Job Description P31441 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:47:32 GMT 2012 Rank 34 Aligned Residues 347 % Identity 21% Template c1rjqA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:d-aminoacylase; PDBTitle: the crystal structure of the d-aminoacylase mutant d366a Resolution 1.80 Å

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		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	A	D	Y	I	I	D	N	V	S	I	L	D	L	I	N	G	G	E	I	S	G	P	I	V	I	K	G	R	Y	I	A	G	V	G	A	E	Y	T	D	A	P	A	L	Q	R	I	D	A	R	G	A	T	A	V	P	G	F	I	D	A	H	L	H	I	E	S	S	M	M	T	P	V	T	F	E	T	A	T	L
Query Conservation
Alig confidence																																									.																																				.
Template Conservation																																									.																																				.
Template Sequence		P	F	D	Y	I	L	S	G	G	T	V	I	D	G	T	N	A	P	G	R	L	A	D	V	G	V	R	G	D	R	I	A	A	V	G	D	L	S	A	.	S	S	A	R	R	R	I	D	V	A	G	K	V	V	S	P	G	F	I	D	S	H	T	H	D	D	N	Y	L	L	K	H	R	D	M	.	T	P	K	I
Template Known Secondary structure			B	S					S	S					S	S	S												T	T									T	T	.	S		B	S						T	T										S	S				T	T						T	T		.
Template Predicted Secondary structure																																									.																																				.
Template SS confidence
		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.		.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80		.	.	.	.
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	R	G	L	T	T	V	I	C	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	I	V	N	V	M	G	E	A	G	F	A	W	F	A	R	C	A	E	Q	A	R	Q	N	Q	Y	L	Q	V	S	S	C	V	P	A	L	E	G	C	D	V	N	G	A	S	F	T
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	Q	G	V	T	T	V	V	T	G	N	C	G	I	S	L	A	P	L	A	H	A	N	P	P	A	P	L	D	L	L	D	E	G	G	S	F	R	F	A	R	F	S	D	Y	L	E	A	L	R	A	A	P	P	A	V	N	A	A	C	M	V	G	H	S	T	L	R	A	A	V	M	P	D	L	R	R	E	A	T
Template Known Secondary structure		T	T	T							S		T	T			S		S				S	S			T	T	G	G	G	G		S	S	S					S	S											S			S	S																	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		168	.	170	.	.	.	.	.	.	.							.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.				.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.										.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.																											.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.																											.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	E	Q	M	L	A	W	R	D	H	.	.	.	.	.	.	P	Q	V	T	G	L	A	E	M	M	D	Y	P	G	V	I	S	G	Q	N	A	L	L	D	K	L	.	.	.	D	A	F	R	H	L	T	L	D	G	H	C	P	G	L	G	G	K	E	L	N	A	Y	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A
Query Conservation												.	.	.	.	.	.																											.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.																											.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	D	E	I	Q	A	M	Q	A	L	A	D	D	A	L	A	S	G	A	I	G	I	S	T	G	A	F	Y	P	P	A	A	H	A	S	T	E	E	I	I	E	V	C	R	P	L	I	T	H	G	G	V	Y	A	T	H	M	R	D	E	G	E	H	I	V	Q	A	L	E	E	T	F	R	I	G	R	E	L	D	V
Template Known Secondary structure																			T								T	T	S	G	G	G	T	T											T						T								S		S	S	T	T																T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.											240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	I	E	N	C	H	E	S	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	E	G	R	R	K	L	Q	L	G	M	S	L	M	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	V	V	I	S	H	H	K	V	M	G	K	L	N	F	G	R	S	K	E	T	L	A	L	I	E	A	A	M	A	S	Q	D	V	S	L	D	A	Y	P	Y	V	A	G	S	T	M	L	K	Q	D	R	V	L	L	A	G	R	T	L	I	T	W	C	K	P	Y	P	E	L	S	G	R	D	L	E	E	I	A	A
Template Known Secondary structure							S					S	G	G	G	T	T	T													T	T	S								S		S										T	T	T	T	S	S								S	S		G	G	G	T	T		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		245	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.
															256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.					.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	S	A	A	R	N	L	N	A	L	A	P	L	I	N	E	F	N	S	P	Q	C	M	L	C	T	D	D	R	N	P	W	E	I	A	H	E	G	H	I	D	A	L	I	R	R	L	I	E	.	.	.	.	Q	H	N	V	P	L	H	V	A	Y	R	V
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	R	G	K	S	K	Y	D	V	V	P	E	L	Q	P	A	G	A	I	Y	F	M	M	D	E	P	D	V	Q	R	I	L	A	F	G	P	T	M	I	G	S	A	G	L	P	H	D	E	R	P	H	P	R	L	W	G	T	F	P	R	V	L	G	H	Y	S	R	D	L	G	L	F	P	L	E	T	A	V	W	K
Template Known Secondary structure			T	T	S											S																			S	T	T									T	T		S	S			T																	T		S	S								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		325	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.															.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	S	W	S	T	A	R	H	F	G	L	N	H	L	G	L	L	A	P	G	K	Q	A	D	I	V	L	L	S	D	A	R	K	V	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	Q	Q	V	L	V	K	G	E	P	I	D	A	Q	T	L	Q	A	E	E	S	A	R	L	A
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.
Template Sequence		M	T	G	L	T	A	A	K	F	G	L	A	E	R	G	Q	V	Q	P	G	Y	Y	A	D	L	V	V	F	D	P	.	A	T	V	A	D	S	A	T	F	E	H	P	T	E	R	A	A	G	I	H	S	V	Y	V	N	G	A	A	V	W	E	D	Q	S	F	T	G	Q	H	A	G	R	V
Template Known Secondary structure		T	T							T	T		T	T		S	S			T	T	S	B								T	.	T	T		B					S	S	S	T	T				B	S							T	T						T	T				S						B
Template Predicted Secondary structure																																.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.		.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.