Job Description P31441 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:47:32 GMT 2012 Rank 22 Aligned Residues 345 % Identity 21% Template c1gkpD_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:hydantoinase; PDBTitle: d-hydantoinase (dihydropyrimidinase) from thermus sp. in2 space group c2221 Resolution 1.29 Å

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		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.							100	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	I	I	D	N	V	S	I	L	D	L	I	N	G	G	E	I	S	G	P	I	V	I	K	G	R	Y	I	A	G	V	G	A	E	Y	T	D	A	P	A	L	Q	R	I	D	A	R	G	A	T	A	V	P	G	F	I	D	A	H	L	H	I	E	S	S	M	M	T	.	.	.	.	.	.	P	V	T	F	E	T
Query Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.																																																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.
Template Sequence		L	L	I	K	N	G	E	I	I	T	A	.	.	D	S	R	Y	K	A	D	I	Y	A	E	G	E	T	I	T	R	I	G	Q	N	L	E	A	P	P	G	T	E	V	I	D	A	T	G	K	Y	V	F	P	G	F	I	D	P	H	V	H	I	Y	L	P	F	M	A	T	F	A	K	D	T	H	E	T	G	S	K
Template Known Secondary structure												T	.	.	T										S	S	S	B						S	S					T	T							T	T	S													S	S				T	T				S
Template Predicted Secondary structure													.	.
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.			.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		106	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	L	P	R	G	L	T	T	V	I	C	D	P	H	E	I	V	N	V	M	G	E	A	G	F	A	W	F	A	R	C	A	E	Q	A	R	Q	N	Q	Y	L	Q	V	S	S	C	V	P	A	L	E	G	C	D	V	N	G	A	S	F	T	L	E	Q	M	L	A	W	R	D	H	P	Q	V	T	G	L	A	E
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	L	M	G	G	T	T	T	Y	I	E	M	C	C	P	S	R	N	D	D	A	L	E	G	Y	Q	L	W	K	S	K	A	E	G	N	S	Y	C	D	Y	T	F	H	M	A	.	.	.	.	.	.	.	V	S	K	F	D	E	K	T	E	G	Q	L	R	E	I	V	A	D	G	I	S	S	F	I	F	L	S
Template Known Secondary structure						T	T												T	T	S														T	T	T		S	S								.	.	.	.	.	.	.					S													T	T			B					S
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.								.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.			.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.												240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	M	D	Y	P	G	V	I	S	G	Q	N	A	L	L	D	K	L	D	A	F	R	H	L	T	L	D	G	H	C	P	.	.	G	L	G	G	K	E	L	N	A	Y	I	T	A	G	I	E	N	C	H	E	S	Y	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	E	E	G	R	R	K	L	Q	L	G	M	S
Query Conservation																																	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	K	N	F	F	G	V	D	D	G	E	M	Y	Q	T	L	R	L	A	K	E	L	G	V	I	V	T	A	H	C	E	N	A	E	L	V	G	R	L	Q	Q	K	L	L	S	E	G	K	T	G	P	E	W	H	E	P	S	R	P	E	A	V	E	A	E	G	T	A	R	F	A	T	F	L	E	T	T	G	A	T
Template Known Secondary structure		S	T	T	T	T	B																	T		B						S															T	T			S	G	G	G	T	G	G	G	S																				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.
		253	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.																																																		.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	M	I	R	E	G	S	A	A	R	N	L	N	A	L	A	P	L	I	N	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	P	Q	C	M	L	C	T
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	Y	V	V	H	L	S	C	K	P	A	L	D	A	A	M	A	A	K	A	R	G	V	P	I	Y	I	E	S	V	I	P	H	F	L	L	D	K	T	Y	A	E	R	G	G	V	E	A	M	K	Y	I	M	S	P	P	L	R	D	K	R	N	Q	K	V	L	W	D	A	L	A	Q	G	F	I	D	T	V	G	T
Template Known Secondary structure						S			S													T	T																G	G	G	G	G	S							T	T			S	S					T												T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		235	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.		.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Query Sequence		D	D	R	N	P	W	E	I	A	H	E	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	A	L	I	R	R	L	I	E	Q	H	N	V	P	L	H	V	A	Y	R	V	A	S	W	S	T	A	R	H	F	G	L	N	H	L	.	G	L	L	A	P	G	K	Q	A	D	I	V	L
Query Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																					.
Template Conservation
Template Sequence		D	H	C	P	F	D	T	E	Q	K	L	L	G	K	E	A	F	T	A	I	P	N	G	I	P	A	I	E	D	R	V	N	L	L	Y	T	Y	G	V	S	R	G	R	L	D	I	H	R	F	V	D	A	A	S	T	K	A	A	K	L	F	G	L	F	P	R	K	G	T	I	A	V	G	S	D	A	D	L	V	V
Template Known Secondary structure			B									G	G	G	S	S		G	G	G	S				B			T	T	T									T	T	T	S	S	S											T							T	T		T	T	T	S	S	S		S	T	T	S	B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.		.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Query Sequence		L	S	D	A	R	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	V	Q	Q	V	L	V	K	G	E	P	I	D	A	Q	T	L	Q	A	E	E	S	A	.	R	L	A	Q	S	A	P	P	Y	G
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.
Template Conservation
Template Sequence		Y	D	P	Q	Y	R	G	T	I	S	V	K	T	Q	H	V	N	N	D	Y	N	G	F	E	G	F	E	I	D	G	R	P	S	V	V	T	V	R	G	K	V	A	V	R	D	G	Q	F	V	G	E	K	G	W	G	K	L	L	R	R	E	P	M	Y
Template Known Secondary structure				T	T							G	G	G			S	S	S	S			T	T	T	T				S									T	T						T	T						T	T				B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		395	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.