Job Description P24230 Confidence 99.95% Date Thu Jan 5 11:41:25 GMT 2012 Rank 58 Aligned Residues 323 % Identity 15% Template c1z63A_ PDB info PDB header:hydrolase/dna complex Chain: A: PDB Molecule:helicase of the snf2/rad54 hamily; PDBTitle: sulfolobus solfataricus swi2/snf2 atpase core in complex2 with dsdna Resolution 3.00 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		264	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.			.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.
Query SS confidence																																																									.	.
Query Sequence		A	L	P	F	K	P	T	G	A	Q	A	R	V	V	A	E	I	E	R	D	M	A	L	D	V	P	M	M	R	L	V	Q	G	D	V	G	S	G	K	T	L	V	A	A	L	A	A	L	R	A	I	A	H	G	K	.	.	Q	V	A	L	M	A	P	T	E	L	L	A	E	Q	H	A	N	N	F	R	N	W	F
Query Conservation																																																									.	.
Alig confidence																											.	.																													.	.									.
Template Conservation																											.	.																																							.
Template Sequence		N	I	K	A	N	L	R	P	Y	Q	I	K	G	F	S	W	X	R	F	X	N	K	L	G	F	.	.	G	I	C	L	A	D	D	X	G	L	G	K	T	L	Q	T	I	A	V	F	S	D	A	K	K	E	N	E	L	T	P	S	L	V	I	C	P	L	.	S	V	L	K	N	W	E	E	E	L	S	K	F	A
Template Known Secondary structure		S		S	S																			T	T		.	.								T	T	S																T	T			S	S							S	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																											.	.																																							.
Template SS confidence
		439	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.			.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.		.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
		342	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.			.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.
Query SS confidence																																																				.	.
Query Sequence		A	P	L	G	I	E	V	G	W	L	A	G	K	Q	K	G	K	A	R	L	A	Q	Q	E	A	I	A	S	G	Q	V	Q	M	I	V	G	T	H	A	I	F	Q	E	Q	V	Q	F	N	G	L	.	.	A	L	V	I	I	D	E	Q	H	R	F	G	V	H	Q	R	L	A	L	W	E	K	G	Q	Q	Q	G	F
Query Conservation																																																				.	.
Alig confidence			.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.															.	.
Template Conservation			.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.
Template Sequence		P	.	.	H	L	R	F	A	V	F	H	E	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	K	I	K	L	E	D	Y	D	I	I	L	T	T	Y	A	V	L	L	R	D	T	R	L	K	E	V	E	W	K	Y	I	V	I	D	E	A	Q	N	I	K	N	P	.	.	Q	T	K	I	F	K	A	V	K	E	L	K
Template Known Secondary structure		T	.	.	T	S						S	S	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S			G	G	G	S	S										T	T						T										T	G	G	G	G	S		T	.	.	T	S								T	S
Template Predicted Secondary structure			.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.
Template SS confidence
		516			.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.										.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570			.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.
		420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	P	H	Q	L	I	M	T	A	T	P	I	P	R	T	L	A	M	T	A	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	D	L	D	T	S	V	I	D	E	L	P	P	G
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	K	Y	R	I	A	L	T	G	T	P	I	E	N	K	V	D	D	L	W	S	I	X	T	F	L	N	P	G	L	L	G	S	Y	S	E	F	K	S	K	F	A	T	P	I	K	K	G	D	N	X	A	K	E	E	L	K	A	I	I	S	P	F	I	L	R	R	T	K	Y	D	K	A	I	I	N	D	L	P	D
Template Known Secondary structure										S	S		S	T	T													S	T	T	T	T								T	T	T						T	T													T	T	T						T	T						T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		583	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.
		455	.	.	.	.	460	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	T	P	V	T	T	V	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	P	D	T	R	R	T	D	I	I	D	R	V	H	H	A
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	I	E	T	N	V	Y	C	N	L	T	P	E	Q	A	A	X	Y	K	A	E	V	E	N	L	F	N	N	I	D	S	V	T	G	I	K	R	K	G	X	I	L	S	T	L	L	K	L	K	Q	I	V	D	H	P	A	L	L	K	G	G	E	Q	S	V	R	R	S	G	K	X	I	R	T	X	E	I	I	E	E
Template Known Secondary structure																											T	T	T	T	T	T			T																		T	T		T						S				S	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		663	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																.
Query SS confidence																																																																.
Query Sequence		C	I	T	E	G	R	Q	A	Y	W	V	C	T	L	I	E	E	S	E	L	L	E	A	Q	A	A	E	A	T	W	E	E	L	K	L	A	L	P	E	L	N	V	G	L	V	H	G	R	M	K	P	A	E	K	Q	A	V	M	A	S	F	K	.	Q	G	E	L	H	L	L	V	A	T	T	V	I	E	V	G	V
Query Conservation																																																																.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	L	D	E	G	D	K	I	A	I	F	T	Q	F	V	D	X	G	K	I	I	R	N	I	I	E	K	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	T	E	V	P	F	L	Y	G	E	L	S	K	K	E	R	D	D	I	I	S	K	F	Q	N	N	P	S	V	K	F	I	V	L	S	V	K	A	G	F	G	I
Template Known Secondary structure				T	T	T								S																.	.	.	.	.	.	.	.	.		T								T	T	S																T	T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		743	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770										.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	P	N	A	S	L	M	I	I	E	N	P	E	R	L	G	L	A	Q	L	H	Q	L	R	G	R	V	G	R	G	A	V	A	S	H	C	V	L	L	Y	K	T	P	L	S	K	T	A	Q	I	R	L	Q	V	L	R	D
Query Conservation
Alig confidence																.					.	.	.
Template Conservation																.					.	.	.
Template Sequence		N	L	T	S	A	N	R	V	I	H	F	D	R	W	.	W	N	P	D	.	.	.	Q	A	T	D	R	V	Y	R	I	G	Q	T	R	N	V	I	V	H	K	L	I	S	V	G	T	L	E	E	K	I	D	Q	L	L	A	F
Template Known Secondary structure				T	T		S					S	S			.	S				.	.	.					T	T	T	T	T	T	T	T	S										T	T	S					T					T	T
Template Predicted Secondary structure																.					.	.	.
Template SS confidence
		815	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.		.	830	.	.				.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.