P	N	G	G	Q	L	A	Q	P	W	H	Q	S	L	I	G	A	G	P	R	T	V	D	E	A	A	S	X	L	F	A	V	X	X	V	G	D	D	R	C	V	D	E	T	W	V	X	G	K	R	L	Y	K	K	S
Template Known Secondary structure		T	T	S	B								T	T		S	S	T	T						T	T				S			S																	G	G	G							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.